Duke大学的研究人员对HIV衣壳蛋白的关键区域进行了结构分析,即gp41的近膜端外部区MPER(membrane proximal external region)。文章于一月十三日提前发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志的网络版上。
为了控制HIV的传播,数十年来人们一直在尝试开发HIV疫苗,而这项新研究为此提供了宝贵的信息。
“开发HIV疫苗非常困难,主要是因为这种病毒特别善于躲避免疫系统,”文章的作者之一,Duke大学的Bruce Donald教授说。
在HIV病毒与宿主细胞融合的时候,会发生剧烈的结构变化。衣壳蛋白复合体是HIV上的突出结构,主要负责感染宿主细胞。长期以来,人们一直将这一复合体作为疫苗开发的靶点,特别是其中的gp41蛋白三聚体,以及与之紧密联系的gp120蛋白。
研究人员认为,gp41中的一个特殊区域(MPER)就是HIV病毒的致命弱点。“首先,这一区域相对保守,”文章的资深作者,Leonard Spicer教授说。在不同的病毒亚型之间,存在着相似的区域。对于像HIV这样多变的病毒来说,成功的疫苗必须能够作用于上述保守区域。“第二,MPER区域包含特殊的氨基酸序列,允许许多重要的广泛中和性抗体结合,”Spicer说。这些抗体能够在HIV患者体内与病毒结合,使其失活。
在HIV病毒与宿主细胞融合时,衣壳蛋白发生的转变至少有三个阶段。其融合前和融合后状态比较稳定,已经被人们深入研究过了。但衣壳蛋白真正与宿主细胞发生接触的中间阶段是动态的。正是由于这种不稳定性,人们一直难以用传统的结构分析技术进行研究,例如X射线晶体衍射和核磁共振技术NMR。
现在,研究人员通过蛋白工程、NMR和特殊软件解决了这一问题。文章的第一作者Patrick Reardon设计了包含HIV MPER的蛋白,该蛋白能够与细胞膜相互作用,模拟gp41在中间阶段的行为。这种蛋白足够稳定,可以用于结构分析。
在此基础上,研究人员捕捉到了MPER三聚体的近天然状态。不过对于该蛋白来说,还有比结构精确更重要的事,那就是能够与广泛中和性抗体结合。
“这项研究中最重要的,就是确保设计的蛋白能与相应抗体相互作用。结果我们成功做到了这一点,”Reardon说。最后,研究团队利用新软件进行数据分析,验证了他们获得的蛋白结构。
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