mBio：揭秘新型冠状病毒

　　今年早些时候，首先出现在沙特阿拉伯的一种新型冠状病毒已经陆续导致三人致病，其中一人死亡。这无疑又给全球医疗卫生机构敲响了警钟。十一月二十日美国微生物学会旗下的mBio杂志发表了一项新研究，将这种新型病毒与蝙蝠体内的病毒联系起来。研究人员对HCoV-EMC/2012病毒进行了测序研究，分析了该病毒与其他病毒的关系及其潜在来源。这一测序分析的结果将有助于人们对这一新兴病毒进行治疗。

　　“该病毒与亚洲蝙蝠体内的病毒亲缘关系最近，与已知人类病毒并不相关。”该研究的领导者，荷兰Erasmus医疗中心的Ron Fouchier说，“因此，我们推测它来源于动物。”

　　早前感染这一新病毒的60岁沙特阿拉伯老人，经历了急性肺炎和肾衰竭并最终死亡，这不禁让人们联想起了以往的冠状病毒疫情，2002年SARS病毒最终导致超过900人死亡。在此之后，又有两位患者受到了类似病毒的感染，自此HCoV-EMC/2012病毒引发了人们的高度关注。

　　目前，其中一位卡塔尔患者正在伦敦一家医院接受治疗。研究人员对这位患者体内的病毒进行了全基因组测序，并于11月13日完成。Fouchier指出，这一病毒与他研究中的HCoV-EMC/2012病毒非常吻合，只有99个单核苷酸差异。

　　“在整个基因组中99个核苷酸差异意味着0.3 C 0.4%的差异，很明显它们属于同一种病毒，”Fouchier说，“这也带来了新问题。”另一位沙特阿拉伯患者也被认为受到这种新病毒感染，不过其病毒基因组测序还未完成。

　　该研究中HCoV-EMC/2012病毒基因组测序达到了90%的覆盖度，并且通过传统Sanger测序进行了验证。研究人员通过进化分析，将该病毒分入 Betacoronavirus属，在已测序的病毒中与它亲缘最近的是BtCoV-HKU4和BtCoV-HKU5，这两种病毒分别分离自亚洲的扁颅蝠 Tylonycteris pachypus和普通伏翼蝠Pipistrellus abramus。HCoV-EMC/2012与BtCoV-HKU5病毒序列只有77%的相似度，这样的差异使其完全有资格被称为新型病毒。

　　此前一项沙特阿拉伯的血清学研究显示，医院中2,400名患者体内均不含有该病毒相应抗体，再加上HCoV-EMC/2012病毒与蝙蝠病毒相似性较高，Fouchier认为这种病毒才刚开始感染人类，鉴于沙特阿拉伯及邻近国家均有伏翼蝠出没，这次病毒感染的源头可能就是蝙蝠。

　　研究人员指出，在伦敦接受治疗的患者所携带的病毒与HCoV-EMC/2012关系很微妙，二者有足够的相似性说明它们属于一种病毒，它们之间又存在足够的差异性暗示二者并非来自同一个感染源。

　　该研究除了有助于探明新病毒来源及其与疾病的关系，还能帮助人们对这类病毒进行深入研究，例如可以人工合成病毒基因组，在实验室内构建病毒，以研究其毒力来源。同时一个注释良好的基因组将为人们提供很大帮助，来开发合适的诊断治疗方法并生产相应疫苗。