发布时间:2020-09-07 16:14 原文链接: 哺乳动物细胞(mammaliancell)总RNA的分离2

3)于0℃以5000g离心10分钟沉淀RNA,弃上清,用含0.1mol/L 乙酸钠(pH5.2)的70%乙酸洗涤沉淀,用自动微量移液器尽可能将乙醇吸尽, 随后于室温放置几分钟,晾干沉淀。切勿抽干沉淀,因为干的核酸沉淀很难溶解。
4)每个直径为90mm的培养皿或每107细胞加 200μl 50mmol/L Tris.Cl( pH7.8)1mmol/L EDTA(pH8.0)溶液重溶沉淀。
5)分别按 10mmol/L和0.1mmol/L的深度加MgCl2和二硫苏糖醇(DTT),然后分别按1000单位/或10mmol/L 的终深度加台盘RNA酶抑制剂或氧钒核苷复合物。
6)加入无RNA酶的胰DNA酶I至终浓度为2μg/ml,混匀,于37℃温育60分钟。
7)分别按 10mmol/L和0.2%的终浓度加EDTA和SDS。
8)用等体积酚:氯仿抽提1次。
9)于室温以5000g离心10分钟使水相与有机相分相, 将水相吸至另一个离心管内,加3mol/L乙酸钠(pH5.2)至终浓度为0.3mol/L,加2.5倍体积用冰预次的乙醇,充分混匀,冰浴放置2小时。
10)用微量离心机于4℃以12 000g离心5分钟沉淀RNA。
11)吸出所有的乙醇,将打开管盖的离心管在实验台放置几分钟,让最后残存的痕量乙醇挥发干净。
12)用200μl TE(pH7.6)重溶沉淀,加500μl乙醇,于-70 ℃贮存备用。回收DNA时,只须取出1小份贮存液,加入3mol/L乙酸钠(pH5.2 )至终浓度为0.3mol/L,充分混匀,用微量离心机于4℃以12 000g 离心5分钟即可。
三、注意事项
1.测定最终所得溶液的OD260值可以确定RNA的浓度。取10μl乙醇/TE混合液[步骤13)] 离心沉淀RNA,以400水重溶, 测定OD260 值, OD260=1的RNA溶液每毫升约含40μg RNA。
2.如果需要,可用 oligo(dT) -纤维素层析法从所制备的细胞总RNA中纯化无寡脱氧核糖核苷酸污染的mRNA或购买试剂盒进行mRNA的纯化。

3.某些情况下(例如从感染了DNA病毒或用DNA转染的细胞中制备RNA时),必须从细胞总RNA中去除寡脱氧核核苷酸。否则,当用这种RNA构建cDNA库或进行引物延伸反应时应会出问题, 反转录过程中法染的模板DNA片段可能会与RNA杂交而充当引物,从而导致物定mRNA5’末端定位的错误或产生截短的 cDNA克隆。
a)步骤12后,加200μl 3mol/L乙酸钠(pH5.2),用自动微量移液器反复吹吸,以重悬核酸沉淀,将悬浮液移至另一个灭菌的微量离心管内。
b)用微量离心机于室温以12 000g离心10分钟,RNA沉于管底,而绝大部分寡脱氧核糖核苷酸仍在上清中。
c)弃上清液,用200μl TE(pH7.6)重溶沉淀。加入20μl 3mol/L乙酸钠(pH5.2),分混匀,加入550μl用冰预冷的乙醇。混匀溶液, 在冰上骤冷30分钟。用微量离心机于4℃以12 000g离主10分钟,以回收RNA。小心吸出上清。d)弃上清液,用 300μl TE(pH7.6)重溶沉淀,加1ml乙醇,-70℃贮存备用。
回收RNA时,只需取出1小份贮存液,加3mol乙酸钠(pH5.2 )至终浓度为0.3mol/L充分混匀,用微量离心机于4℃以12 000g离心5分钟即可。如需去除氧钒核糖核苷复合物,用含0.1%羟喹啉的苯酚[用0.01mol/L Tris.Cl(pH7.8)平衡]将RNA终溶液抽提数次即可。
4. 对大多数细胞株来说, 一个直径 90mm 培养甲中培养的RNA收率为100-200μg