甲状腺过氧化物酶（TPO）位于甲状腺上皮细胞的顶端细胞膜上，直接参与甲状腺细胞中的氧化、酪氨酸的碘化及酪氨酸的偶联等。它是甲状腺激素合成过程中的关键酶。近年来，通过免疫学、生物化学及基因重组研究，已证实TPO是甲状腺微粒体（TM）的主要成分。TPO也是自身免疫性甲状腺疾病（AITD）一种重要的自身抗原，可以刺激机体免疫系统产生抗TPO抗体（TPO-Ab）。TPO-Ab作为AITD一种重要的自身抗体，可通过激活补体、抗体依赖细胞介导的细胞毒作用和致敏的T杀伤细胞直接杀伤等作用机理，引起甲状腺滤泡损伤，间接的抑制甲状腺素的合成，导致甲状腺功能减退。TPOAb阳性提示甲状腺淋巴细胞浸润以及甲状腺细胞破坏。TPOAb滴度升高常预示甲状腺功能异常，即使是在自身免疫性甲状腺疾病的亚临床阶段。TPOAb除了在甲状腺疾病诊断中具有非常重要的意义外，近年来还发现它与数种器官特异性以及系统性自身免疫紊乱密切相关。
1 恶性贫血：TPOAb与恶性贫血显著相关。据统计，多达45％的TPOAb阳性者同时合并胃壁细胞抗体阳性，近50％恶性贫血患者可检出TPOAb阳性。约14％的恶性贫血患者合并原发性甲减，而且原发性甲减患者的恶性贫血发病率远高于一般人群。
2 糖尿病：自身免疫性内分泌疾病，尤其是1型糖尿病同时合并另一种自身免疫性内分泌疾病的概率很高。桥本氏甲状腺炎与l型糖尿病是最常见的组合．约20％～40％l型糖尿病患者合并桥本氏甲状腺炎。
3荨麻疹：TPOAb慢性荨麻疹的病情活动密切相关，目前研究认为慢性荨麻疹与甲状腺自身免疫疾病为关联性疾病，TPOAb并非参与了慢性荨麻疹的病理过程。而是TPOAb的滴度与机体免疫系统病理性激活的强度大致平行。可以反映机体非特异性免疫紊乱的程度。因此有学者建议，慢性荨麻疹患儿应定期检测TPOAb。
另外其他的一些自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、炎症性肠病等疾病中TPOAb的阳性率远远高于其他人群，这类病人合并甲状腺疾病的几率也较高，建议长期随访甲状腺功能。