发布时间:2019-04-07 15:09 原文链接: 脂筏的分离和应用1


实验步骤

基本方案通过蔗糖梯度浮选 法 制备 去 污剂 抗 性的 膜 并 通 过免 疫 印 迹 对蛋 白质进行分析

材 料

细胞,贴壁或非贴壁

N E /P 缓冲液,单独或包含以下一种或多种组分:

1 % 、 2 % 或 5 % (W V ) TritonX-IOO

0.lmol/L 碳酸钠, pHll

5 % 、 3 5 % 或 8 0 % (m /V ) 蔗糖

60m m o l /L 辛基葡糖苷

T N E 缓冲液

去污剂相容的蛋白质检测试剂盒(如 Bio-Rad)

2 X 或 6 X S D S /样品缓冲液

丙 酮(可选),冰冷的

乙 醚(可选)

I O c m 的 组 织 培 养 皿(用于贴壁细胞)

22 G 针头

I m l 和 5m l 的注射器

S W 4 1 转子和超速离心管(B e c k m a n )

对于贴壁细胞,无需进行比较的细胞系

la. 将细胞铺于 2 个 I O c m 组织培养皿中,生长至细胞汇合。对 于 D R M 脂 质 分 析(见辅助方案3),则接种细胞至5 个 培 养 皿 或 1 0 个培养皿以定量磷脂酰丝氨酸、磷脂酰肌醇或含量稀少的神经节苷脂。

2a. 用 I m l 含 有 1 % 或 2 % Triton X -100 的 T N E / P 缓冲液置冰上裂解细胞20 min。如果有必要,在裂解缓冲液中加入0. lmol/L 碳酸钠, p H l l ,以便更好地定量D R M 脂类得率,提 高 D R M 脂质得率,或减少外周或细胞骨架蛋白与D R M 的结合。在分析 D R M 中的酶活性时,不能使用碳酸盐。

3a. 用细胞刮或橡皮刮将培养皿细胞裂解物刮下来,收于管中。

4a. 如果溶解缓冲液含有碳酸盐,将裂解液通过带 22 G 针 头 的 5m l 注 射 器 1 0 次(保持裂解产物低温)用于剪切 D N A ,以确保D R M 移至正确的梯度。

对于贴壁细胞,细胞间需进行比较的细胞系

lb. 如需比较两个不同的细胞类型间D R M 的丰度和得率,按照步骤Ia所示用培养皿培养不同细胞类型的细胞,对每种细胞另接种一个培养皿(以测定培养物的蛋白质含量),确保每个培养皿的细胞数相同。

2b. 用 5 ml T N E 缓冲液漂洗每种类型细胞的一个培养皿2 次 ,用 I m l 含 有 1 % TritonX -100或 者 0. lmol/L 碳酸钠的 T N E /P 缓冲液裂解细胞。将黏稠的细胞裂解物立即转 移 至 1.5m l 微量离心管内,并 通 过 22 G 针头连接的 I m i 注 射 器 1 0 次(或直到黏滞性消失)以剪切D N A 。然后以最大速度离心。

3b. 用去污剂相容的蛋白质检测试剂盒测定5〜IOul等份裂解物的蛋白质含量。将 T N E缓冲液与含有2 % 或 5 % Trit〇n X -100的 T N E 缓冲液混合,来制备含有足量TritonX -100的 T N E /P 缓冲液,使 用 去 污 剂 :蛋 白 质 为 10 : I (m /m ) 混 合 。为增加与脂筏结合较弱蛋白质的得率,使用去污剂:蛋白质为2 : 5 (m /m ) 混合。

4b. 加 入 I m l 含 有 1 % Triton X -IOO 的冰冷T N E /P 缓冲液至剩余的培养皿中,在冰上裂解细胞20 min,在裂解缓冲液中加入0.lmol/L 碳酸钠, p H l l ,以便更好地定量D R M 脂类得率,提 高 D R M 脂质得率,或减少外周或细胞骨架蛋白与D R M 的结合 。在分析 D R M 中的酶活性时,不能使用碳酸盐。按照步骤3a 所示操作;如果有必要,按照步骤4a 所示操作。

