发布时间:2016-03-09 22:52 原文链接: PacBio推出小而强大的测序系统

  之前,人们一直在猜测Pacific Biosciences可能会推出小型的单分子测序仪,但PacBio从未给出肯定的答复。而在2015年9月的最后一天,PacBio给了人们一个惊喜,突然宣布推出Sequel测序系统。Sequel系统保留了SMRT技术的优点,与现有的PacBio RS II系统相比,通量更高,但试剂成本更低。

Sequel测序系统

  Sequel系统的核心是经过重新设计的SMRT Cell,它包含100万个ZMW(零模式波导),而PacBio RS II只有15万个。单个聚合酶被固定在ZMW中,以便实时观察和记录DNA测序。随着每个SMRT Cell的通量升高7倍,用户能够明显减少测序的时间和试剂成本,而前期的资金投入大约是之前的一半。Sequel系统的体积和重量大约是PacBio RS II的三分之一。由于它也是基于SMRT技术,故测序流程的许多方面都没有变化。

  PacBio的CEO Michael Hunkapiller博士表示,Sequel系统带来了SMRT测序的优点,包括长读取、均一覆盖和甲基化信息。Hunkapiller博士希望这能带来毛利率的提升,并更快实现盈利。

  同时,他也表示:“我们将继续支持PacBio RS II的客户,并不断引入样品制备、测序试剂和软件的改进,以扩展系统的性能。我们预计Sequel系统每年也会有类似的性能改进。此外,Sequel的结构允许通量的进一步扩展,通过改变未来SMRT Cell上ZMW的数量,可以针对特定应用来优化通量和操作成本。”

  Sequel系统能够快速经济地生成高质量、全基因组的de novo组装。它也能鉴定各种类型的基因组变异,包括短读取测序技术无法触及的复杂区域的变异,同时揭示表观遗传的信息。利用该公司的Iso-Seq操作,此系统也能生成全长转录组的数据。Sequel系统的通量增加,也促进了SMRT技术在宏基因组学和靶向基因测序中的应用。

  Sequel系统是PacBio与罗氏合作开发的,最终目标是制造出供临床使用的测序系统。根据此项协议,罗氏同意支付给PacBio总共4000万美元的里程碑付款。到目前为止,PacBio已获得了2000万美元,预计在2015年第四季度将获得剩下的2000万美元。据罗氏测序部门的负责人Dan Zabrowski介绍,这款测序平台将作为罗氏测序仪器的基础,最初用于临床研究,之后才用于体外诊断。

  PacBio计划第四季度开始在美国限量发售Sequel系统,并在明年年初开始扩大Sequel系统和新SMRT Cell的生产。之后才开始在美国以外的地区发售。部分Sequel仪器将提供给罗氏,以扩展其内部的分析开发计划。这台仪器目前仅供科研使用。

相关文章

降本提效!我团队研制出系列牛用基因芯片

记者21日从国家乳业技术创新中心获悉,该中心技术研发团队成功研制出奶牛种用胚胎基因组遗传评估芯片和“高产、抗病、长生产期”功能强化基因组预测芯片。该系列基因芯片具有完全自主知识产权,填补了我国基因芯片......

新突破!便携式测序设备助阵,2小时内可诊断脑肿瘤

英国研究人员在新一期美国《神经肿瘤学杂志》上发表论文介绍,他们新开发出一种超快速脑肿瘤基因诊断方法,可以将脑肿瘤的诊断时间从此前的6至8周缩短至2小时。这种脑肿瘤基因诊断方法由英国诺丁汉大学等机构的研......

重大突破!新加坡发布长读长RNA测序数据集SGNEx

由新加坡科技研究局基因组研究所领导的科学家团队,发布了迄今全球最大、最全面的长读长RNA测序数据集之一——新加坡纳米孔表达数据集(SG-NEx)。这一成果有望解决疾病研究中长期存在的技术瓶颈,使研究人......

猿类基因组测序为人类进化研究提供“里程碑”视角

经过20多年的努力,科研人员成功地对6种现存猿类的基因组进行了完整测序,为研究人类进化提供了近距离视角,这被英国《自然》杂志称为“遗传学的一个里程碑”。123名来自多个国家和地区的科研人员组成的团队9......

预算887.8万昆明医科大学第二附属医院2025年05月(至)2025年06月政府采购意向

昆明医科大学第二附属医院2025年05月(至)2025年06月政府采购意向为便于供应商及时了解政府采购信息,根据《财政部关于开展政府采购意向公开工作的通知》(财库〔2020〕10号)等有关规定,现将昆......

因美纳被制裁背后:一家测序巨头的中国困局

事件焦点:为什么是它?3月4日,中国将美国基因测序公司因美纳(Illumina)列入“不可靠实体清单”,引发行业震动。这家生产基因测序仪的公司看似低调,却是全球生物实验室的“水电煤”——它的设备几乎垄......

人转录组测序内参标准物质

通过转录组测序获得人的基因表达谱数据,能进一步挖掘疾病相关的生物标志物,为临床诊断提供依据。目前,由于转录组测序无法溯源,导致不同实验室及测序平台产出的数据可比性和测序结果的准确性面临挑战。中国计量科......

科学家测序动物界最大基因组

科技日报北京8月15日电(记者张佳欣)据最新一期《自然》杂志报道,德国康斯坦茨大学和维尔茨堡大学领导的国际研究团队,对动物界最大基因组的拥有者——肺鱼进行了基因组测序。肺鱼基因组约为人类基因组大小的3......

动物保护新动作,300多种反刍动物基因组将测序

据最新一期《自然·遗传学》杂志报道,由多个机构组成的国际“端粒对端粒(T2T)”联盟正在推进“反刍动物端粒-端粒”项目,旨在对300多种反刍动物的基因组进行测序。研究团队期望通过测序得到的基因组图谱,......

预测蛋白质序列的新AI模型问世

瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来......