发布时间:2014-10-30 13:42 原文链接: OxfordNanopore发布新产品PromethION

  Oxford Nanopore似乎与ASHG(美国人类遗传学协会的年会)有着不解之缘。在ASHG 2012上,Oxford Nanopore展示了MinION的真机。在ASHG 2013上,它又宣布启动MinION的早期试用计划。而在今年的ASHG上,Oxford Nanopore揭开了其新产品PromethION的神秘面纱,并宣布了测序仪的一些更新。

  PromethION是一款平板电脑大小的台式测序仪,不过要比iPad大一些。这款仪器维持了MinION的简单易用、软件直观和极少样品制备,能够带来低成本、可扩展且长读取的测序,适合那些对流程灵活性有着更好要求的用户。

  纳米孔是以模块化的方式排列的,Oxford Nanopore称之为Nanopore cassettes。这些cassettes可根据需要来添加。你可以增加或减少流动槽的数量,而不需要让仪器满负荷地运作,以便维持每个样品的成本。

  流动槽设计意味着只需要少量样品。据介绍,几微升样品即可产生足够的数据。流动槽包含一排孔,其中每个孔都 有一个可独立寻址的电子通道。纳米孔就在这些孔的膜上,而单分子就是利用纳米孔分析的。Nanopore cassettes兼容多孔板,便于上样自动化和单次实验中多个样品的追踪。

  Oxford Nanopore还提出了一个“Run until”的概念。PromethION设备让用户能运行实验,直到获得足够量的数据,或有足够高质量的数据达到预设的实验终点。相比之下,其他分析系 统都有着固定的分析时间,在运行结束时带来一批固定的数据。在这种情况下,用户不得不设计实验,以满足仪器的性能。

  相反,通过利用纳米孔传感的性质和快速电子测定,用户能够指示PromethION,以监控其自身的数据输出,并寻找应用特异的结果。利用这些结果,用户可以实时地改变或优化仪器的行为,或在获悉实验完成后停止仪器。

  关于PromethION,还有个与众不同的地方,那就是Oxford Nanopore似乎将其核心软件从Windows转移到iOS系统。从官网以及展会上的图片可以看出,PromethION的分析系统似乎是iPad。 据悉,PromethION将在2015年年初启动早期试用计划。有意的读者请关注生物通的后续报道。

  Oxford的首席技术官 Clive Brown在会议上介绍了纳米孔测序仪的一些更新。他们提出了一种可编程的实时靶向测序方法(确切名称还不清楚)。比如,一个人希望从基因组的特定区域测 序,而不是其他区域。当reads通过纳米孔并测序时,比对部分序列,以找到它所在的区域。如果是感兴趣的区域,就让纳米孔继续测序。如果不是,纳米孔会 在特定孔上施加电势差,这样孔就会释放read,准备测序下一个read。这听上去是不是很神奇?那我们就拭目以待吧。

相关文章

我国学者在快速低成本基因测序方法研究方面取得进展

图基于卷对卷流体的新一代快速低成本基因测序技术在国家自然科学基金项目(批准号:22027805、22334004、22421002)等资助下,福州大学杨黄浩、陈秋水团队与华大生命科学研究院秦彦哲、章文......

因美纳、赛默飞、罗氏、Guardant、OxfordNanopore2025年Q2及上半年财报汇总

因美纳近日,因美纳公布了2025年Q2财务报告,公司Q2营收为10.6亿美元,与2024年同期的10.9亿美元相比下降3%;运营利润率为20.2%,non-GAAP运营利润率为23.8%。因美纳首席财......

降本提效!我团队研制出系列牛用基因芯片

记者21日从国家乳业技术创新中心获悉,该中心技术研发团队成功研制出奶牛种用胚胎基因组遗传评估芯片和“高产、抗病、长生产期”功能强化基因组预测芯片。该系列基因芯片具有完全自主知识产权,填补了我国基因芯片......

新突破!便携式测序设备助阵,2小时内可诊断脑肿瘤

英国研究人员在新一期美国《神经肿瘤学杂志》上发表论文介绍,他们新开发出一种超快速脑肿瘤基因诊断方法,可以将脑肿瘤的诊断时间从此前的6至8周缩短至2小时。这种脑肿瘤基因诊断方法由英国诺丁汉大学等机构的研......

重大突破!新加坡发布长读长RNA测序数据集SGNEx

由新加坡科技研究局基因组研究所领导的科学家团队,发布了迄今全球最大、最全面的长读长RNA测序数据集之一——新加坡纳米孔表达数据集(SG-NEx)。这一成果有望解决疾病研究中长期存在的技术瓶颈,使研究人......

猿类基因组测序为人类进化研究提供“里程碑”视角

经过20多年的努力,科研人员成功地对6种现存猿类的基因组进行了完整测序,为研究人类进化提供了近距离视角,这被英国《自然》杂志称为“遗传学的一个里程碑”。123名来自多个国家和地区的科研人员组成的团队9......

预算887.8万昆明医科大学第二附属医院2025年05月(至)2025年06月政府采购意向

昆明医科大学第二附属医院2025年05月(至)2025年06月政府采购意向为便于供应商及时了解政府采购信息,根据《财政部关于开展政府采购意向公开工作的通知》(财库〔2020〕10号)等有关规定,现将昆......

因美纳被制裁背后:一家测序巨头的中国困局

事件焦点:为什么是它?3月4日,中国将美国基因测序公司因美纳(Illumina)列入“不可靠实体清单”,引发行业震动。这家生产基因测序仪的公司看似低调,却是全球生物实验室的“水电煤”——它的设备几乎垄......

人转录组测序内参标准物质

通过转录组测序获得人的基因表达谱数据,能进一步挖掘疾病相关的生物标志物,为临床诊断提供依据。目前,由于转录组测序无法溯源,导致不同实验室及测序平台产出的数据可比性和测序结果的准确性面临挑战。中国计量科......

科学家测序动物界最大基因组

科技日报北京8月15日电(记者张佳欣)据最新一期《自然》杂志报道,德国康斯坦茨大学和维尔茨堡大学领导的国际研究团队,对动物界最大基因组的拥有者——肺鱼进行了基因组测序。肺鱼基因组约为人类基因组大小的3......