nanoporetech使用纳米孔测序技术的微生物学

完整的细菌，真菌和病毒（DNA或RNA）基因组，可进行长时间的纳米孔测序。通过快速的病原体检测方法（无论是在实验室还是在野外），从环境或单一生物样品中鉴定并鉴定微生物。如果需要，还应附有抗菌素耐药性分析。使用直接RNA或cDNA方法对全长转录本进行测序，以进行准确的基因表达和转录本亚型分析。

• 通过长读和超长读来简化从头组装并校正参考基因组

• 解决结构变化和重复区域

• 测序和定量全长转录本，以进行明确的基因表达和亚型分析

• 通过直接测序消除偏倚并鉴定表观遗传修饰

• 实时获取结果，包括物种识别

• 使用Flongle，MinION，GridION或PromethION扩展到您的需求

全面分析微生物基因组（DNA或RNA）。准确定位重复区域和结构变异，并使用长测序读数将质粒与基因组区分开。简化从头组装并更正现有的参考基因组。可扩展以适应您从工作台到现场的需求。

• 准确解析具有挑战性的基因组区域（结构变异和重复） 

• 简化从头组装和正确的参考基因组，长读

• 使用全基因组，靶向和多路复用方法

• 无需PCR的直接DNA和RNA测序消除了偏倚

• 通过实时数据流获得即时结果

• 可扩展以满足您的需求-1.8 Gb Flongle；30 Gb MinION；150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

实时准确识别微生物和相关的抗药性（AMR）。Oxford Nanopore提供了完整的解决方案-从快速的10分钟文库制备（DNA）到使用EPI2ME平台的实时系统发育和AMR分析。使用宏基因组或靶向16S rRNA方法。使用便携式MinION或台式GridION或PromethION设备在样品源处或实验室中进行测序。

• 实时识别微生物和AMR，并通过长时间阅读来区分密切相关的菌株

• 快速的全基因组或靶向（例如16S）方法简化了工作流程

• 使用便携式MinION和Flongle在样品源处进行测序

• 多重样品获得更具成本效益的结果

• 可扩展以满足您的需求-1.8 Gb Flongle；30 Gb MinION；150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

使用全长纳米孔测序读数，解析转录本亚型并测量真实的基因表达谱。低投入量与快速，简化的工作流程相结合，可进行高度敏感的基因表达分析

• 测序完整的全长转录本，以明确鉴定转录本亚型

• 准确定量同工型以进行敏感的基因表达分析

• 使用直接cDNA或直接RNA测序消除PCR偏倚

• 轻松识别反义转录本和lncRNA亚型

• 新增功能：使用更新的RNA和cDNA测序试剂盒，只需较少的投入即可获得更高的产量

微生物表现出许多类型的碱基修饰，可影响一系列功能，包括基因表达和抗菌素耐药性。与基于替代测序的分析方法不同，纳米孔测序不需要扩增或链合成，可以减少偏差并保留修饰的碱基信息，这些信息可以与核苷酸序列一起直接检测到-无需额外的样品转换。 

• 在一次测定中鉴定修饰的碱基和核苷酸序列

• 将基本修改记录为标准-准备就绪时进行分析

• 使用无PCR的全基因组，全转录组或靶向测序方法

• 使用核苷酸类似物探索基因组复制

• 快速的10分钟文库制备（DNA）-不需要亚硫酸氢盐或化学转化

• 使用越来越多的工具来分析数据