布鲁克timsTOFProPASEF技术带您进入更深入的蛋白组学世界

　　分析测试百科网讯 由华质泰科生物技术（北京）有限公司主办，北京大学分析测试中心、西安交通大学分析测试共享中心、西北大学中草药现代化工程研究中心、广州分析测试中心协办的“2018年第五届中国原位电离质谱会议（AIMS2018）”于2018年4月27日在西安香格里拉大酒店召开。在“原位电离与组学及成像”论坛上布鲁克•道尔顿大中华区高级商业总监王克非博士带来了题为《timsTOF Pro PASEF技术带您进入更深入的蛋白组学世界》的报告。

布鲁克•道尔顿大中华区高级商业总监王克非博士

　　布鲁克•道尔顿大中华区高级商业总监王克非博士报告中讲到基于质谱的自下而上( Bottom-up)蛋白组学方法已经成为一种非常强大的蛋白鉴定和定量技术。在Bottom-up蛋白组学分析中，通常用蛋白酶将蛋白混合物酶解为肽段，然后通过液质联用进行分析。经过酶解后,一个蛋白将产生多个肽段,因此样品的复杂度会极度增加。受到当前质谱仪采集速度不够快、灵敏度不够好和分辨率不够高的制约，要覆盖如此复杂的样品中的全部蛋白是极具挑战性的工作。timsTOF Pro采用离子平行累积连续碎裂（PASEF）的采集方法，四级杆对离子的隔离与经过淌度分离后的离子的洗脱同步进行，从而带来>100Hz的数据采集速度。利用 PASEF的采集方法,低丰度肽段可以被多次选择进行碎裂,从而提升数据质量。因此 timsTOF Pro无与伦比的采集速度和提升的敏度,可以用更少的样品量实现蛋白组学更深度的覆盖。

布鲁克•道尔顿大中华区高级商业总监王克非会场照

　　会后分析测试百科小编采访了王克非，王克非从2015年开始负责布鲁克整个市场在中国的运营。负责的产品线包括LC-MS、GC、GC-MS 和ICP-MS；同时他还兼任布鲁克道尔顿化学与应用市场全球销售渠道高级总监。现任布鲁克•道尔顿高级商业总监,负责大中华地区的生命科学质谱业务。本科及硕士毕业于南京大学化学系、博士毕业于艾伯特大学化学系。

　　王克非表示，此次中国原位电离会议带来的“原位电离前沿基础进展与展望”和“原位电离与组学及成像”两个会场讨论效果都非常不错。蛋白质组学研究人员总是希望提高速度、灵敏度和定量能力，同时保持高分辨率、精确质量和真实同位素峰型的优势，从而可以深入地研究蛋白质组学。

　　“使用PASEF技术，科学家们现在无需权衡分辨率、扫描速度和灵敏度，他们可以通过TIMS前体离子选择获得高灵敏度、高扫描速度和无与伦比的特异性三重效果。这些特点的结合超出了非TIMS质谱仪的性能范围，为发现低丰度蛋白质提供了令人兴奋的可能性。我们采用的开放文件格式，以便客户直接使用原始数据，这将有利于蛋白质组学研究人员通过最先进的软件对基于PASEF技术的timsTOF Pro质谱仪上采集的数据进行分析和统计验证。”王克非说。

   timesTOF Pro的特点和优势

timsTOF Pro捕集离子淌度飞行时间质谱

　　更快的高分辨MS/MS

　　timsTOF Pro捕集离子淌度飞行时间质谱通过离子淌度（ion mobility）分离后，利用四极杆进行快速扫描，再送入碰撞室CID碰撞后，到TOF中进行高分辨的MS/MS测定。在整个LC-MS/MS流程中，每秒可以获得100-150张高分辨的MS/MS谱，且可保持40,000-50,000高的分辨率，达到业界最高的水平。

　　更灵敏

　　由于timsTOF Pro有更快的采集速度，在有些情况下，有些离子可以扫描多次，从而累积离子，获得更高的灵敏度，若以平均每个母离子扫描3次计，使灵敏度提高了3倍。

　　鉴定出更多的蛋白质

　　更快、更灵敏，在鸟枪法蛋白质组学中，最终带来的结果是可以在一次实验中，鉴定更多的蛋白质。比如，在200ng HeLa Digest（人宫颈癌细胞酶解物）样品中，可以通过90分钟的LC-MS实验，鉴定5,200多个蛋白质，达到业界最高的水平。

　　PASEF让timsTOF Pro如虎添翼

　　PASEF技术代表了一种革命性的创新，为鸟枪法蛋白质组学提供了更高的灵敏度和更快的速度，并且不损失质量分辨率。在鸟枪法蛋白质组中经常使用的基于傅立叶变换的质谱，存在扫描速度有限以及提高扫描速度时会降低质谱分辨率的问题。而现在PASEF技术解决了这个问题，凭借近100％的离子利用率，可以在母离子和子离子扫描过程中，在保持质谱超高分辨率的同时获得更高的灵敏度。

　　专有的timsTOF Pro系统使用通过捕获离子迁移光谱(TIMS)实现的PASEF，为鸟枪法蛋白质组学提供了行业领先的数据采集速度。 timsTOF Pro的独特双TIMS几何结合了TIMS设备中离子包的时间聚焦，意味着PASEF提供的速度优势同时提高了灵敏度和定量。所有这些在速度，灵敏度和定量方面的增益保持了Bruker的高性能QTOF质谱仪的优势，包括高质量分辨率(即使在最高数据采集速率下，分辨率为50,000 FWHM)，ppm精确质量和高同位素保真度(True同位素模式或TIPTM)。具有PASEF的强大的timsTOF Pro为科学家提供了深入细胞机器复杂生物学研究、发现低水平生物学重要蛋白质、在蛋白质翻译以及临床蛋白质组学研究中进行验证提供了有力工具。

　　关于Bruker

　　作为质谱技术的领导者，布鲁克公司质谱部门为您提供各种类型的先进质谱系统。我们服务的客户群分布广泛，包括制药、生物科技、蛋白质组学和分子诊断等领域里的生产企业、学术研究单位和政府机构等。我们还开发了微生物鉴定、农残筛查、毒物检测等一系列解决方案和软件产品，以最大化满足科研、工业生产及检测等领域快速增长的需要。请访问www.bruker.com

　　本文中提到的仪器产品

　　timsTOF 离子淌度-QTOF质谱仪 [参数价格，特点，询价，申请演示]

　　本文中所提到的厂商

　　美国布鲁克・道尔顿公司(Bruker Daltonics Inc.)