发布时间:2020-09-01 13:19 原文链接: vWFIII位点扩增片段长度多态性试验

【实验原理】
扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphisms,Amp-FLP)根据PCR技术原理,针对靶基因座的侧翼序列设计一对特异性引物,采用适当的PCR 反应体系和热循环条件,可扩增出该基因座等位基因。PCR 产物经电泳分离、显带后,杂合子为两条长度不等的片段,纯合子为一条片段。根据片段长度判定等位基因和基因型。
vWF III 位点是以TCTA 四个核苷酸为重复单位的短串联重复位点,位于vWF 基因第40内含子中。
【实验仪器】
Ependoff 管、微量加样器、台式离心机、PCR 扩增仪、电泳仪、电泳槽

【实验试剂】
1.引物(10umol/L) 2.Taq DNA 聚合酶(0.5U/ul)
3.10× buffer 4.dNTP(每种25mM)
5.无菌去离子水 6.液体石蜡
7.聚丙烯酰胺母液(T=30%,C=5%) 8.TEMED(四甲基乙二胺)
9.PAS(10%过硫酸铵) 10.TBE(1X, 5X)
11.尿素
12.上样缓冲液—0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,98%甲酰胺
13.固定液—10%冰醋酸
14.染色液—2g AgNO3,3ml 37%甲醛溶于2L 水中
15.显色液—60g Na2CO3,3ml 37%甲醛,400ul 12%硫代硫酸钠溶于2L 水中
【实验方法】
一、 PCR 扩增
1 PCR 扩增体系:无菌去离子水 8.5ul
10X Buffer 2ul
引物1 2ul
引物2 2ul
dNTP 1.5ul
Taq 酶 2ul
DNA 模板 2ul
总体系20ul(最后加模板),其中含有1.5mmol/L MgCl2,50mmol/L KCl,10mmol/L Tris
•HCl(pH8.4),dNTP 各187.5umol/L,Taq DNA 聚合酶1U,引物各1.0umol/L,模板DNA 50~100ng。

2.PCR 扩增条件:94℃预变性35sec;94℃变性45sec,58℃退火和延伸4min,30 次循环后于72℃继续保温8min。

二、 PCR 扩增产物的检测
聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染:
凝胶制备: 聚丙烯酰胺母液(T=30%, C=5%) 4ml
5X TBE 4ml
尿 素 8.4g
加水至20ml, 配成终浓度T=30%, C=5%的工作液。在工作液中加入200ul PAS 和20ul TEMED 充分混匀后迅速灌入凝胶模,水平放置30min 凝集后即制成聚丙烯酰胺凝胶。
电泳:将凝胶板置于电泳仪上,电极缓冲液为1X TBE,将加有1/5 体积上样缓冲液的PCR 扩增产物上样电泳,10W 电泳1h 左右停止电泳。
显谱: 200ml 固定液中固定30min。
蒸馏水洗3 次,每次3min。
200ml 染色液中染色30min。
蒸馏水快速冲洗凝胶一遍(20s 以内)。
加入200ml 显色液,5min 左右显色。
加入10%冰醋酸终止显色,水洗后凝胶干燥保存。
三、结果判读与分析
根据片段长度判定等位基因和基因型。杂合子为两条长度不等的片段,纯合子为一条片段。