CASMS分论坛：Topdown蛋白质组学和原位质谱新进展

　　分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在12日“New Advances in Top-down Proteomics and Native Mass Spectrometry”分论坛中，加州大学-洛杉矶分校Joseph A. Loo博士、俄克拉何马大学Si Wu博士、杜兰大学Xiaowen Liu博士、中山大学Huilin Li博士、密歇根州立大学兰辛分校Liangliang Sun博士、威斯康星大学麦迪逊分校Ying Ge博士带来精彩报告。分析测试百科网作为大会支持媒体，为您带来全程跟踪报道。

　　报告人：加州大学-洛杉矶分校Joseph A. Loo博士

　　报告题目：Towards Illuminating the Dark Matter of Mass Spectrometry for a Top-Down View of Native Protein Structures

　　原位描述电离事件之前溶液中分析细胞的生物学状态，蛋白质相互作用可以保留下来用于MSM测量，提供配体结合特性（化学计量比、结合亲和力）。

　　为了从上到下了解天然蛋白质的结构，Joseph A. Loo博士正在努力照亮质谱中的暗物质。报告介绍了结合Top-down 质谱 和原位质谱中多种有效的解离方法，经过磷酸化位点的ECD-MS/MS鉴定，发现ECD-MS/MS法定位配体结合位点，配体间的相互作用对电收缩/转移离解是稳定的，且配体结合位置一致。报告指出暗物质占宇宙物质的85%，是ca的主要来源，很难被探测到。串联质谱中的暗物质=未分配峰值，包括内部碎片离子。

　　报告人：俄克拉何马大学Si Wu博士

　　报告题目：High-throughput Quantitative Top-Down Proteomics

　　Top-down蛋白质组学可以更好地定性和定量描述完整的蛋白质组。高通量定量Top-down蛋白质组学目前的挑战表现在一个样本中有数十万种蛋白质，可用样品的有限尺寸（单电池TDP），疾病标志物的可靠定量表征。RPLC分离为复杂蛋白质样品提供高分离分辨率

　　报告介绍了二维RP/RPLC在线自动分离，第一个在线2D RPLC自上而下蛋白质组学在复杂生物样品上，如细胞裂解物。结果得到了良好的分离峰容量，在线2D提供与离线2D相当的结果，样本量减少100倍。

　　报告人：杜兰大学Xiaowen Liu博士

　　报告题目：EnvCNN: A Convolutional Neural Network Model for Evaluating Isotopic Envelopes in Top-Down Mass-spectral Deconvolution

　　报告介绍了Top-down质谱反褶积中用于同位素包络评估的ENVCNN、模型训练和测试以及与Ms-deconv评分函数的比较。

　　通过结合ENVCNN和数据库搜索，实现光谱数据应用：具有Ms deconv分数的TOPFD，TOPFD与ENVCNN。利用TOPPICT检索蛋白质组数据库，Tese可以增加蛋白质组鉴定。

　　报告指出评价同位素包络的CNN模型，ENVCNN优于Ms deconv评分函数，且使用ENVCN比Ms deconv分数进行更多光谱识别。

　　报告人：中山大学Huilin Li博士

　　报告题目：Understanding the Structural Basis of Allosteric Regulations of Glycogen Phosphorylase Complex Using Integrative Structural Mass Spectrometry

　　自然界中包含了许多用于控制细胞过程的通用策略，研究需要理解变构规则的方法。蛋白质结构中很难看到变构信号机制，这强调了需要开发方法来回答这些问题。

　　报告介绍了MS在结构生物学中的多样性和扩展性作用，磷酸化诱导的GP变构调节等。

　　报告人：密歇根州立大学兰辛分校Liangliang Sun博士

　　报告题目：Capillary Isoelectric Focusing-Mass Spectrometry for Denaturing and Native Top-Down Proteomics

　　毛细管等电聚焦（cIEF）具有功能超高分辨率蛋白质分离（Apl:0.001）、同时浓缩和分离分析物、高样本装载能力（UL）、蛋白质组的精确pl信息。

　　报告介绍了完整蛋白质的cLEF-MS分析、电动泵鞘层流CE-MS接口、大肠杆菌TDP的自动cLEF-MS/MS分析、斑马鱼雄性和雌性大脑的定量TDP等。

　　报告指出cLEF MS是表征单克隆抗体电荷变体的有力工具，高分辨率分离、自动化操作比传统使用的cLEF UV更好地识别电荷变体。未来需要进一步提高稳定性和分离分辨率。

　　报告人：威斯康星大学麦迪逊分校Ying Ge博士

　　报告题目：New Strategies in Top-Down Proteomics for Precision Medicine

　　组学技术是精确医学的促成力量，用高分辨率Top-down质谱揭示蛋白质组的复杂性，在翻译后修饰（PTM）中具有优势。报告介绍了一种用于Top-down蛋白质组学的光解表面活性剂（Azo），Azo作为Top-down和Bottom-up蛋白质组学的一体式Ms兼容表面活性剂。报告还介绍了偶氮激活的细胞外基质（ECM）蛋白质组学、完整单克隆抗体的在线HIC-MS/MS分析、完整单克隆抗体的在线ECD-FTICR-MS/MS表征等。

　　实验表明纳米蛋白质组学使精确医学的全面分析成为可能。

　　关于New Advances in Top-down Proteomics and Native Mass Spectrometry的演讲人介绍，请见：http://www.casms.org/?action=content&id=54