张永振、石正丽团队分别发表文章报道武汉新型冠状病毒

　　2020年2月3日，上海公共卫生临床中心、复旦大学公共卫生学院张永振教授团队和中科院武汉病毒研究所石正丽教授团队分别在Nature上发表文章A new coronavirus associated with human respiratory disease in China和A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin，报道了此次武汉新型冠状病毒。

　　需要指出的是，张永振教授的文章是2020年1月7日Nature接收到，1月28日接受。石正丽教授的文章是2020年1月20日Nature接收到，1月29日接受。

　　张永振教授领导的团队从1名在武汉海鲜市场上的工作人员身上收取到了支气管肺泡灌洗液，鉴定出了一种新型病毒，利用测序技术确定了该RNA病毒的基因组（注：张永振教授是第一位公布该病毒序列的科研工作者，1月10日公布序列），并发现该病毒基因组与蝙蝠体内发现的SARS样冠状病毒有89.1%的相似性。该名工作人员于2019年12月26日在武汉一家医院住院，表现出呼吸系统疾病症状，包括发烧、胸闷和咳嗽。联合使用抗生素、抗病毒药和糖皮质激素进行治疗，但患者仍表现出呼吸衰竭，治疗三天后病情并无改善。

　　该研究得到的序列可在NCBI的SRA数据库中找到（BioProject登记号为PRJNA603194）。病毒完整基因组已存入GenBank，登记号为MN908947。

　　该文章经过Nicholas Loman等同行评审。Loman是英国伯明翰大学生物科学学院（School of Biosciences）教授，研究方向为微生物基因组和生物信息，目前H指数为45（2020年2月3日，Google Scholar）。

　　该文章曾于2020年1月25发表在预印版平台bioRxiv上。

　　石正丽团队分析了7例重症肺炎患者的样本，其中6人为武汉海鲜市场内的工人，该海鲜市场在2019年12月已首次发现病例。研究者发现在其中5名病人身上获取的全长度基因组序列彼此之间几乎完全一致（相似度超过99.9%），与SARS冠状病毒有79.5%的序列一致。此外，研究人员发现该病毒序列与一种蝙蝠冠状病毒在全基因组水平上相似度高达96%，表明蝙蝠可能是该冠状病毒的来源。同时，研究人员发现七个被鉴定和测序出的非结构性蛋白也存在于SARS冠状病毒中，表明该病毒是一种与SARS相关的冠状病毒，将其命名为新型冠状病毒2019（2019-nCoV），另外还确认了2019-nCoV进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样，即通过ACE2细胞受体（BioArt注：ACE2受体在2003年由李文辉博士等发现，见下图。李文辉博士现为NIBS资深研究员，2012年还带领团队鉴定过乙肝受体NTCP。）。

　　支撑该研究发现的测序数据可在GISAID中找到，登记号为EPI_ISL_402124、EPI_ISL_402127-402130以及EPI_ISL_402131。

　　该文章曾于2020年1月23日发表在预印版平台bioRxiv上（详见BioArt报道：特别报道 | 相似度96%，石正丽团队报道新型冠状病毒或来源于蝙蝠）。

　　附张永振教授部分工作简介

　　2016年11月3日，发表Nature文章Redefining the invertebrate RNA virosphere，从220个无脊椎动物中鉴定出了1445个RNA病毒。

　　2018年4月4日，发表Nature文章The evolutionary history of vertebrate RNA viruses，在多种脊椎动物中鉴定出了214个脊椎动物相关的病毒。

　　另外，除了Lancet开放冠状病毒相关论文外，Nature和Cell出版社也加入了这一队伍，开放了旗下所有杂志关于冠状病毒的文章的阅读权限。