电子显微镜(electron microscopy，EM) 简称电镜，经过五十多年的发展已成为生物学、医学、化学、农林和材料科学等领域进行科学研究的重要工具，是人类认识自然，特别是研究机体微细结构的重要手段，电镜技术已成为上述各领域研究工作者应掌握的一项基本技能。电镜的创制者鲁斯卡(E.Ruska)教授因而获得了1986年诺贝尔奖的物理奖。
与光镜相比电镜用电子束代替了可见光，用电磁透镜代替了光学透镜并使用荧光屏将肉眼不可见电子束成像。电子与物质相互作用会产生透射电子、弹性散射电子、能量损失电子、二次电子、背反射电子、吸收电子、X射线、俄歇电子、阴极发光和电动力等等。
电镜就是利用这些信息来对试样进行形貌观察、成分分析和结构测定的。电镜有很多类型，主要有透射电镜 (transmission electron microscope，TEM) (简称透射电镜)和扫描电镜 (scanning electron microscope，SEM) (简称扫描电镜)两大类。本文仅讨论在生物医学领域使用广泛的透射电镜和扫描电镜。
透射电镜和光学显微镜最基本的原理是相同的，显微放大过程基本相似，电镜的光路和部件术语基本一样。不同的是，电镜的照明源不是可见光而是电子束；透镜也不是玻璃而是轴对称的电场或磁场，电镜的总体结构、成像原理、操作方式等与光学显微镜有着本质上的区别。
一、基本结构
透射电镜由电子光学系统、真空系统和电子学系统三大部分组成。
(一)电子光学系统
电子光学系统即电镜的镜体，基本上是一个电子透镜系统，一端是电子源，另一端是观察和记录系统，中间是安装样品的装置(图19-1)。
1． 照明系统 由电子枪和聚光镜组成。其作用是为成像系统提供一个亮度高、尺寸小、高稳定的照明电子束。
电子枪是电镜的照明源，由灯丝阴极、栅极 (或称韦氏圆筒)和加速阳极组成(图19-2)。
聚光镜的作用是将来自电子枪的电子会聚到样品上，通过它来控制照明电子束斑大小，电流密度和孔径角。
2．成像系统 包括样品室、物镜、中间镜和投射镜（或两个中间镜或两个投射镜构成4～5个透镜系统）。
（1）样品室：室内有样品台，电镜的样品载于载网上，载网放在样品架(或称样品筒)上。
（2）物镜：其作用是形成样品的第一级放大像和通过调节物镜线圈的激励电流，相应地改变物镜的焦距从而对像进行聚焦。物镜是电镜的最关键部分，由它获得第一幅具有一定分辨本领的电子放大像。物镜中任何缺陷都将被成像系统其他透镜进一步放大。因此，电镜的分辨本领主要取决于物镜的分辨本领。
（3）中间镜和投射镜：中间镜的作用是把物镜形成的一次放大像或衍射花样投射到投射镜的物平面上，再由投射镜放大投射到荧光屏上而获得终像。
投射镜的作用是把中间镜形成的二级放大像再放大投射到荧光屏上，从而形成终像。
3．像的观察和记录系统 在投射镜下面是像的观察和记录系统。
在荧光下面是照相暗盒，它和电磁快门、曝光表组成像的记录系统，用于把终像拍摄记录下来。现代透射电镜一般还配备有CCD相机，实现数字化成像，结合相关的软件还可以进行图像的分析处理。
二、基本原理
(一) 分辨本领与放大倍数
分辨本领是指能够分辨物体上两点之间的最小距离。光学显微镜与电镜的分辨率相差达1000倍，因为光镜的分辨本领受到衍射效应的限制。当光线从一点出发透过显微镜时，所成的像不再是一点而是一个周围带有阴影的光斑。如果物体上两个质点靠得很近，所成的像就可能分辨不清。也就是说，光的波动性给光学显微镜规定了一个分辨本领的限制。光镜的分辨本领最终只能达到约为照明波长的0.4倍。
放大倍数是指物体经过仪器放大后的像与物的大小之比。放大了的像还可多次放大，但到一定限度后继续放大时便不能增加细节，这是分辨本领的限制所致。不能增加图像细节的放大倍数称为空放大，而与分辨本领相应的最高放大倍数称为有效放大倍数，为眼的分辨本领与仪器的分辨本领之比。
(二)电子波（束）特性
