本病的发病机理尚不清楚。由于这些合成酶抗体的抗原成分是由蛋白及与之相结合的tRNA组成，在催化细胞中游离氨基酸与相应tRNA结合、并以mRNA为模板形成多肽中发挥了重要作用。临床研究还发现，抗合成酶抗体的滴度和疾病的严重程度有密切关系，随抗体滴度的增高而病情加重，病情缓解期滴度明显下降。故推测抗合成酶抗体可能是引起组织损伤的直接因素，其作用机理包括直接结合靶抗原，交叉反应和激活补体，最终引起免疫炎性反应。另外，遗传学研究发现，该综合症与DRW52和DR3相关。