对于非贴壁细胞

Ic. 培养约5X 107个细胞,并 4°C , 200g离 心 5 min。如需进行细胞间的比较时,应使细胞(来源相同)数量相同。对于脂类分析(见辅助方案3),使 用 2X 108的非贴壁细胞。

2c. 用 5m l 冰 浴 的 T N E 缓冲液重悬细胞,重 复 洗 2 次 。

3c. 用 2m l 含 有 1 % 的 Triton X -100的 T N E /P 缓冲液在冰上裂解细胞20 min。在裂解缓 冲 液中加入〇.lmol/L 碳 酸 钠 , p H l l ,以 便 更 好 地 定 量 D R M 脂 类 得 率 ,提髙D R M 脂质得率,或减少外周或细胞骨架蛋白与D R M 的结合。在 分 析 D R M 中的酶
活性时,不能使用碳酸盐。

4c. 如果有必要,按照步骤4a 进行操作。

5 . 将裂解产物与含有8 0 % 蔗 糖的冰冷T N E /P 缓冲液混合。对于来自贴壁细胞的裂解物 ,需要上述加至培养皿中的裂解缓冲液总体积为1.25倍 体 积(即对于 步 骤 3a 或4b 收集的裂解物,加 1.25 ml)。对于非贴壁细胞的裂解物,加 2. 5m l 。完全混合并静置几分钟以便减少泡沫。

6 . 转移至一个或多个S W 4 1 超速离心管内,移去可能存在的泡沫。每管不超过5 ml。用冰冷的含有3 5 % 蔗 糖 的 T N E /P 缓 冲 液 6〜7m l 小心地覆盖到裂解物/蔗糖复合物上(分层应尽可能的宽),开始倒入液体时应注意观察以确保其可以浮在上层。如果没有浮起,则从微量离心管中移去混合物,并彻底混合。如果必要的话,加入少量的8 0 % 蔗糖。

7 . 用 含 5 % 蔗 糖 的 冰 冷 T N E /P 缓 冲 液 填 充 离 心 管 至 距 离 顶 端 约 3m m 。配 平 , 4°C ,l 〇0 00Qg 离心> 3 h (至 24 h)。

蛋白质梯度分布的检测

8a. 从底端分段收集梯度上的成分,每 份 收 集 lml。加 2 X 或 6 X S D S /样品缓冲液,通过 SDS-P A G E (单 元 12. 3 ) 和 免 疫 印 迹 法(单 元 12. 5 ) 分析其中 50〜100ul 组分。

对于无需免疫沉淀的免疫印迹

8b. 用 5m l 注 射 器 22 G 针头从离心管的顶端在 5%/35% 蔗糖交界处收集可见的条带置于 1 个 S W 4 1 超速离心管中。用 冰 冷 的 T N E /P 缓冲液稀释该膜成分,直到注满离心管。 4°(:, 100 00(^离心 111。

9b. 移弃上清液。用 100〜2 0 0 4 T N E /P 缓冲液移出沉淀物并移至一微量离心管内。用200ul T N E /P 缓冲液清洗超离心管 3 次 ,刮擦管底部以收集沉淀物碎片。将这些清洗液与沉淀物合并。

10b. 4°C ,最高转速离心 IOmin 以沉淀 D R M 。弃上清液。直接用 2X 或 6X S D S /样品缓冲液溶解 D R M ,通 过 SDS-PAGE (单元 12. 3 ) 和 免 疫 印 迹(单 元 12. 5 ) 进行分析。

对于低分子质量蛋白质

8c. 依步骤 8b〜IOb 制 备 D R M 沉淀物,不 用 S D S /样品缓冲液来溶解。加 I m l 冰冷的丙酮 至 D R M 沉淀物里,涡旋混勻,置 冰 上 孵 育 lOmin。 4°C ,最 高 转 速 离 心 lOmin,移弃丙酮。

