耐药性结核病的产生主要是在治疗过程中人为因素造成。国家结核病控制规划(NTP)的覆盖率、可及性及其服务体系中各环节的质量(特别是抗结核药物的质量、使用的合理性及治疗过程的有效管理)决定该国耐药性结核病的流行状况。我国2010年的结核病控制规划(NTP)的覆盖率已达95%。
1. 结核病控制规划覆盖率及可及性:我国的国家结核病控制规程是以现代结核病控制策略(DOTS策略)为基础，结合我国的具体情况制定的，但其尚未覆盖到每一个服务对象，未能为每一个服务对象提供可及的良好结核病诊疗服务，这是导致耐药性结核病上升的重要原因。
2. 滥用抗结核病药物:某些重要的一线抗结核药物，尤其是异烟肼和利福平被作为抗菌素或广谱抗菌素单独使用的现象在我国仍普遍存在。在初治患者中滥用氟喳诺酮类抗结核药物也应引起高度警惕，二线药物耐药将导致更多的耐药性结核病患者难以治愈，造成耐药性结核病的进一步蔓延。
3.化疗方案不合理，用药不规则:未能合理使用抗结核药物是产生获得性耐药性结核病的最主要原因，单用药和不合理的联合用药是其主要表现形式。未经专门培训的医疗服务提供者可能不理解化疗原则和有效化疗方案的组成，任意组合抗结核药物，甚至单用抗结核药物，频繁的更换方案；对药物引起的毒副反应不能给予正确及时处理，盲目停药、换药；把患者已产生耐药、药物浓度低或生物利用度差的抗结核药与另一种抗结核药联用；在患者治疗效果差时不断加人单一药物等。这些做法不但导致获得性耐多药的产生，反过来又加剧了初始耐多药的发生，造成恶性循环，成为导致获得性耐药性结核病产生的首要人为因素。治疗效果不佳的复治化疗方案可造成开始复治时已耐药的患者继续传播结核病，甚至是多耐药性结核病，应引起足够的重视。
4.药物质量不到位:生物利用度反映了药物进人患者体循环的药量占口服剂量的构成比。空腹口服异烟阱和利福平，或服药后禁食3小时，多能保持这两个药物的生物利用度处于最佳状态。药物的装量、含量和生物利用度不合格，服药方法不正确，均可直接导致患者得不到足量有效的抗结核药，形成实质上的不合理用药。
5.患者的顺应性问题:缺乏足够的结核病相关知识，就业、失业压力，婚姻传统和社会歧视，免费政策范围外的辅助检查和诊断费用，毒副反应处理不及时等，均会影响患者的顺应性，有时还会造成患者隐瞒病情自行乱用药，不仅延误了疾病的治疗，而且易引发耐多药结核病的产生。
6. 医务人员直接面视下的督导治疗(DOTS):虽然DOTS策略在我国覆盖率为100%，但执行结果并非如此。
7.对现有耐多药结核病患者尚未进行有效的治疗和管理:由于对现有的耐多药结核病患者尚未进行有效的治疗和管理，耐多药结核病患者仍在传染其他人，不断扩大产生初始耐多药结核病的危险性。流动人口、弱势群体和羁押人员等特殊人群的结核病治疗与管理问题比一般人群更为严重，他们中的MDRTB也应引起特别的关注。