肌酐为肌酸的代谢产物，肌酸与肌肉量成正比，人体以恒定的速度产生和释放肌酐到血液中，由血循环带到肾脏，从尿中排出体外。血肌酐包括内生肌酐与外源性肌酐，内生肌酐是由肌肉所含的磷酸肌酸经水解代谢而产生，不受食物影响。外源性肌酐来自摄入的鱼、肉类食物。肌酐主要是内生肌酐的影响。由于肌酐分子量小，不与血浆蛋白结合，可自由通过肾小球，不被肾小管重吸收，在血肌酐无异常增高时亦不为肾小管排泄，所以可用内生肌酐清除率（Ccr）来代替菊粉清除率（Cin）表示肾小球滤过率（GFR）。内生肌酐清除率是判断肾小球滤过功能损害的敏感指标，常在做肾功能试验之前检查。