二乙菧酚吸收后经血流和组织液转运到靶细胞，能与血浆蛋白中度或高度结合，能与组织内特异性受体蛋白在雌激素反应组织中结合形成“活化”的复合体，此种复合体具有多种功能。二乙菧酚主要在肝脏代谢，经过肠肝循环可以再吸收。主要以葡萄糖醛酸的结合形式经尿和粪便排泄。由于二乙菧酚在肝脏中代谢较慢，故口服有效。二乙菧酚口服易自胃肠道吸收，血药浓度呈二房室模型进行衰减，初相半衰期为80min，消除相半衰期在20h以上。主要在肝脏中进行氧化代谢，最终以葡萄糖醛酸结合型从尿中排出。
