发布时间:2021-10-14 09:52 原文链接: 气液界面的电荷性质决定冷冻电镜蛋白质取向优势

  中国科学院生物物理研究所研究员章新政课题组在Journal of Structural Biology上,在线发表了题为Effect of charge on protein preferred orientation at the air-water interface in cryo-electron microscopy的冷冻电镜方法学研究论文。该研究首次提出电荷相互作用是蛋白颗粒吸附于气液界面并导致取向优势的主要因素,为克服气液界面导致的冷冻制样问题提供了新思路。

  冷冻电镜三维重构需要蛋白质在冷冻制样时取向随机地分布在非晶冰中,然而气液界面常常导致蛋白质,尤其是可溶性蛋白质在非晶冰中出现优势取向分布,严重情况下使得三维数据不完整,无法进行重构。该问题是目前单颗粒冷冻电镜技术对蛋白质进行结构解析时易遇到的瓶颈问题。前期研究表明,气液界面具有疏水性,可使处于气液界面上的蛋白质变性。因此,气液界面往往被认为通过疏水相互作用吸附部分变性的蛋白质,从而导致优势取向问题。

  课题组博士生李不凡针对冷冻电镜三维重构中常见的蛋白质优势取向问题开展机制研究,发现蛋白质吸附于气液界面,其取向由气液界面携带的电荷控制(如图)。常规的冷冻制样中气液界面携带负电荷,负电荷对蛋白质的吸附导致了蛋白质分布的取向优势。研究还发现,通过运用带正电的去污剂调制气液界面的电荷性质,可以引入蛋白质新的取向数据,实现蛋白质取向问题的改善。该工作提出了电荷相互作用是许多蛋白质吸附于气液界面的主要因素,为克服气液界面导致的冷冻制样问题提供了新思路。

  研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金委员会重点项目、中科院战略性先导科技专项(B类)、中科院基础前沿科学重点研究计划项目的支持。

  蛋白质通过布朗运动至气液界面附近,被由带负电的气液界面形成的势阱捕获的示意图。捕获的过程为蛋白质的旋转使其在势阱中的能量最低。最低能量状态决定优势取向分布。

相关文章

新探针可实现对蛋白质N端组学深度富集检测

中国科学院上海药物研究所研究员黄河、柳红合作,研究设计合成了一种含有吡啶甲醛片段的可断裂分子探针2PCA-Probe,可实现对蛋白质N-端的深度富集检测。相关研究发表于《美国化学会志》。蛋白质水解是一......

预测蛋白质“糖衣”形态有了新方法有助于药物研发

2月29日,德国、波兰、法国与中国台湾组成的科研团队在学术期刊《细胞》发表成果,开发出能在几分钟之内预测蛋白质“糖衣”形态的新型计算方法,有助于进一步了解蛋白质在健康和疾病中的作用,帮助药物与疫苗研发......

科学家成功解析叶绿体基因转录蛋白质机器构造

叶绿体中的光合作用将光能转化为化学能,吸收二氧化碳,释放氧气,是地球生物圈的重要塑造者。叶绿体约在15亿年前通过蓝藻内共生进化而来。在进化过程中,叶绿体基因要么被废弃,要么逐渐转移到细胞核染色体中,导......

人与猿类如何在进化中“甩掉”尾巴

猴子有尾巴,而人类和猿类的尾巴却在进化中消失了,是什么在其中起了关键作用?《自然》28日发表的一篇论文,报道了人类和猿类演化掉尾巴的遗传学基础。灵长类动物尾部表型的系统发育树(Ma表示百万年前)。图片......

电镜领域革命——“低价”的高分辨率技术

伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校的研究团队揭示了一项突破性的研究成果,他们在无需采用昂贵的像差校正显微镜情况下,实现了前所未有的显微分辨率。长期以来,显微镜分辨率的提升往往伴随着高昂的造价,这极大限制了此......

应激诱发仔猪肌肉生长阻滞分子机制研究获新进展

集约化养殖过程中,免疫应激普遍存在于断奶仔猪饲养环节,会导致仔猪肌肉蛋白质降解和生长阻滞,最终严重影响肥育阶段产肉率和肉品质,给养猪业带来巨大经济损失。因此,有效缓解仔猪免疫应激是当前养猪生产亟待解决......

电镜市场新品迭出,深度赋能生命科学领域研究

英国达雷斯伯里国家先进电子显微镜研究设施——即“superSTEM”中心——利用扫描透射电子显微镜(STEM)对陨石进行了分析,结果显示其中存在氨基酸和含氮杂环化合物。后者是一种含氮化合物,可以形成简......

670万|光谱/质谱/电镜均在列该单位采购清单出炉

江苏省公安厅是江苏省人民政府下设的主管全省公安工作的职能部门。为便于供应商及时了解政府采购信息,根据《江苏省财政厅关于做好政府采购意向公开工作的通知》等有关规定,现将江苏省公安厅(机关)2024年2月......

研究发现蛋白质摄入过量不利于动脉健康

美国匹兹堡大学医学院的研究人员发现,摄入过量的膳食蛋白质会增加动脉粥样硬化风险。研究结果发表在19日的《自然·新陈代谢》杂志上。该研究结合了小型人体试验、小鼠实验和培养皿中的细胞实验。结果显示,当膳食......

Nature:2024年值得关注的七项技术,它是核心

随着人工智能(AI)技术的不断突破和大型模型的层出不穷,AI受到了前所未有的关注。面对这一浪潮,人们不禁好奇:未来究竟会是什么样子?为了解答这一问题,《Nature》杂志发布了未来的一年里,将密切关注......