竹子是一种独特的禾本科植物，它的茎秆生长迅速，如毛竹的幼嫩茎秆（笋）一天生长可达1米。这种特性使其能够与其他树木竞争，从而适应森林环境。以往对竹子木本茎快速生长特性的研究主要集中在形态学、解剖学和生理学方面。近期，我国科学家开展了竹子新基因功能演化的研究，揭示了其茎秆快速生长的遗传机制，相关研究成果发表在《Molecular Biology and Evolution》期刊，标题为“New Genes Interacted with Recent Whole Genome Duplicates in the Fast Stem Growth of Bamboos”。
科研人员对毛竹基因组数据进行基因组系统发育地层学（phylostratigraphy）和演化转录组学分析，共鉴定出1622个近4600万年前出现的竹子孤儿基因（特有新基因），其中19个是从头起源（de novo）基因。在以往对其他植物的研究中，新基因主要在繁殖组织中高表达。这项研究发现，新基因在快速生长的竹笋中高度表达，并且表达量在快速生长的转折点达到最高。研究还发现，全基因组加倍（whole-genome duplicates，WGD）基因也在竹笋中特异性地高表达，孤儿基因和WGD基因在茎秆快速生长的共表达模块中富集，它们可能通过共同作用重塑了茎秆生长的表达网络，从而驱动竹子快速生长这一特性的形成。
论文链接：https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab288/6377341
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