9c. 在室温下加 I m l 二乙基醚至管内,涡旋混勻,如上述操作进行沉淀。移去醚并风干。用 2 X 或 6X S D S /样品缓冲液溶解 D R M 蛋白,以 S D S - P A G E (单 元 12. 3 ) 和免 疫 印 迹 法(单 元 12. 5 ) 进行分析。

免疫沉淀后的免疫印迹

8d. 依照步骤 8b〜IOb 制 备 D R M 沉淀物,不 用 S D S /样品缓冲液来溶解。用 I m l 含有1 % Triton X -IOO 的 T N E /P 缓 冲 液 溶 解 D R M ,置 37°C 孵 育 5 min,或 者 加 入 Iml含 有 60m m o l /L 辛(烷)基葡糖苷的 T N E /P 缓冲液,置冰上孵育 20 min。

9d. 4°C ,最高转速离心 5 min,以沉淀任何残存的不溶性物质。将澄清的可溶性 D R M移至新管,通 过 免 疫 共 沉 淀 试 验(单 元 12. 2 ) 回收目的蛋白,以 S D S - P A G E (单元 12. 3 ) 和 免 疫 印 迹 法(单 元 12. 5 ) 进行分析。

备 选 方 案 用 离 心 法 制 备 去 污 剂 抗 性 的 膜

附 加 材 料


在 S D S 中的溶解
3a 用 100ul 沉淀物裂解液重悬 Triton X -IOO的裂解沉淀。使混合物通过带22 G 针头的I m l 注 射 器(以剪切D N A ) 至均一。用 I m l 包 含 1 % Triton X -100的 冰 冷 T N E / P缓冲液进行稀释, 4°C ,最大速度离心 2 min,保留上清,弃去剩余的不溶性物质。

4a. 为 了 进 行 2 个组分的比较,用 2 0 % 的 S D S 储 存 液 将 初 始 的 Triton X -100 上清液(步骤 2 ) 调整至终浓度 0.1% S D S 。用 免 疫 共 沉 淀(单 元 12. 2)、 S D S - P A G E (单
元 12. 3 ) 和 免 疫 印 迹(单 元 12. 5 ) 对等量的 2 个组分进行分析。

在 辛 基 葡 糖 苷 中 的 溶 解

3b. 用 I m l 含 有 60 mmo l /L 辛 基 葡 糖苷的冰冷的 T N E /P 缓 冲 液 于 冰 上 重 悬 Triton X -100 裂解沉淀 20 min,以便溶解 D R M 蛋白。涡旋混勻, 4°C ,最高速 度 离 心 2 min,保留上清液并弃去沉淀。

4b 通过免疫沉淀(单 元 12. 2)、 S D S - P A G E (单元 12. 3 ) 和 免 疫 印 迹(单 元 12. 5 ) 等方法,对等量的该组分及原始的 Triton X -100 裂 解 上 清(步 骤 2 ) 进行分析。

辅 助 方 案 1 脉冲追踪方法分析去污剂抗性的膜蛋白

附 加 材 料


辅 助 方 案 2 通过放射性标记检测去污剂抗性的膜蛋白的全部组分

附 加 材 料

P B S ,无菌

无甲硫氨酸、包含透析血清的培养基(透析血清方法见附录 1 ; 用量取决于细胞类型)

[35S] 甲硫氨酸

1 . 在 I O c m 组织培养皿里接种贴壁细胞。如果有必要,将待测细胞接种于两个培养皿里 ,但是只对其中一个培养皿进行标记(对于非贴壁细胞,接 种 5 X 1 0 6 个细胞,离

辅 助 方 案 3 定 量 高 效 薄 层 色 谱 法(HP-TLC) 进 行 DRM 脂质分析

材 料

甲醇

氯仿

I : 1 和 2 : I (V /V ) 氯仿/ 甲醇

溶 剂 A : 30 : 60 : 8 (V /V A O 氯仿/甲醇/水

硅 焼 化 试 剂(Sigmacote, Sigma)

