环状RNA在肠道干细胞自我更新中的重要作用
肠道是食物消化和吸收的主要场所，由单层上皮细胞形成肠上皮屏障。除了上皮细胞，肠道中还有大量的免疫细胞。即使在成体稳态（homeostasis）条件下，肠上皮仍经历着快速的自我更新，在小鼠中大约5天可以更新一次【1】。定位于肠道隐窝中的干细胞可以分化为肠道中所有的上皮细胞类型【2】。肠干细胞的自我更新和分化是肠道持续更新和损伤修复的基础。肠道干细胞处于微环境中，受不同微环境因子的精细调控。但是，免疫细胞作为肠道中数目众多且作用关键的细胞类群，在肠道干细胞自我更新中的作用尚不清楚。 环状RNA（cicrRNA）由RNA的5‘和3‘末端通过共价连接形成【3】。尽管曾被认为只是RNA剪切的副产物，但越来越多的研究表明cicrRNA具有重要的功能。cicrRNA与其他长链非编码RNA类似，可以作为miRNA sponge，也可以通过结合启动子区域，结合mRNA调控元件或隔离RNA结合蛋白来起作用【4】。同时，一些cicrRNA还可以......阅读全文
环状RNA在肠道干细胞自我更新中的重要作用
肠道是食物消化和吸收的主要场所，由单层上皮细胞形成肠上皮屏障。除了上皮细胞，肠道中还有大量的免疫细胞。即使在成体稳态（homeostasis）条件下，肠上皮仍经历着快速的自我更新，在小鼠中大约5天可以更新一次【1】。定位于肠道隐窝中的干细胞可以分化为肠道中所有的上皮细胞类型【2】。肠干细胞的自我
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用（二）
4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示，circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊：Aging-us影响因子：4.831发表时间：2020.9.10研究方法：全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接：Pr
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用（一）
环状RNA作为新发现的RNA分子，从诞生之日起就是光环加身，屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中，“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇，较2018年增长约20%，其中大
环状 RNA 测序案例分析
案例：以结肠癌，卵巢癌，特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是构成生物体 RNA 网络的一部分，而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀
环状RNA研究方法（一）
至2015起云序生物已经完成10000+例环状RNA全转录组测序服务，涵盖了50+疾病，20+物种，帮助众多客户在环状RNA分子的研究中取得突破性进展。客户发表的环状RNA文章高达20篇以上。此外云序生物还提供环状RNA机制研究手段，rip&RNA pull down技术，帮助客户冲刺高分机制文章。
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转录前
环状RNA研究方法（二）
在此基础上，哪些环状RNA分子发生了差异表达？在这里火山图、Venn图应有尽有。根据p=2的标准，一共发现42个环状发生上调，47个环状发生下调。 图3. 差异环状RNA的筛选2. 差异环状RNA分子的qPCR验证对于一篇做谱的文章，差异环状RNA的结果验证只需做到qPCR即可。对5个上调和5个下调
环状RNA研究文章汇总（二）
4.世界首篇人胶质瘤环状RNA研究（影响因子：3.0）胶质瘤作为最常见的颅内恶性肿瘤占颅脑肿瘤的40%~50%，电磁辐射等其他环境致癌因素会导致胶质瘤的发生，尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤治疗手段，但是多形性胶质母细胞瘤（GBM）的强侵袭、增殖能力仍给病人的治疗造成很大的
环状RNA研究深度剖析（二）
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR：挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验，检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。（AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白） b RNA pull down：对上述circRNA进行RNA pull down实验，拉