北京大学数学及其应用教育部重点实验室于1989年建立，1994年成为原国家教委重点开放实验室，1995年通过了原国家教委世界银行贷款项目专家组的验收。实验室拥有一级学科博士授予权，涵盖全部数学学科；拥有全部四个数学二级学科的国家重点学科。在2004年和2009年教育部重点实验室评估中，连续两次被评为优秀类实验室。实验室下设4个分实验室和2个研究中心，包括：计算实验室、金融实验室、信息安全实验室、图像处理实验室、几何分析中心和信息技术研究与开发中心。实验室的研究内容涉及11个方向，包括：几何分析、低维拓扑与微分几何、动力系统、代数与组合数学、调和分析和偏微分方程、概率论、统计学、计算数学、信息科学、数学物理以及金融数学。 在国家科技部、教育部和北京大学的领导和大力支持下，实验室自成立以来，根据世界数学发展方向，瞄准国际一流目标，在科研体制改革、年轻数学家成长和前沿课题研究等方面都取得令人喜悦的成绩，为在新世纪把实验室建设成为国际一流的数学研究中心奠定了基础。目前，实验室主任为张平文教授，仪器设备管理员为胡旸高级实验师。 （信息更新时间为2014年12月26日）
| 实验室主任： 张平文 | 实验室主任电话： 62759851/62759826 | 实验室主任邮箱： pzhang@math.pku.edu.cn |
| 实验室副主任： 蒋美跃 | 实验室副主任电话： 62759434 | 实验室副主任邮箱： mjiang@math.pku.edu.cn |
| 仪器管理员： 胡旸 | 仪器管理员电话： 62759823 | 仪器管理员邮箱： huyang@math.pku.edu.cn |
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