D E A E 葡 聚 糖 凝 胶(Sephadex) 混 悬 物(见辅助方案 4)

溶 剂 B : 30 : 60 : 8 (V 7V7 V ) 氯仿/甲醇/0• 8mol/L 乙酸钠

8 : 4 : 3 氯仿/甲醇/0. lmol/L 氯化钠

0.lmol/L 氯化钠

溶 剂 C : 3 : 48 : 47 (W V /V ) 氯仿/ 甲醇/0.lmol/L 氯化钠

溶 剂 D : 3 : 48 : 47 (V /V /V ) 氯仿/ 甲醇/水

氮气

反 相 C 1 8 柱(见辅助方案 5)

中性脂质标准品

酸性脂质标准品

乙酸

甲酸

己烷

异丙醚

脂类显影试剂

S W 2 8 转 子 和 超 速 离 心 管(Beckman)

带 Teflon 内衬盖子的 15m l 玻璃管

大 功 率(Laboratory Supplies,型 号 G S P 1T ) 或标准浴槽超声破碎仪

24m m Whatman G F /C 玻璃纤维滤器

过滤设备:玻璃微量分析过滤装置(Fisher) ,或以 橡 胶 垫 圈 插 入 125m l 侧臂烧瓶的 24m m Buchner 漏斗

带磨口玻璃瓶颈的 125m l 平底烧瓶和管子

旋转蒸发器

玻璃棉

一 次 性 IO m l 宽口玻璃移液管

玻璃棒

IO m l 硅烷化移液管

5m l 带 T e f lo n 内衬盖子的锥形玻璃管

带单孔瓶塞的 125m l 侧臂烧瓶

无荧光指示剂的 1 0 c m X 2 0 c m 髙 效 薄 层 色 谱(H P -T L C ) 板(Merck)

带玻璃盖的薄层色谱缸

预 热 至 l〇〇°C 、 110°C 、 180°C 的烤箱

改 良 的 IOjL d H a m ilton 注射器:带有斜切边缘的注射器,可将上样角度减少一半,有利于少量滴剂的上样

带磨口玻璃塞的 IOOm l 刻度量筒

剪成色谱缸大小的吸水纸

有冷却装置的吹风机

0.5 〜I c m 厚错块

光密度计

注 :所有接触 D E A E 葡聚糖凝胶的玻璃制品使用前均要硅烷化处理。玻璃棉装好后 ,把玻璃棉和柱子一同进行硅烷化处理。

1 . 准 备 1 0 瓶 I O c m 培养皿贴壁细胞的裂解产物(见基本方案,步 骤 Ia〜4a) 或 者 2 XIO8 个的非贴壁细胞的裂解产物(见基本方案,步 骤 Ic〜4c)。

2 . 利用蔗糖梯度浮选法制备 D R M (见基本方案,步 骤 5〜7)。从交界面处获取并离心收 集 D R M (见基本方案,步 骤 8b〜IOb) ,使 用 S W 2 8 而不用 S W 4 1 转子并且按比例增加体积。

3.D R M 沉 淀 中 加 入 I m l 甲醇,剧 烈 振 荡 至 沉 淀 悬 起 ,移 入 带 有 T e f l o n 内衬盖子的1 5 m l 玻璃管中。用 I m l 甲 醇 洗 2 次 ,将每一次的洗液合并入原管。再 加 入 3m l 氯
仿 ,随后加入 6 ml 1 : 1 (W V ) 甲醇和氯仿混合物。

4 . 应用高强度浴槽型超声破碎仪(推荐使用)或者标准超声破碎仪处理几秒。室温振荡孵育过夜。在真空中用 24m m Whatman G F /C 玻璃纤维滤器过滤到 125m l 侧臂烧瓶中。

