tRNA的二级结构如图1所示，其在原核生物和真核生物均相对保守。主要结构有D-loop（D环）、T（C）-loop（T环）、Anticodon-loop（反密码子环）、Accepter Arm（受体臂）、3'端CCA保守序列、Discriminator（识别碱基）、Variable-loop（可变环）等。
由于翻译的氨基酸需要，tRNA在单个细胞内可有很多种，下面将讨论各种mRNA之间的保守部分和可变部分。
