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高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用

高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用—表观遗传学中检测CpG位点的一种新技术甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-Hi-Res Melting®)是一种不需要PCR产物后续操作的,简单且灵敏的检测基因甲基化水平的方法。该方法主要通过比较曲线的熔解温度和峰形得以实现。该方法可以在一系列的CpG位点中检测出单一的一个甲基化的发生,同时,也可以对一系列的CpG位点的甲基化水平进行分析。单个CpG位点的甲基化和平均的甲基化水平会对熔解曲线的形状造成影响。采用重亚硫酸盐处理DNA模板可以使5-甲基胞嘧啶转化为尿嘧啶。在PCR反应中,尿嘧啶可以与腺嘌呤配对,最终使得胞嘧啶转化成胸腺嘧啶。样品中的GC含量发生了变化,最终被转化成了熔解曲线Tm值之间的差异。CpG位点在小的扩增片段内的相对位置也会对熔解峰的形状产生影响,因此,Tm值和熔解峰的形状可以被用在表观遗传学的研究中。对于甲基化研究中一些常见的问题,我们采用了有三种方法来克服。1,采......阅读全文

多个序列突变的筛查-HRMA(一)

摘要:双链DNA分子转化为两个单链分子,DNA分子变性或熔解用于研究DNA结构和组成已经有多年。最近,新技术的进步提高了这种技术的潜力,尤其是用于DNA序列突变的检测。通过饱和DNA染料的发展和设备的改善,熔解的灵敏度和特异性有了很大的提高(改良的温度精确地结合每个时间单位温度的精确测量)。熔解分析

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少 DNA 甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析 (methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性 PCR (MS-PCR)

LightCycler应用:甲基化分析

主要应用:应用实时荧光PCR技术进行快速准确的DNA甲基化分析DNA甲基化是表观遗传学的重要研究内容之一,它可以在转录水平抑制基因的表达。具体的过程是在胞嘧啶-鸟嘧啶(CpG二核苷酸)的5位碳原子上添加了一个额外的甲基团,形成5-甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度较高的区域在人体基因组中呈非随机分布于,

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

高分辨率熔点分析技术进行冻存组织样本甲基化的检测

1 前言      启动子高度甲基化是恶性肿瘤基因转录中的一种很常见的现象,被视为细胞恶性转化的标志之一。DNA甲基化分析是一种基因检测工具,用于早期癌症检测、风险评估与治疗疗效评估,具有非常诱人的前景。      &n

甲基化敏感性高分辨率熔解(MS-HRM)

DNA 甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3‘双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲基胞嘧

甲基化敏感性高分辨率熔解(MS-HRM)

DNA 甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3‘双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲基

甲基化敏感性高分辨率熔解(MS-HRM)

DNA 甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3‘双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲基胞嘧

五花八门的DNA甲基化检测(上)

  近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面生物通给大家介绍一些常用的方法。   特异位点的甲基化检测   甲基化特异性PCR(MS-PC

甲基化检测——MS-HRM技术

  HRM技术服务之甲基化检测(MS-HRM技术)    DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状

甲基化检测——MS-HRM技术

DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲

高通量、低成本 SNP、突变和甲基化检测方法 ——HRM技术应用

  HRM介绍    HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高分

高通量、低成本 SNP、突变和甲基化检测方法 ——HRM技术应用

HRM介绍     HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探

罗氏FFPE组织切片核酸纯化试剂盒操作说明

High Pure FFPET DNA Isolation Kit基于离心柱法的抽提原理,免去DNA沉淀和有机试剂抽提的步骤,是快速核酸抽提的理想工具。整个抽提过程仅需3小时(含脱蜡过程);获得高DNA得率和质量;在qPCR,芯片分析和测序等下游应用中获得强大信号。图1:从FFPET样本中获得高得率

最新DNA甲基化测序技术比较研究

  在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。  对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合

解读《肿瘤个体化治疗检测技术指南》:9大检测技术

  肿瘤的个体化治疗基因检测已在临床广泛应用,实现肿瘤个体化用药基因检测标准化和规范化,是一项意义重大的紧迫任务。  为进一步提高肿瘤个体化用药基因检测技术的规范化水平,7月31日,国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会,在广泛征求意见的基础上,制订了《肿瘤个体化治疗检测技术指南(试行)》。  

高通量、低成本SNP、突变或甲基化检测方法—HRM 技术应用

HRM 介绍HRM 技术是high-resolution melting analysis 即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的PCR 技术,HRM 不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR 结束后直接运行高分辨熔解,即

高分辨率熔解曲线(HRM)分析预混Mix(PCR),能基因筛查吗?

  高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)是一种基于单核苷酸熔解温度不同而形成不同形态熔解曲线的基因分析新技术,具有极高的敏感性,可以检测出单个碱基的差异。 作为一种高效稳健的"post-PCR"技术,它不受突变碱基位置与类

Rotor-gene Q 一款独具创新的荧光定量PCR仪

荧光定量PCR检测在中国的应用已经有超过10年的历史,也是目前分子诊断领域最主要的技术方法。随着该项检测的广泛开展,临床对于检测的敏感性、重复性、通量和速度等都提出了更高的要求。作为该方法的重要检测平台,荧光定量PCR仪器也在不断推陈出新。过去的10年中,国内外先后有10多个品牌,推出了几十种型号的

一文读懂分子诊断技术、PCR技术、基因测序技术

  分子诊断技术是指以DNA和RNA为诊断材料,用分子生物学技术通过检测基因的存在、缺陷或表达异常,从而对人体状态和疾病作出诊断的技术。其基本原理是检测DNA或RNA的结构是否变化、量的多少及表达功能是否异常,以确定受检者有无基因水平的异常变化,对疾病的预防、预测、诊断、治疗和预后具有重要意义。通俗

罗氏诊断和默克化工参展BIOTECH CHINA 2008

罗氏诊断产品(上海)有限公司—罗氏应用科学部 本次展位号B49+5 本次展会现场将发布最新的细胞学研究检测分析产品。 展示的产品将包括:唯一一款具有可检测未知基因突变位点的高分辨率熔解曲线(HRM)分析功能的模块式高通量高通量实时荧光定量PCR系统LightCycler480®系统,可应用于基因

盘点:分子诊断常用技术50年的沿革与进步

  一、基于分子杂交的分子诊断技术  上世纪60年代至80年代是分子杂交技术发展最为迅猛的20年,由于当时尚无法对样本中靶基因进行人为扩增,人们只能通过已知基因序列的探针对靶序列进行捕获检测。其中液相和固相杂交基础理论、探针固定包被技术与cDNA探针人工合成的出现,为基于分子杂交的体外诊断方法进行了