核糖核酸酶（RNase）是非常稳定、活跃的酶，它们通常不需要辅因子就能发挥功能。由于核糖核酸酶难以失活，并且很小的量就足以破坏RNA分子，因此在没有事先消除任何可能的核糖核酸酶污染的情况下，不要使用任何塑料或者玻璃器皿。处理RNA时应非常小心，以避免在纯化的过程中或者纯化之后，将核糖核酸酶无意的引入到RNA样品中。为了创造并维持没有核糖核酸酶的环境，在预处理以及使用一次性和非一次性的器皿和溶液处理RNA时，一定要采取以下预防措施。
常规操作
处理RNA时，一定要使用合适的微生物学的无菌技术。手和灰尘颗粒可能会携带细菌和霉菌，是最常见的核糖核酸酶污染源。为了阻止来源于皮肤表面或者实验室器械灰尘上的核糖核酸酶污染，在操纵试剂以及RNA样品的时候，一直要佩戴乳胶手套或者乙烯基手套（PVC手套）。可能的情况下，要经常更换手套，并将试管处于关闭状态。当用移液管吸取溶液用于下游应用时，要将纯化过的RNA放在冰上。
为了去除工作台表面、非一次性塑料器皿和实验室器械（比如，移液管和电泳槽）上的核糖核酸酶污染，推荐使用市售核糖核酸酶去除溶液。也可以使用常见的实验室试剂去除核糖核酸酶的污染。为了去除塑料器皿上的污染，使用0.1 M NaOH, 1 mM EDTA洗涤，然后使用去RNase的水洗涤；如果塑料器皿具有耐氯仿性，则可用氯仿洗涤。为了去除电泳槽的污染，可使用去污剂清洁（比如，0.5%的SDS），使用去RNase的水洗涤，然后用乙醇洗涤（如果电泳槽具有耐乙醇性），之后晾干。
重要：在使用化学试剂时，一定要穿戴合适的实验工作服，一次性的手套，以及具有护目镜。请参考产品厂商提供的相应安全数据说明书（SDS），了解更多信息。
一次性塑料耗材
在处理RNA的时候，推荐使用无菌的，一次性的聚丙烯管。这些试管通常没有核糖核酸酶，因此不需要预处理使核糖核酸酶失活。
非一次性的塑料耗材
非一次性的塑料耗材在使用之前应该进行处理，以确保其不含有核糖核酸酶。塑料耗材应该严格的使用0.1 M NaOH、1 mM EDTA洗涤，然后用去RNase的水洗涤。具有耐氯仿性的塑料耗材可以使用氯仿洗涤，以使核糖核酸酶失活。
玻璃器皿
玻璃器皿在使用之前，应该进行处理，以确保其不含有核糖核酸酶。用于处理RNA的玻璃器皿在使用之前，应该使用去污剂清洁，严格的洗涤，并在240°C的烘箱中烘烤至少4小时（如果更方便的话，可以过夜）。也可以使用DEPC（焦碳酸二乙酯）处理玻璃器皿。使用0.1%的DEPC（0.1%的水溶液）充满玻璃器皿，在37°C的条件下过夜（12小时），然后使用高压釜处理或者加热到100°C 15分钟，以去除剩余的DEPC。
重要：在使用化学试剂时，一定要穿戴合适的实验工作服，一次性的手套以及护目镜。请参考产品厂商提供的安全数据说明书（SDS），了解更多信息。
电泳槽
电泳槽应使用去污剂（比如，0.5%的SDS）清洁，严格的用去RNase的水洗涤，然后使用乙醇洗涤，之后晾干。
重要：在使用化学试剂时，一定要穿戴合适的实验工作服，一次性的手套以及护目镜。请参考产品厂商处提供的相应安全数据说明书（SDS），了解更多信息。
重要：一些电泳槽使用的塑料不具有耐乙醇性，需要仔细查阅厂商说明书。
溶液
溶液（水或者其它溶液）应该使用0.1%的DEPC处理。DEPC是一种强大但非绝对的RNase抑制剂，它通过共价修饰RNase发挥作用。
重要：在使用化学试剂时，一定要穿戴合适的实验工作服，一次性的手套以及护目镜。请参考产品厂商提供的相应安全数据说明书（SDS），了解更多信息。