为了提高显微镜的分辨本领，就需要寻找波长更短的光波作照明。1924年法国学者德.布罗依(De.Broglie)等人创立了波动力学，提出了物质波的概念，指出高速运动的粒子不仅具有粒子性，而且具有波动性。这个假设不久就为电子衍射实验所证实。衍射是波动的特性，高速运动的电子能发生衍射，证明它是一种波。它具有波动所具有的共同特征量——波长、频率、振幅、相位等，并且服从于波动的规律。
(三)磁透镜的光学性质和聚焦原理
电镜实质上是电子透镜的组合。电子透镜有静电透镜和磁透镜二种。
磁透镜的聚焦原理：电子在进入磁场后受到磁场(洛伦兹力)作用，使电子束产生两种运动——旋转和折射，而电子在磁场中的旋转与折射是各自进行的。因此，在讨论磁透镜的聚焦作用时就可以暂不考虑电子的旋转，这样，电子在磁透镜的折射与光通过玻璃凸透镜的聚焦作用相似了。正如玻璃凸透镜可用于放大成像一样。磁透镜也能用于放大成像，而且还可以借用几何光学中的光线作图法与术语，如用焦点、焦距、物距、像距等概念来描述电子在磁透镜的运动轨迹。
三、超薄切片技术
透射电镜的成像是由一定强度的电子束透过标本而成像。由于电子射线的穿透能力比较低，电镜又具有很高的分辨率和放大率，因此, 电镜标本需要厚度在0.03～0.05μm的超薄切片，以获得高分辨的超微结构图像。
超薄切片制作过程包括取材、固定、脱水、渗透、包埋、聚合、切片和染色等几个环节。
（一）取材
取材是超薄切片技术的关键环节。由于生物组织离体后，细胞将会立即释放出各种水解酶引起细胞自溶，使细饱内部微细结构发生变化。因此，为尽可能避免产生人工假像，取材时有以下要求：
1． 取材要快，一般要求在1min内把组织块浸入固定液。
2． 组织块要小，一般切成0.5～1.0mm。
3． 所用固定液及容器须预冷，以降低离体细胞内水解酶的活性，尽可能减少细胞自溶。
4． 由于电镜观察视野小，具有很大的局限性，所以，选择部位要准确可靠。
5． 切割组织的刀、剪必须锋利干净，避免拉、锯、压等动作造成细胞损伤。
（二）固定
1. 固定的作用 标本固定在于：
①破坏细胞的酶系统，阻止细胞的自溶；
②稳定细胞物质成分，如核酸、核蛋白，糖类和脂类，使之发生交联，减少或避免抽提作用，以保存组织成分；
③在一些细胞组分之间以化学反应和物理反应建立交联，以提供一个骨架来稳定各种细胞器的空间构型；
④能提供一定的电子反差。
2. 常用的固定剂 理想的固定剂须具备的条件有：
①能迅速渗入组织细胞内，尽快固定细胞以减少组织自溶；
②能稳定细胞各种结构成分，使其在脱水、渗透及包埋等过程中不溶解和丢失；
③避免细胞结构膨胀或收缩，以保证获得真实结构的电镜图像；
④能保存酶的活性以供电镜细胞化学研究。目前尚未找到一种能满足上述全部功能的理想固定剂，较理想和常用的固定剂有四氧化锇、醛类、高锰酸钾等。
（1）四氧化锇 (Osmium tetroxide)俗称锇酸，为一种强的氧化剂，呈浅黄色结晶，其分子式OSO4，熔点41℃，沸点131℃，在水中的溶解度为7.24%(25℃) 。其水溶液为中性，有极大的毒性。
（2）戊二醛(glutaraldehyde)分子式为C5H8O2。市售的戊二醛通常是25%或50％的水溶液，其pH为4.0~5.0, 并保存在低温处, 且不宜存放时间过长。
（3）高锰酸钾是一种强的氧化剂，对磷脂蛋白类有特别良好的固定作用。可用于保护细胞的膜相结构，如细胞膜、内质网等。尤其是对神经髓质效果更为显著，但对于胞内的颗粒性或纤维状结构几乎不能固定。常用于植物叶绿体结构及神经纤维结构的研究。
3. 固定方法 目前，用于生物样品超薄切片技术的主要固定方法是化学固定法。采用戊二醛 (或戊二醛+多聚甲醛)固定l～3h后，经相应的缓冲液冲洗，再用1%锇酸后固定1～2h。
生物样品有多种多样，对于不同的材料和组织部位，其固定方式是不同的。
（1）浸泡固定：适用于一些能允许在短时间内停止供血而仍保持其功能和结构的器官或组织，以及一些病理检查的样品。其方法是经解剖 (或手术)尽快从机体中取出所需组织，并按取材要求，把组织切成小块，放入小瓶子内作常规双重固定。
（2）血管灌注固定：适用于取材较复杂或对缺氧较敏感的器官或组织，须采用血管灌注固定。可根据动物的大小选用全身灌注或局部灌注的方式。