近日,我组在糖苷类化合物规模化注释方面取得新进展。通过构建in silico苷元库和糖基/酰基-糖基碎裂模式库,以及发展利于苷元离子检出的LC-HR MS/MS分析条件,建立了苷元离子的高通量识别方法以及高效去除假阳性候选结果的方法,并开发了相应的糖苷类化合物规模化注释程序plantMS2(https://github.com/zhengfj1994/plantMS2)。

 

糖苷类化合物是一类重要的次生代谢产物,在植物生长发育过程中起着关键作用,全景注释植物中已知和未知糖苷类化合物具有重要的研究意义。由于市售标准品和数据库收录的二级质谱规模有限,现有的基于液相色谱-高分辨质谱(HRMS)的糖苷类成分注释方法难以有效地对糖苷类化合物进行注释、定性。

研究团队发展了一种基于液相色谱-HRMS/MS的糖苷类化合物规模化定性新方法。构建了具有植物种属特异性的in silico苷元库以及糖基/酰基-糖基的in silico碎裂模式库。优化出利于苷元离子检出率的LC-HR MS/MS分析条件,并建立了苷元离子的高通量识别方法。最后,通过候选糖苷-苷元质谱相似性发展了高效去除假阳性候选结果的方法。方法评估表明,该注释流程适用于多种类型的HRMS仪器不同碎裂模式(HCD和CID等)下建立的方法,定性准确性和特异性均优于现有注释方法。将该方法应用于玉米叶片,种子和花丝中糖苷类成分的注释,共注释出274个糖苷类成分。

相关研究成果以“Novel Method for Comprehensive Annotation of Plant Glycosides Based on Untargeted LC-HRMS/MS Metabolomics”为题,发表在Analytical Chemistry上。该工作的第一作者是我组博士研究生张秀琼,通讯作者为路鑫和许国旺。上述工作得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助。

文章链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.2c02362(文/图 张秀琼)


相关文章

公开招标|3275.6万采购质谱仪、基因测序仪等一批医疗设备

深圳市龙华区妇幼保健院区妇幼保健院2023年医疗设备购置项目采购计划资金意向公开。预算金额3275.6万元,预采购质谱仪、基因测序仪等一批医疗设备。采购单位:深圳市龙华区妇幼保健院项目名称:区妇幼保健......

赛分科技冲刺科创板:全球色谱客户超5000家,拟募资8亿元

苏州赛分科技股份有限公司(下称“赛分科技”)于1月4日在上交所更新上市申请审核动态,该公司已回复意见落实函,回复的问题主要有,工业纯化领域的技术特点和难点、生产模式和填料需求,发行人在工业纯化领域的竞......

心质所向,谱写华章!SCIEX全球副总裁、中国区总经理2024年元旦祝福

岁序常易华章日新一元复始万象更新SCIEX全球副总裁、中国区总经理蔡俊松先生圆梦2024,新征程,新未来带着光荣和梦想我们将始终与客户携手同行共同推动技术发展科研创新和产业升级让质谱和毛细管电泳改变每......

1576万!包含多种色谱及质谱仪器招标

海南省药品检验所发布招标信息,包括高效液相色谱仪,气相色谱仪,超高效液相色谱仪,电感耦合等离子体质谱仪以及三重四极杆质谱仪等多种仪器,总预算1576万元。具体内容如下:根据我所检验工作要求,现拟公开征......

超300万!包含基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪!

近日北京市兽药饲料监测中心完成新一轮仪器仪表采购,中标成交供应商为北京国华仪电科技有限公司,总成交金额343.983万元,共采购23台仪器,其中基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪220万。一、项目编号......

1043万超高分辨液质联用仪项目,沃特世、布鲁克、安捷伦皆上榜!

近日,山东大学(青岛)环形离子淌度超高分辨液质联用仪采购项目发布了中标公告,中标金额为1043万元,供应商为北京合众汇美国际贸易有限公司,其中包含沃特世、布鲁克、安捷伦、普发、滨松等进口品牌,也包含镭......

回顾与展望!小分子液相色谱行业市场规模及发展前景

小分子液相色谱设备主要可分为实验室仪器和生产级装备两大类,随着下游生物制药、学术研究、食品安全领域的不断发展,中国液相色谱市场规模稳步提升,其中国内实验室液相色谱仪市场主要由安捷伦、沃特世、赛默飞等生......

谱育科技:全系质谱累计突破2500台套,高端仪器全面开花

——谱育科技副总经理俞晓峰先生专访从2015年谱育成立,每年均实现翻倍增长,谱育科技既是聚光体系中最耀眼的明星,也是中国实验室分析仪器领域最壮大的公司。2023年12月,谱育科技青山湖创新基地迎来了第......

海关总署发布37项行业标准的公告,涉及高效液相色谱标准替代

近日,海关总署发布了2023年第201号(关于发布《鲁氏耶尔森氏菌检测技术规范》等37项行业标准的公告)。发布了37项行业标准。其中涉及到高效液相色谱检测方法的补充和修订。《化妆品中生育酚及α—生育酚......

回望2023,展望2024!国产科学仪器行业发展盘点,成果与挑战并存

2024年开年之际,就2023年科学仪器行业及公司的重大事件和变化总结,回望一年里国产科学仪器行业整体发展动态、取得的诸多成果与面临的挑战。国产仪器行业趋势:生命科学领域受到2022年-2023Q1疫......