已得到鉴别的胸苷激酶可分为两大类 ：
一类存在于疱疹病毒与细胞胸苷激酶类似；
一类广泛存在于脊椎动物，细菌，T4噬菌体，痘病毒，非洲猪瘟病毒（ASFV）和鱼淋巴囊肿病毒（FLDV）。昆虫虹彩病毒衣壳蛋白也属于此类。
只确认了细胞胸苷激酶的蛋白位点模型。
