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PROTEOMICS:OGalNAc糖基化修饰蛋白质的系统发现

近日,上海交通大学系统生物医学研究院张延课题组在国际知名蛋白质组学研究期刊PROTEOMICS上发表题为《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-T1/T2/T3 using a human proteome microarray》的文章。该研究运用点击化学反应与蛋白质芯片技术相结合、实现了快速高通量发现O-GalNAc糖基转移酶(ppGalNAc-T)修饰蛋白质底物的新方法(on-chip ppGalNAc-T assay)。为系统性研究O-GalNAc糖基化修饰的调控机制提供了一种新手段。 蛋白质糖基化,是蛋白质的一种重要翻译后修饰,参与了各种重要生命活动。其中黏蛋白型O-糖基化修饰(Mucin-type O-glycosylation......阅读全文

甜蜜而富有挑战性的糖基化蛋白质组学研究

   写在前面的话:对于研究糖基化蛋白质组学的学者们来讲,很多人喜欢用sweet这个词来形容自己的研究课题。我个人也很喜欢这个单词,这是一个让人感到幸福而温暖的词语,会让你对你的课题充满了爱意。但回头想想,当初懵懵懂懂读到研究生,误打误撞进入蛋白质组学圈,好像也就是随大流的主动抑或是被动选择了博士阶

杨福全、付岩团队在人血清N-链接糖基化蛋白质组学获进展

  2月29日,国际蛋白质组学期刊Molecular & Cellular Proteomics 在线发表了由中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中国科学院数学与系统科学研究院副研究员付岩团队在人血清N-链接糖基化蛋白质组学研究中所取得的进展“Large-scale Identific

沃特世:同中国科学家深度合作共促糖组学创新

  分析测试百科网讯 如果说基因是生命的起点,那么糖蛋白的表现很大程度上就是研究生命功能的终点。人类蛋白中有50%以上都发生了糖基化的修饰,在病理和生理过程中糖蛋白发挥了至关重要的作用,在生物制药中最亮眼的单抗药100%都是糖蛋白药物。对糖蛋白和糖蛋白质组学的研究是贯穿生物制药、疾病与临床研究生生不

复旦杨芃原组等开发精准糖蛋白质组新分析方法

  BioArt按:糖基化是最复杂的蛋白后修饰之一,具有多种重要的生物学功能。与其他蛋白后修饰相比,糖基化更为复杂,分析难度很大。目前已有的糖基化分析方法有明显的局限性:大部分方法仅能分析糖链或糖基化位点等不完整的糖基化信息,而基于糖肽的位点特异性分析方法则存在通量低,假阳性率高,数据质量难以评测等

糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片

   糖基化是Z为广泛和复杂的蛋白质共翻译或翻译后修饰之一,它是通过糖基转移酶,在新生多肽或者成熟蛋白质的特定氨基酸上添加多个单糖的过程,通俗的理解就是在细胞器内“出厂”的蛋白质上添加各种糖链“标签”的过程。人体内至少50%的蛋白质都会发生糖基化修饰。这类修饰与蛋白质的正确折叠、构象稳定性及分泌等密

糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片

   糖基化是Z为广泛和复杂的蛋白质共翻译或翻译后修饰之一,它是通过糖基转移酶,在新生多肽或者成熟蛋白质的特定氨基酸上添加多个单糖的过程,通俗的理解就是在细胞器内“出厂”的蛋白质上添加各种糖链“标签”的过程。人体内至少50%的蛋白质都会发生糖基化修饰。这类修饰与蛋白质的正确折叠、构象稳定性及分泌等密

糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片(一)

糖基化是Z为广泛和复杂的蛋白质共翻译或翻译后修饰之一,它是通过糖基转移酶,在新生多肽或者成熟蛋白质的特定氨基酸上添加多个单糖的过程,通俗的理解就是在细胞器内“出厂”的蛋白质上添加各种糖链“标签”的过程。人体内至少50%的蛋白质都会发生糖基化修饰。这类修饰与蛋白质的正确折叠、构象稳定性及分泌等密切相关

大连化物所糖基化蛋白质组学分析合作研究取得新进展

糖基化蛋白质学分析取得新进展  近日,中科院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术课题组(1809组)邹汉法研究员和第二军医大学王红阳院士合作,发展了基于糖蛋白固载的无标记定量蛋白质组学技术并应用于肝癌临床诊断标志物的初步筛选中,发现了一系列在肝癌血清中异常表达的糖基化蛋白,相

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量

近期《自然》期刊系列中发挥关键作用的赛默飞质谱仪

   【导语】在2011年10-11月期间,在一级科学刊物Nature和Nature Methods上有14篇科研论文使用赛默飞世尔LTQ-Orbitrap或TSQ质谱仪产生数据,聚焦的主题包括:目标物发现与定量研究,Top-down蛋白质组研究绘制蛋白质异构体,同位素标签方法的精度,提高糖蛋白质组

