发布时间:2012-12-03 15:05 原文链接: 武汉植物园莲遗传连锁图谱研究取得进展

  遗传连锁图谱是研究植物基因组结构、进化的有力工具,是基因定位、克隆和分子标记辅助育种的重要基础。但作为被子植物中起源最早的植物之一,且素有“活化石”之称的莲,其基因组学研究却明显滞后。因此,构建莲遗传连锁图谱有助于莲基因组学研究的快速发展,为莲重要经济性状的分离和克隆提供依据,从而有利于进一步探索和充分利用莲的观赏、食用和药用价值。

  中科院武汉植物园水生植物资源学科组首先扫描了中国古代莲基因组序列,发现了86,089个SSR位点,其中73,246个SSR位点可用于开发SSR引物。然后以亚洲莲品种“中国古代莲”和美洲黄莲品种“AL1”杂交F1群体为材料,根据中国古代莲基因组序列信息开发的部分SSR分子标记(500对)分别构建了“中国古代莲”和“AL1”的遗传连锁图谱。由于“中国古代莲”的基因组杂合度比较低,此图谱仅包含7个连锁群,有47个标记,图谱长度为365.67 cM。“AL1”图谱包含11个连锁群,有177个分子标记,图谱长度为524.51 cM。这是首次报道莲的遗传连锁图谱,为莲基因组学研究奠定了良好基础,加快了莲重要基因定位、克隆和分子标记辅助育种的进程。

  该研究成果以Genetic linkage maps for Asian and American lotus constructed using novel SSR markers derived from the genome of sequenced cultivar为题在BMC Genomics(doi:10.1186/1471-2164-13-653)上在线发表。

  

  美洲黄莲“AL1”遗传连锁图谱

相关文章

盘点:单核苷酸多态性(SNP)检测方法

单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms,SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,包括碱基的颠换、转换、插入和缺失。它是人类可遗传变......

“基因组学+脑科学”双轮驱动,红杉中国医疗加速器启用

11月17日,“红杉中国智能医疗加速器”在上海张江正式宣布启用。上海市人民政府副秘书长陈鸣波、浦东新区区长杭迎伟、上海市经济和信息化委员会副主任张英、上海推进科技创新中心建设办公室专职副主任侯劲、上海......

两家公司获750万美元合作,研发新冠等传染病数据生态

分析测试百科网讯   近日,SevenBridgesGenomics和ScrippsResearch表示,他们赢得了美国国家过敏和传染病研究所(NationalInsti......

原来高分文章的图是这么做的?真简单!!!!

我们解密基因组学高阶套路,虽然达到《PNAS》的道路还比较长,但是我们正在不断的努力前行中这一周我们再接再厉,继续讲解基因组可视化。让我们在基因组可视化的道路上越走越远。说了这么多,我们先看图,如果觉......

释放基因组学云计算潜力Illumina收购再下一城!

分析测试百科网讯近日Illumina针对收购BlueBee发布公告。BlueBee是一家为研究机构和临床客户提供基因组分析解决方案的云软件公司,其总部位于荷兰,公司开发了符合安全法规的云平台,简化了对......

基因组学助力芸薹属抗性基因挖掘与育种

芸薹属包含许多重要的蔬菜、油料和饲料作物,如白菜、甘蓝、油菜、芥菜等。与其它农作物一样,芸薹属作物在生产中不断受到病毒、细菌和真菌等的侵害,造成巨大经济损失。近日,《园艺学研究》在线发表了中国农业科学......

中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱利于育种

从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了......

研究指出基因组学引领生物育种变革

记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉,现代农业研究已迈入生物组学大数据时代,特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。基因组学是对生物体所有基因进行集......

《自然通讯》李灵军再创新法:大幅提高组织质谱成像性能

开发具有快速、原位特点鉴定并表征蛋白结构的技术是基于质谱的蛋白组学研究面临的迫切需求,但是在狭窄空间中很难同时完成多种任务。在2019年10月16日,发表在NatureCommunications上的......

基于八大基因组学数据库构建迄今最完整的癌症eRNA图谱

增强子RNA(eRNA)是一种从增强子转录的非编码RNA。目前,科学家已经在人类细胞中鉴定出数以万计的eRNA,其中许多都在RNA转录过程中发挥重要作用,以介导靶基因的激活。在人类癌症中,癌基因或致癌......