发布时间:2019-06-13 15:34 原文链接: NatMethods:新技术能够准确指征肠道微生物的起源

  加州大学洛杉矶分校领导的研究团队已经开发出一种更快,更准确的方法来确定人体中许多细菌的来源。从广义上讲,该工具可以推断出任何微生物组的起源。

  与需要数天或数周的工具相比,新的计算工具“FEAST”可以在短短几个小时内分析大量遗传信息。该软件程序可用于医疗保健,公共卫生,环境研究和农业。该研究在线发表在《Nature Methods》上。

  微生物组通常包含数百至数千种微生物物种。人类的消化道、湖泊和河流,到处都可以找到微生物的存在。了解这些生物来自何处以及这些群落如何形成可以让科学家更详细地了解影响人类健康的微观生态过程。对此,研究人员开发了新型程序,为医生和科学家提供了一种更有效的工具来研究微生物的组成。

  有了这些信息,医生将能够通过简单地分析他们的微生物组来区分健康人和患有特定疾病的人。科学家可以使用该工具检测水资源或食品供应链中的污染。

  “微生物组已经与人体生理学和健康的许多方面联系在一起,但我们正处于了解微生物组的临床意义的早期阶段,”作者说道:“微生物组数据得到了前所未有的扩展,这使我们对微生物生命的各种功能和分布的了解迅速增加,尽管如此,如此庞大而复杂的数据集却带来了统计和计算方面的难题。”

  研究人员表示,与其他源跟踪工具相比,FEAST的速度提高了300倍,并且更准确。此外,目前的工具只能分析较小的数据集,或仅针对被认为是有害污染物的特定微生物。研究人员说,这种新工具可以处理更大的数据集,并提供更完整的微生物信息以及来源。

相关文章

微生物分离纯化

微生物:分离纯化含有一种以上的微生物培养物称为混和培养物(mixedculture)。如果在一个菌落中所有细胞均来自于一个亲代细胞,那么这个菌落称为纯培养(pureculture)。在进行菌种鉴定时,......

微生物培养

微生物:培养1、根据培养时是否需要氧气,可分为好氧培养和厌氧培养两大类。好氧培养:也称“好气培养”。就是说这种微生物在培养时,需要有氧气加入,否则就不能生长良好。在实验室中,斜面培养是通过棉花塞从外界......

青岛能源所等提出微生物组功能校正算法MetaApo

基于元基因组测序的微生物组功能分析和比较,在疾病诊断、生态监控、生物安全等领域具有应用价值,而高昂的成本限制了其更广泛应用。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心开发出微生物组功能校正......

微生物残体循环的环境和微生物控制

人们普遍认为,微生物残体碳是稳定土壤碳的主要组成部分,但其对碳稳定过程的控制因子尚不清楚。在稳定过程之前,微生物残体可能被微生物群落循环再利用。我们认为,这种再利用的效率是土壤碳稳定率的关键决定因素。......

河口湿地生物扰动的微生物响应特征研究中活进展

生态学研究普遍侧重于环境的时空变化对生物的影响。对于生物改变环境,尤其是生物扰动这种不存在直接营养关系的生态学研究关注较少。河口湿地底栖无脊椎动物分布广泛,数量大,其活动对湿地沉积物具有高频率和高强度......

苏建强研究团队在植物叶际微生物溯源研究获进展

植物叶际是人类居住星球上最重要的微生物储存库之一。在全球尺度下,叶际上栖息的细菌总数多达1026个,其中微生物密度在106至107个每平方厘米。植物叶际微生物是植物微生物组的重要组成部分,其在促进植物......

这家医院采购仪器设备建设P2实验室安图微生物质谱中标

分析测试百科网讯近日,汝南县人民医院综合救治能力提升及P2实验室建设项目一批医疗设备采购,其中标结果出炉,总中标金额超1200万元。本次采购的医疗设备涉及全自动微生物质谱检测系统、全自动尿液沉渣分析仪......

这家医院采购仪器设备建设P2实验室安图微生物质谱中标

分析测试百科网讯近日,汝南县人民医院综合救治能力提升及P2实验室建设项目一批医疗设备采购,其中标结果出炉,总中标金额超1200万元。本次采购的医疗设备涉及全自动微生物质谱检测系统、全自动尿液沉渣分析仪......

合肥研究院等开发出自然光驱动催化剂

近年来,抗生素的使用,使其在水体环境中泛滥,并引起大量耐药性微生物的繁衍,导致水体环境中抗生素和微生物污染加剧。中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员吴正岩课题组与东华大学教授蔡冬清合作,在......

利用地磁场上下穿梭驱动有氧无氧界面物质和能量循环

研究发现趋磁细菌可能是一类重要的微生物功能群,它们利用地磁场的定向作用,在有氧-无氧界面(OAI)中上下穿梭,将OAI上部有氧或微氧与其下部的厌氧环境联动起来,进而驱动碳、氮、硫和铁等在地球水生环境的......