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LightCycler应用:甲基化分析

主要应用:应用实时荧光PCR技术进行快速准确的DNA甲基化分析DNA甲基化是表观遗传学的重要研究内容之一,它可以在转录水平抑制基因的表达。具体的过程是在胞嘧啶-鸟嘧啶(CpG二核苷酸)的5位碳原子上添加了一个额外的甲基团,形成5-甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度较高的区域在人体基因组中呈非随机分布于,优先分布于基因的启动子区,并被称为CpG岛[1]。对于癌症,其基因组的甲基化分布发生变化[2]。正常状态下应甲基化的区域未甲基化,而症状状态下非甲基化区域出现甲基化,例如CpG岛相关启动子呈超甲基化。这可导致受累基因座的染色质结构发生变化,致使基因沉默。启动子超甲基化可导致有关肿瘤演进的重要基因再次沉默,例如那些有关DNA修复、细胞周期调控和凋亡的基因。因此,可以认为DNA甲基化与肿瘤研究密切相关。肿瘤中某些基因的DNA甲基化状态的变化通过其生物学特征反映出来。因此,评估DNA甲基化的快速高通量方法对研究者和临床医生在诊断、治疗和预后......阅读全文

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少 DNA 甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析 (methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性 PCR (MS-PCR)

DNA甲基化检测技术全攻略

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五花八门的DNA甲基化检测(下)

  近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面生物通给大家介绍一些常用的方法。   全基因组的甲基化分析   基于芯片的甲基化图谱分析  

特异性位点的DNA甲基化的检测方法

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5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

  文章导读   2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。   云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据

文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一:非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表

lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析综述

  技术优势:   ● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程   ● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接   ● 可视化数据展示,提供paper级结果图表   ● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果   介绍:    人类基因组中仅有

五花八门的DNA甲基化检测(上)

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解锁5分m6A甲基化谱文章新思路

1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63,通过阿霉素DXR诱导,建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1;干细胞相关基因的表达量;皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG

lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析

技术优势:●   专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程●   可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接●   可视化数据展示,提供paper级结果图表●   

看表观新修饰-6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

焦磷酸测序在甲基化分析中的应用

  DNA甲基化是近年来研究的热点,因为越来越多的证据表明,它参与了胚胎发育、基因印迹等过程。同时,它在疾病发展中也起着举足轻重的作用。甲基化状态的改变被认为是引起癌症的一个重要因素,这种变化包括基因组整体甲基化水平的降低和CpG岛局部甲基化水平的异常升高,从而导致基因组的不稳定(如染色体的不稳定、

鱼肉中的甲基汞检测

虽然,目前国标中,生物样品的甲基汞限量还是0.5-1 ppm,但是随着分析检测技术的发展以及人们对食品安全认识的提高,对生物样品的检测力度必将加大,对于甲基汞的含量也必将严格把控。本文采用一款国内的全自动烷基汞分析仪,应用吹扫捕集—气相色谱—冷原子荧光的方法对鱼肉样品中的甲基汞进行测定,鱼肉样品的前

DNA甲基化研究方法的回顾与评价

摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲

DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)

摘要: DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:整体水平的甲

甲基化芯片在表观遗传学中的应用

表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表

甲基化芯片在表观遗传学中的应用

  表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。    CpG岛的异常甲基化是导致基

表观新修饰-6mA甲基化助力IF飙升(二)

3、数据分析标准分析:(1)DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域,默认p <= 1e-5(具体参数以报告为准,云序生物会根据数据,适当调整参数)的峰为统计上显著的甲基化区。注:每个样品组做一个Input,以去除基因组背景,降低假阳性率。(2)DNA甲

高分辨率熔点分析技术进行冻存组织样本甲基化的检测

1 前言      启动子高度甲基化是恶性肿瘤基因转录中的一种很常见的现象,被视为细胞恶性转化的标志之一。DNA甲基化分析是一种基因检测工具,用于早期癌症检测、风险评估与治疗疗效评估,具有非常诱人的前景。      &n

RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。

2018国自然研究热点二: RNA甲基化研究深度剖析

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甲基化研究新套路

   组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。   为更深入探索表观调控与临床现象间的具体机制,上海华盈生物合作伙伴——华中科技大学同济医院马丁院士课

甲基化研究新套路

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最新DNA甲基化测序技术比较研究

  在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。  对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合

GRAIL癌症早筛:利用cfDNA甲基化分析方法可溯源20余种癌症

  2019年9月27日,欧洲肿瘤内科学会(ESMO)年会在西班牙巴塞罗那拉开帷幕。ESMO是欧洲最负盛名和最具影响力的肿瘤学会议,众多临床机构及领先企业在本届年会上公布了肿瘤领域的最新转化研究及临床实践数据。  9月28日,美国癌症早筛公司GRAIL在ESMO年会上重磅发布了该公司基于cfDNA的

RNA甲基化研究深度剖析(一)

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RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A 调控机制的运用

  RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met

RNA甲基化位点分析新方法

  继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后,小编看到读者们的热情度特别高。借此机会,再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心,QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se