肿瘤靶向药物成像的未来发展 -- PI与MALDI成像相结合

  摘要  在过去的十年中,人们从研究植物代谢组学到发现疾病的生物标志物研究,再到开发新的疗法,基质辅助激光解吸电离(MALDI)成像技术已成为这些研究中不可或缺的工具。MALDI 技术通过提供对治疗化合物及其代谢物的直接分布监控以及非靶向药效学信息,革新了临床前药物开发流程。  目前,MALDI

蛋白质组学技术分析方法及概括

1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并首次在1995 年7月的“Elec

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组学技术分析方法及其仪器使用比较

1 蛋白质组学概述 “蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并首次在1995 年7月

第四届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP-2016)

  一、CNCP会议简介  随着蛋白质组学的兴起,特别是质谱技术的快速发展,蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大,必须通过先进的计算机算法、高效的软件与硬件来自动处理大批量的蛋白质组数据,这已经成为蛋白质组学研究的一个重要分 支,即"计算蛋白质组学"(Co

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相层析, 经典的蛋白质鉴定方法如氨

用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰

By Andreas Huhmer, Director of Proteomics Marketing, Thermo Fisher Scientific       在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面,电子转移裂解( ETD )线性离子阱质谱

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

     作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相

第三届生物质谱学术交流会第三轮通知

蛋白质组数据处理暨第三届全国生物质谱学术交流会(第三轮通知)   为了积极促进我国蛋白质组学技术发展和应用、数据挖掘和生物质谱的经验交流,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会、中国质谱学会生物质谱专业委员会和中国化学会分析化学委员会主办,北京蛋白质组研究中心、复旦大学和蛋

一文了解蛋白质组学分析技术

  蛋白质组学(英语:proteomics,又译作蛋白质体学),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名词。  蛋白质组(Proteome)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组(genome

蛋白质(十五)主要研究

主要研究历史在18世纪,安东尼奥·弗朗索瓦(Antoine Fourcroy)和其他一些研究者发现蛋白质是一类独特的生物分子,他们发现用酸处理一些分子能够使其凝结或絮凝。当时他们注意到的例子有来自蛋清、血液、血清白蛋白、纤维素和小麦面筋里的蛋白质。荷兰化学家格利特·马尔德(Gerhardus Joh

中国医学科学院蛋白质组学研讨会胜利召开

   2011年11月17日,第一届蛋白质组学研讨会在中国医学科学院基础医学研究所成功召开,本次研讨会是由中国医学科学院基础医学研究所主办,赛默飞世尔科技公司(ThermoFisher Scientific)合办和赞助,分析测试百科网(www.antpedia.com)协办,主题是:蛋白质组学在生物

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

摘要  蛋白质组学是在后基因组时代出现的一个新兴的研究领域, 它的主要任务是识别鉴定细胞、组织或机体的全部蛋白质, 并分析蛋白质的功能及其模式。 因此, 揭示蛋白质组中蛋白质间的相互作用关系也是蛋白质组学的重要内容之一。 酵母双杂交技术是用来检测蛋白质间是否相互作用的一

赛默飞组学技术前沿创新高峰论坛,带您发现组学的力量

  分析测试百科网讯 2020年11月27日,由赛默飞世尔科技主办、分析测试百科网协办的组学技术前沿创新高峰论坛在成都隆重举行。本次会议旨在“发现质谱力量”,邀请国内组学领域大咖共讨质谱在组学研究中的“力量”,期望共同推动中国组学研究发展。  赛默飞中国区色谱与质谱业务应用支持总监薄涛博士主持本次大

MALDI成像技术在跨学科中的应用:从代谢组学到杀虫剂

  基质辅助激光解吸/电离(MALDI)成像质谱法能以直接、原位、无标记的方式测量组织中的蛋白质、多肽、脂质、小分子药物及其代谢物和其它化合物。应用范围覆盖基础生物学研究、环境和毒理学科学,以及专门的药物研发方法。在各种情况下,MALDI成像所产生的独特信息对理解包括人、动物和植物等各类生命体的各种

蛋白质组学几种定量方法的案例解读

   上期分享的蛋白组学内容,是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀?这次,小编用实例说话,帮您梳理清楚。   一、Label-free定量    Label-free定量,顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化

蛋白质组学几种定量方法的案例解读(三)

经典案例题目:Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells(采用甾醇探针结合SILAC定量技术在哺乳动物细胞中分析胆固醇-蛋白质相互作用)期刊:Nat Methods主要技术:SILAC定量文

QTRAP代表文献回顾

 生物分子发表的代表性文献 QTRAP:同时具有三重四极杆和线性离子阱性能的独一无二的LC/MS/MS系统       QTRAP系统最早在ASMS 2002上,作为第一台商用的线性离子阱发布,是世界上唯一的线性离子阱和三重四极杆的复合