满怀重铸浙大药学辉煌的希冀，在潘云鹤校长亲自运筹下，材料与化工学院11名教职员及30名研究生于2002年底成建制调出，重组浙江大学药学院，一个传承和弘扬求是创新文化的团队－浙江大学药物信息学研究所由此诞生。
秉承潘校长重托，本研究所从2003年初成立伊始就创新发力，奋勇拼搏，当年科研经费即达900万元，占全院的45％；发表SCI论文14篇，占全院的30％，成为推动药学院跨越式发展的强劲引擎。
本研究所现有教师及科研人员18名（其中，教授2人、副教授5人、副主任药师1人、高级工程师1人），博士后研究人员3名；承担培养我国药学和中药学两大一级学科高级专门人才的任务，招收药物分析学和药理学博士研究生，药学及中药学一级学科（含所有二级学科）硕士研究生，并接收博士后和国内访问学者；每年招收硕士生10~15人，博士生5~6人；现有在读研究生40余人，其中博士生18人（外国留学生1人）。
本研究所定位于建一流学科、育一流人才、创一流成果，以弘扬浙大药学昔日奋进精神为道，追求卓越，合和共进。
本研究所是浙江省重点学科（药物分析学）、浙江省中医药重点学科（中药化学）和重点实验室（中药制药工程）建设单位，并建有国家中医药科研三级实验室（最高技术等级）－计算机辅助中药分析实验室，拥有世界一流水平的分析仪器、分子生物学研究设备、大型计算机系统及制药工程实验装置。目前，研究所下设3个研究室：药物设计学与新药创制研究室、医药分析与临床药学研究室、工业药学研究室，并与医学院附属第一医院共建有临床药学研究中心。
本研究所科研力量雄厚，具有多学科交叉优势，专业背景涉及药学、中药学、制药工程、生命信息科学、计算科学、控制科学与工程、工业系统工程、生物化学工程学等多个学科；在药品质量控制技术、现代中药创制技术、中药制药技术及装备、药物分析信息学等方面研究水平处于世界前列，成绩卓著。
※研究所领导成员※
所长：程翼宇博士、特聘教授、博士生导师
副所长：瞿海斌博士、教授、博士生导师
副所长：范骁辉博士、副研究员、硕士生导师
党支部书记：邵青副主任药师
电话：0571-88208426/88208427/88208428/87951138
网址：http://pharminfo.zju.edu.cn/about.htm