发布时间:2012-10-18 00:00 原文链接: Science医学:首个胃癌表观遗传图谱

  来自杜克-新加坡国大医学研究生院的研究人员在新研究中发现了大量由环境因素触发的胃癌新亚型。这项基于表观遗传学的新研究获得了对胃癌复杂性的新认识,有可能促成对这一仅次于肺癌的全球第二位癌症杀手更好的治疗策略。论文发表在10月17日的《科学转化医学》(Science Translational Medicine)杂志上。

  论文的领导者、杜克-新加坡国大医学研究生院Patrick Tan 博士说“胃癌是一种异质性疾病,对于相同的治疗患者个体常常显示出明显不同的反应。改善胃癌的临床结果需要有能够将患者细分为生物学上相似亚群的方法,从而为每个群体设计出亚型特异性治疗。“

  和许多的癌症一样,胃癌是由于遗传突变和影响基因运作方式的外部因子所造成。这些因子就称为表观遗传改变,通过甲基化来起作用。甲基化是指通过添加甲基团来修饰DNA的特异位点――CpG位点的一种化学过程。无需改变DNA序列,甲基化作用可导致某个基因的行为沉默。

  在他们的研究中,Patrick Tan和同事们利用240个原发性肿瘤和细胞系第一全面调查了胃癌DNA甲基化图谱。他们的目的是要鉴别出并非由主要基因突变,尤其是那些有可能用治疗靶向的突变,引起的胃癌新分子亚型。

  研究人员发现胃癌甲基化组(methylome)广泛分布,分析的CpG位点超过一半显示了癌症甲基化形式改变。许多的甲基化改变与基因表达显著改变相关,表明甲基化改变有可能在胃癌形成中具有功能重要性。

  研究人员还发现一种胃癌亚群具有极高水平的甲基化。这一CIMP亚群(CpG岛甲基化表型)从前就有人提出,但对于其临床意义仍不清楚。杜克-新加坡国大医学研究生院研究小组证实这种CIMP亚型与预后差的年轻患者相关联。他们还在实验室实验中证实这些肿瘤对去甲基化药物的敏感性有可能增高。

  Patrick Tan说:“我们的研究清晰明确地证实了这一亚群的存在和它的特征。更重要的,令我们感到受鼓舞的是测试这些CIMP肿瘤对于更有效的DNA去甲基化药物及其他可能的表观遗传药物的敏感性有可能具有潜在的功用。”

  新研究还揭示了大范围的表观遗传沉默区域,一些靶向广泛区域,另一些靶向单个基因。这一发现有可能帮助鉴别出甲基化事件在肿瘤形成中起作用的新基因。

  Patrick Tan说:“我们的结果强有力地证明了胃癌并不是一种疾病而是多种疾病的统称,每种疾病都具有不同的基本生物学和标志性的特征。如果胃癌是多个相互作用因子的结果,其中包括环境因子和宿主遗传因子,我们需要更好的途径来诊断和治疗它。”

  “这些结果推动我们前进,另外的工作将侧重于开发出在更早阶段检测胃癌的简单诊断测试,以及有可能高效对抗疾病不同分子亚型的药物和药物靶点,”Patrick Tan说。

相关文章

肠道微生物通过甲基化调控肌肉纤维类型转化

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)和佛山鲲鹏现代农业研究院研究员唐中林团队在国际期刊《肠道微生物》(GutMicrobes)上发表论文。该研究揭示......

新型植物RNA甲基化编辑工具研发成功

记者10月6日从华中农业大学获悉,该校棉花遗传改良团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。研究成果日前发表于《先进科学》杂志。N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物......

上海交大/浙大团队共同揭示“点燃”胰腺癌免疫微环境的表观遗传治疗靶点

近日,上海交通大学医学院附属仁济医院薛婧、王宇团队与上海交大基础医学院唐玉杰,浙江大学王超尘等国内外研究者合作在Gut期刊发表的最新研究成果,就揭示了经由内源性逆转录病毒元件(EndogenousRe......

稳定性与可塑性:细胞命运的“天平”

表观遗传指的是在不改变DNA序列的情况下,基因表达和生物性状的可继承变化。细胞命运决定包括细胞身份的维持和转换,这就涉及到表观遗传信息的继承性和可塑性,是生命科学领域的重点前沿方向。生命的"......

华南植物园关于植物DNA甲基化的调控研究获进展

DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分,可以通过改变染色质的结构、DNA的稳定性以及DNA和蛋白质的结合程度调控基因表达。在植物DNA甲基化的建立和维持过程中,植物特有的RNA聚合酶V(PolV)通......

驱动表观遗传重编程和分化机制确定

在《自然》杂志上最新发表的一项研究中,由斋藤通纪领导的日本京都大学人类生物学高级研究所团队,确定了人类生物学中驱动表观遗传重编程和分化机制的重要条件,这标志着人类体外配子生成(IVG)研究中一个新的里......

营养与健康所通过量化表观遗传时钟的随机成分阐明表观遗传时钟本质

近日,中国科学院上海营养与健康研究所AndrewE.Teschendorff研究组在《自然-衰老》(NatureAging)上,发表了题为Quantifyingthestochasticcompone......

驱动表观遗传重编程和分化机制确定

图片表示从人类原始生殖细胞样细胞(绿色)到人类有丝分裂前精原细胞(红色)的体外分化。科技日报北京5月23日电(记者张梦然)在《自然》杂志上最新发表的一项研究中,由斋藤通纪领导的日本京都大学人类生物学高......

遗传发育所揭示水稻RNA识别结构域蛋白抑制外源基因沉默的机制

植物是复杂的生物系统。植物体内基因的表达受到多种水平的调控,如转录水平、转录后水平、DNA甲基化/去甲基化等,从而对基因表达进行精密高效的调控。中国科学院遗传与发育生物学研究所张劲松研究组筛选OsEI......

度量衰老,科学家创建中国人复合DNA甲基化时钟

时间如梭,衰老是自然界不可抗拒的规律,但衰老的步伐并非一成不变——即使在同龄人之间,生理功能的衰退和器官老化的程度也存在显著差异。这些差异性说明个体的生物学年龄,即生理状态所反映的年龄,可能与其实际年......