发布时间:2019-10-28 15:19 原文链接: 微生物所等破解过氧化氢酶参与天然产物生物合成机制

  麦角生物碱类化合物最早于上世纪从真菌中分离得到,并广泛产生于多种曲霉和青霉,被誉为最重要的临床药用分子和天然毒素(图1A),在欧美市场上被广泛用来治疗癌症、偏头疼、产后大出血和帕金森症,FDA批准的上市药物有12种。研究表明,麦角生物碱结构中的Ergoline四元环是该类化合物的药效团,它与神经递质的结构比较类似,可以特异性结合人脑中的各种神经递质受体。自20世纪50年代以来,药效团Ergoline环中的C环生物合成机制一直是各国科学家的研究重点,在该领域发表了大量论文,前辈科学家的研究证明了EasC和EasE两个蛋白参与了C环的生物合成(图1B),但是具体的分子生物学与酶学机制仍然没有解析清楚。

  烟曲霉(Aspergillus fumigatus)可以产生麦角生物碱fumigaclavine C(图2A),并且其生物合成基因簇已经被报道。麦角生物碱化合物以色氨酸为起始,在途径合成的第一步酶(异戊烯基转移酶DmaW)和第二步酶(甲基转移酶EasF)催化下合成1。酵母和构巢曲霉中异源表达前四个基因(dmaW、easF、easE和easC),可以得到化合物2。但是体外从1到2是如何转化的却未见报道。中国科学院微生物研究所高书山课题组就这一悬而未决的科学问题展开了研究。

  生物信息学分析EasE是一个FAD依赖的氧化酶,研究者推测其为下一步的催化酶,于是在构巢曲霉中共表达dmaW,easF和easE三个基因,产生了一个新化合物4(图2B)。将4喂养烟曲霉ΔdmaW菌株,则修复了3的产生,证明4是途径中的中间体。同源蛋白序列比对发现,EasC与过氧化氢酶(catalase)中的小亚基家族(SSC)高度同源,但是又具有多个不同的保守氨基酸位点。聚类分析发现,EasC蛋白处于一个独立的分支。这些结果都表明EasC可能不仅仅具有过氧化氢酶活性。此外蛋白同源建模发现,该蛋白含有与SSC类似的heme和NADPH结合位点。因此研究者推测EasC在化合物2的合成中具有重要功能。于是,研究者将easC,dmaW,easF和easE基因共同表达于构巢曲霉中,HPLC分析发现产生了新化合物,NMR结构鉴定该化合物的确是化合物2。接着,研究者在大肠杆菌中纯化得到了可溶性的EasC蛋白,EasC可以在体外分解过氧化氢,验证了其过氧化酶活性。研究报道的过氧化氢酶和过氧化物酶均利用过氧化氢作为氧化剂,催化氧化还原反应的进行。但是研究者利用各种生化反应手段,包括反应体系添加或不添加过氧化氢、无氧催化、有氧催化、同位素标记(18O2和H218O)等,在体外发现EasC蛋白是利用氧气作为氧化剂,而不是过氧化氢,区域和对映体选择性催化两个非活化的sp3 碳形成C-C键,并推测了EasC的催化机制,完整地解析了临床重要药物前体四环麦角生物碱的中心碳环形成机制。

  本篇文章报道的过氧化氢酶EasC代表了一种全新类型的生物催化剂,它是自然界首个同时具有过氧化氢酶和单加氧酶活性的蛋白(图2B)。本项目解决了该类药物研究中半个多世纪以来悬而未决的难题,将为该类药物的工业菌株优化、代谢工程改造等研究打下坚实基础。该研究成果已在《美国化学会志》(Journal of the American Chemical Society)杂志在线发表,题为A Catalase Involved in Oxidative Cyclization of the Tetracyclic Ergoline of Fungal Ergot Alkaloids。微生物所助理研究员姚永鹏和博士后安春艳为论文共同第一作者,微生物所研究员高书山和加州大学洛杉矶分校教授K. N. Houk为共同通讯作者。该工作受到科技部重点研发计划、中科院先导专项、自然科学基金委面上和青年项目以及中科院青年促进会会员项目的经费支持。

图1:(A)麦角生物碱类药物;(B)中心碳环形成

图片.png

图2:EasC是一种全新类型的双功能酶

相关文章

首都科技条件平台生物医药领域中心院企对接会

——走进中科院微生物所分析测试百科网讯2020年8月7日,由首都科技条件平台生物医药领域中心主办的“首都科技条件平台生物医药领域中心走进中科院微生物所专场院企对接会”在中国科学院微生物研究所隆重举行,......

针对“新冠”,中科院微生物所有哪些进展

新型冠状病毒(2019-nCoV)疫情还在继续蔓延,作为我国最大的综合性微生物研究单位,疫情发生以来,中科院微生物所在做些什么呢?就此,《中国科学报》采访了该所领导和参与此次疫情防控狙击战的科学家。《......

微生物所:链霉菌聚酮类药物产量提升的高效策略

链霉菌以能够产生丰富的次级代谢产物而著称,这些次级代谢产物是微生物药物的重要来源。然而,链霉菌在长期的进化中获得合成次级代谢产物的能力,只是为了更好地生存(如与其它微生物竞争营养物质等资源),并不是生......

微生物所等破解过氧化氢酶参与天然产物生物合成机制

麦角生物碱类化合物最早于上世纪从真菌中分离得到,并广泛产生于多种曲霉和青霉,被誉为最重要的临床药用分子和天然毒素(图1A),在欧美市场上被广泛用来治疗癌症、偏头疼、产后大出血和帕金森症,FDA批准的上......

微生物所等破解过氧化氢酶参与天然产物生物合成机制

麦角生物碱类化合物最早于上世纪从真菌中分离得到,并广泛产生于多种曲霉和青霉,被誉为最重要的临床药用分子和天然毒素(图1A),在欧美市场上被广泛用来治疗癌症、偏头疼、产后大出血和帕金森症,FDA批准的上......

微生物所建立无痕迭代DNA组装新方法

DNA组装与DNA合成技术并称为合成生物学的两大基础使能技术。在合成生物学和生物工程领域中,“设计-构建-验证-学习(Design-Build-Test-Learn,DBTL)”的循环工程,精细的遗传......

微生物所创制出用于高效生物制造的“Y型人工菌群”

利用微生物将生物质原料转化为燃料、材料和化学品是生物制造领域的研究热点,其关键挑战是如何实现生物质中葡萄糖等六碳糖和木糖等五碳糖的同等高效利用。已经有很多研究尝试对单一菌株的代谢途径进行改造,或采用不......

微生物所研发出养殖废水处置关键技术实现中试示范

生猪集约化养殖已成为我国生猪养殖的主要方式,我国生猪养殖每年会产生大约20亿吨高浓度高氨氮高抗生素含量(COD2000-30000mg/L、氨氮200-1000mg/L、抗生素1-3mg/L)的猪场废......

微生物所揭示免疫细胞恶性转化机制

一些病毒感染可以直接诱导细胞癌变,例如小鼠白血病病毒(A-MuLV)感染可以使小鼠前B淋巴细胞发生癌变,进而导致小鼠白血病的发生,这类白血病与人类的Bcr-Abl阳性白血病的发生过程极为相似。因此,小......

微生物所在埃博拉病毒研究中取得重大突破

埃博拉病毒是引起人和灵长类动物发病且致死率很高的生物安全四级(BiosafetyLevel4)烈性病毒。据世界卫生组织统计,自1976年首次被发现至今,埃博拉病毒已经在非洲肆虐了近40年;2014年3......