根据藻类细胞在地衣体内部的分布情况，通常在结构上，将地衣分为2种类型：
1、 异层地衣：藻类细胞聚集在上皮层之下，形成1层明显的藻胞层。髓层介于藻胞层和下皮层之间，由一些疏松的菌丝构成。髓层中没有或只有很少的藻细胞。这样的构造称为“异层地衣。梅衣属（Parmelia）和蜈蚣衣属（Physcia）。
2、 同层地衣：在横切面上，上皮层之下没有明显的单独的藻胞层结构，藻细胞在髓层菌丝中均匀地分布。这样的构造称为“同层地衣”。如猫耳衣属（Leptogium）。
