当多种原因引起前列腺管和腺泡发生扩张或前列腺液淤积时，可以造成脱落的上皮细胞与囊腔内的淀粉样小体（前列腺凝集体）及分泌物聚集在一起，如果逐渐有钙盐沉积就会形成钙化。尿液反流所致的化学性前列腺炎更易造成钙化形成。前列腺钙化的病因目前仍不明确，可能与前列腺组织退行性变、慢性前列腺炎、前列腺液潴留、前列腺经常处于充血状态、前列腺管狭窄、钙磷代谢紊乱和社会心理等因素有关。一般认为，年龄40岁者与前列腺增生密切相关。
现有研究表明，前列腺内存在的纳米细菌感染可能导致前列腺钙化的发生，而前列腺钙化可能造成前列腺炎的治疗困难和易复发。但是三者间确切的关系需要进一步的相关研究证实。