发布时间:2017-12-14 17:32 原文链接: 【JOAT刘虎威编者按】专题:代谢组学和脂质组学

  刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。  

 

  近日,刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作,并撰写了题为“专题:代谢组学和脂质组学”的编者按。

  代谢组学已经成为发现新的生物标记物并增加人们对很多疾病机理认识的一种有价值的方法,而脂质组学是与代谢组学相关的研究领域中最热门的研究点之一,在过去的几年里引起了人们极大的关注。因此,本期特刊着重介绍代谢组学和脂质组学的分析方法,从而为我们的读者提供这些领域的最新进展。我们收集了8篇来自不同国家的优秀团队撰写的论文,内容涵盖了整个代谢组学的研究,包括方法开发、数据处理和应用实例。

  西班牙韦尔瓦大学的González-Domínguez 博士和同事们研究了基于直接注入质谱(MS)的代谢组学在血液样本分析中的应用。文中讨论了最重要的分析问题,包括样品处理、全面的指纹图谱,以及随后的代谢产物的鉴定和代谢轮廓的全表征。例如,简要综述了代谢组学平台在阿兹海默症研究中的应用。来自韩国延世大学的Moon教授综述了离线和在线流场流动分离联用质谱技术对血浆脂蛋白的分析以及自下而上和自上而下的方法过程。尽管这两种方法都旨在对脂蛋白体内的脂质定量,自下而上的方法所适用的脂质体较广泛,而自上而下的方法适用于快速的目标脂质分析。

  众所周知,脂质分子的分离和鉴定具有重要的意义,但由于存在许多脂质异构体的存在而非常具有挑战性。通过超临界流体色谱分离脂质异构体得到越来越多的关注,北京大学的白博士及其同事简要介绍了SFC的原理及其在脂类异构体分离中的应用。中国药科大学的丁博士课题组讨论了基质金属蛋白酶对肿瘤诊断的非侵入性检测与成像。结果表明,用于基质金属蛋白酶检测的探针一般具有两个特征。一个特征是在检测信号中处于off-then-on状态,另一个特征是检测基质金属蛋白酶的特异性保留。生物标记物探针设计理论与技术的发展,将有利于癌症的准确诊断和有效治疗。

  此外,中国科学院的税博士和同事们对基于非靶向液相色谱-质谱联用的代谢组学中的数据处理进行了总结,并简要介绍了原始质谱数据处理的一般步骤以及自动化的数据处理工具。然后,针对研究人员在进行代谢组学研究的考虑,比较了几种主要的免费数据预处理软件的特点。

  至于代谢组学的应用分析, 蔡教授的研究小组使用液相色谱-轨道阱质谱仪用于暴露于2,2′,4,4′-四溴联苯醚的小鼠血清中小分子代谢物的纹状体的轮廓分析。通过数据库检索和可靠的标准品确认识别了小鼠血清和纹状体中发生显著改变的57种不同的代谢物。在代谢变化的基础上,作者提出了包括多巴胺系统干扰、神经递质调节、DNA甲基化和氧化应激的分子机制。在过去的12年里,我的实验室对脂质组学在临床上的方法开发和应用方面做了一些努力。我们建立了一种连续正相/反相二维液相色谱-四极杆飞行时间质谱仪(NP/RP 2D LC/QTOF-MS) 方法用于对脂类进行轮廓分析,并且现在用于肝癌(HCC)患者和健康对照组血浆中脂质组学的研究。提出校正p值< 0.05和差异倍数> 1.5的23种脂类作为HCC的潜在的脂质生物标志物。另一方面,提出了通过一种新型正相超高效的LC/QTOF-MS方法分析动脉粥样硬化糖尿病患者血浆中的鞘脂类化合物,与之前的NP/RP 2D LC/QTOF-MS方法相比,此方法对鞘脂类化合物的分析时间短,有更好或相当的灵敏度。我们识别出了12种鞘脂类化合物,成功地分离出了葡糖神经酰胺和半乳糖神经酰胺的异构体。在这12个潜在的生物标志物中,我们发现是5-葡糖神经酰胺,而不是半乳糖神经酰胺,这表明不同于动脉粥样硬化途径和糖尿病途径,心血管疾病的引发可能存在与动脉粥样硬化相关的糖尿病之外的激活途径。

  最后,我对本期特刊的所有作者表示衷心的感谢,并感谢所有审稿人对所提交稿件的仔细审查。我们相信本期特刊的内容对我们研究代谢组学和脂质组学领域的读者大有帮助。《Journal of Analysis and Testing》这本新期刊将为发表分析化学基础研究以及应用领域的原创性研究论文、快速通讯和综述等提供一个国际化的学术平台。我们希望我们的同事们能够不断地分享我们的热情和远见。

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