研究者发现，正常情况下肝脏能灭活来自肠道的各种毒素、细菌、真菌等。当肝脏发生疾病时，肠道微生态会显著变化，大量的毒素、细菌等进入血液无法被清除，导致肠道屏障功能受损，从而激活机体免疫系统，引起异常免疫反应，加快肝细胞凋亡、坏死。在肠黏膜屏障功能受损、肠道通透性增加以及肠菌群过度生长的情况下，这些细菌及产物会大量通过门静脉系统进入肝脏，激活肝脏的非特异性免疫系统，产生大量的炎性细胞因子和趋化因子，引起或加重肝脏的炎症反应，甚至导致肝硬化、肝癌的发生。鉴于肠道菌群的EHC在肝脏疾病中的特殊作用，益生菌正成为治疗肝脏疾病的新途径。