5 . 用 IOml I : I (V7 V ) 甲醇和氯仿溶液冲洗过滤器。将溶液倒入一个适用于旋转蒸发器的带磨口玻璃瓶颈的 125m l 平底烧瓶中,用旋转蒸发器干燥。置 5m l 溶剂 A 中溶解脂质。

6 . 用玻璃棒将一小卷玻璃棉塞到一个 IO m l 宽口玻璃移液管的尖端。把柱子装在环状支架连接或者用夹子夹住。将 2 m l 硅烷化试剂注入移液管和玻璃棉。 5m l 甲醇冲洗并且确保玻璃棉没有沾在移液管内侧壁上。

7 . 用一只 IOm l 硅烷化移液管,向柱内加入足够量的 D E A E 葡聚糖凝胶以形成一个 2m l 柱床。用 10 倍柱体积的溶剂 A 填塞柱子。用巴氏移液管将溶解的脂质上柱。用 10 倍柱体

16.用 I : I (V /V ) 氯仿/甲醇溶解脂质。调整每个样品的浓度,预计上样量为 5〜20ul(每种脂质含量在 1〜7/xg) 。 试验几种浓度以确保有一种浓度在标准曲线范围内。

17.用改良的 10M1 Hamilton 注射器上第一个样品,在起始线的两个点之间点入一系列扩 散 至 5m m 宽的极小液滴。使溶剂短暂干燥后接着在前一样品上点入更小的液滴,持续点样直至所需的上样量。

1 8 . 将剩余样品上样,并选取合适的中性或酸性脂类对照,上 样 5 ul (含 1 〜 7ug脂质),将平板室温干燥 5m in 。 临用前在带磨口玻璃塞的 IOOm l 量 筒 中 配 制 70. 8m l 溶 剂 I :4 2 m l 氯仿、 1 8m l 甲醇、 7 . 2 m l 乙酸、 2 . 4 m l 甲酸和 1 . 2m l 蒸镏水。

19.在 T L C 缸中加入溶剂和吸水纸,使吸水纸饱和,立 即 以 玻 片 盖 住 并 以 重 物(如两个装满液体的 4L 水罐)压住防止挥发。将 点 有 样 品 的 T L C 平 板 放 于 T L C 缸 中 ,使起始位置处在缸底部,立即盖上并压上重物。

20.溶剂前沿泳动至距离平板底部 6 cm (到达事先用铅笔标记的位置)时 ,从缸中取出平板,风 干 15〜30 min。如果有必要也可用电吹风的冷风吹干。溶剂挥发期间可同时在带磨口玻璃塞的IOOml 量筒中配制 102m l 的溶剂体系 II: 65m l 己烧、 35m l 异丙 醚 和 2m l 乙酸。

21.在另一个 T L C 缸中加入溶剂和吸水纸,使吸水纸饱和,立即盖住防止挥发。当第一溶剂挥发后,将点有样品的T L C 平板放于 T L C 缸中。泳动至溶剂前沿到达平板顶 部(10c m )。从缸中取出平板,风 干 15〜30 min。将用过的溶剂丢弃,吸水纸彻底风干留作再次使用(可重复使用若干次)。

22.将平板浸于脂类显影试剂中,或者在通风橱中将该液体喷于板上,使其湿透。将其竖起流干液体至板的光泽淡去。

23.将平板置于预热 100°C 的烤箱中烘干 1 〜2m in , 待其颜色改变之前取出,然后放置于另一 1 8 0 °C 烘箱中的 0. 5〜I . O cm 厚铝块上干燥 5〜lO m in , 至颜色充分显现但尚未出现背景颜色时取出,冷却待用,如 需 要 保 存(可 达 24 h) ,则 应 以 旧 的 T L C 平
板(其上硅胶均已去除)覆盖,用塑料膜包裹住,保存于一 20°C 。

2 4 . 在 24 h 内以密度仪扫描色带,利用中性或酸性脂质标准品绘制标准曲线,将样品与适当的标准曲线进行比对测定。

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