发布时间:2019-08-02 22:57 原文链接: RNAi表达载体构建

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi)。siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子,能够以序列同源互补的mRNA为靶目标,降解特定的mRNA。RNAi的发现具有划时代的意义,它不仅深入揭示 了细胞内基因沉默的机制,而且它还是后基因组时代基因功能分析的有力工具,极大地促进了人类揭示生命奥秘的进程。现在越来越多的研究人员开始采用RNAi 来研究生物体的基因表达。RNAi技术可广泛应用到包括功能基因组学,药物靶点筛选,细胞信号传导通路分析,疾病治疗等等。

目前为止较为常用的5种制备siRNAs的方法包括

·         化学合成 

·         体外转录 

·         长片断dsRNAsRNase III 类降解 (e.g. Dicer, E. coli, RNase III)

·         siRNA表达载体或者病毒载体在细胞中表达siRNAs

·         PCR制备的siRNA表达框在细胞中表达

五种方法优缺点比较如下:

 比较项目

化学合成

体外转录

RNase III降解dsRNA

siRNA
表达载体

PCR
表达框

材料需求

 21-mer RNA
oligos(
一对)

29-mer DNA oligos(一对)

转录模版 (200-1000bp,两侧带T7 启动子)

55-60-mer DNA oligos(一对)

 ~50-mer DNA oligos(一对)

全部制备/合成时间所需时间

4—2

24 小时 + DNA oligo合成时间

 转录模版制备时间

5天以上 + DNA oligo合成时间

~ 6 小时 + DNA oligo合成时间

个人所需操作时间

几乎不需要*

中等

中等

中等

是否需要验证和寻找最有效siRNA

需要

需要

不需要

需要

需要

能否标记siRNA (例如用于荧光显微镜分析siRNA进入细胞过程或者在细胞中的定位)

不能

不能

转染的相对难易程度

可筛选性 (例如抗生素筛选)

 不可以

不可以

不可以

可以

不可以

能否用于长效抑制

不可以

不可以

不可以

可以(抗生素筛选)

不可以

能否大规模制备

可以

有限

有限

可以

有限

检测总体转染效率

不可以

不可以

不可以

可以

不可以

每个基因的相对费用(不包含人力)

中等