全新一代测序技术:没有光的测序

至今,新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心 ――明斯特大学Dag Harmsen 在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过50人的生命(德国范围内),在德国以外的欧洲地区也发现了76名患者。 Harmsen教授在这场疫情中发挥了重要的作用――他们通过将引发此次疫情的O104:H4型肠出血性大肠杆菌与2001年采集自一名溶血性尿毒症(HUS)体内的O104:H4型肠出血性大肠杆菌进行基因对比后,发现,两种菌株并非同源,引起此次德国EHEC暴发的O104:H4菌株来自一种肠聚集性大肠杆菌EAEC O104:H4 55989菌株的变异,其中还掺杂了一种目前未知的由志贺毒素产生的O104:H4菌株。 在这一场“战役”中,Harmsen教授主要采用......阅读全文

测序新技术速览

454技术 样品制备  将基因组打成较短的DNA片段,再将片段与接头相连,以便使其更容易与磁珠结合在一起(一个DNA片段结合于一个磁珠)。将PCR产物包被于“油包水”的乳化剂中,每一滴乳化剂内除PCR产物外,还含有一个结合了一个DNA片段的磁珠,这样,PCR扩增过程就可以在每一滴乳化剂内独立进行,而

无需建库,直接测序的测序新技术

  来自英国老牌测序研究机构Sanger研究院,以及英国剑桥巴布拉汉研究所的研究人员发表了题为“Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation”的文章,首

新技术可快速检测大肠杆菌

  华威大学生命科学学院的研究人员发现了一种新技术,可以在几分钟内检测细菌的存在。在这项研究中,华威大学的科学家发现健康细菌和受到抗生素或紫外线杀伤的细菌表现出完全不同的电反应。这些发现发表在《PNAS》杂志上。  目前测试临床样品或商业产品中的细菌污染情况通常需要数天的时间。在此期间,如果不能通过

全新一代测序技术:没有光的测序

  至今,新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心   ――明斯特大学Dag Harmsen   在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过

Nature-methods发布单细胞测序新技术

  来自瑞典Ludwig癌症研究所及Karolinska研究所的研究人员,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)杂志上报告了一项获得重大改良的新技术,可以利用它来分析单细胞中的基因表达——这一性能与从基础研究到未来癌症诊断的一切事物均存在关联。   资深作者Ri

Nature新技术:CRISPR+单细胞测序=?

CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因组编辑技术是生物研究和新型靶向药物研发的有力工具。比如利用CRISPR筛选基因(pooled CRISPR screens),可以通过CRISPR gRNAs靶向成百上千个不同的基因,同时编辑许多细胞,然后实验筛选编辑细胞,gRNA可以帮助确定哪些基因对于生物

微生物控制的新技术

 食品工业界在继续发展现有控制微生物控制方法的同时,正研究新技术以保证食品的微生物安全,同时也为消费者提供稍需加工或不需加工的高质量食品。这些年,辐照、高强度电子场、脉冲光、紫外线、高压加工和臭氧已作为消灭微生物的非加热方法。然而,在商业上运用这些技术仅在最近几年。尽管这些新技术以及其它方法看起来能

微生物新技术有哪些

目前,微生物污染造成的食源性疾病仍是世界食品安全中最突出的问题。加工食品所含菌的种类、数量,常随原料的生产环境及细菌学质量、工厂环境与操作人员的卫生及处理状况、制品贮运状况等而异。由于食品微生物污染的广泛发生,严重影响人民的健康,因此食品微生物检验工作对评价食品卫生质量,保证消费者饮食卫生有着极为重

食品微生物检验新技术

  摘要:食品安全是全球面临的难题和巨大挑战,不仅影响着人们的健康与生活,还关系着社会的稳定。本文初步介绍了几种食品检测中微生物检验的新技术,希望为从事食品检验工作的人员提供帮助。   《中华人民共和国食品安全法》中定义食品安全是指食品无毒、无害,符合应当有的营养要求,对人体健康不造成任何急性、亚急

掌上测序仪新玩法:空气微生物实时测

近日,英国基因组分析中心(TGAC)的研究团队分享了利用MinION掌上测序仪,进行创造性研究。作为MinION首批试用者,TGAC摒弃以往需要把样本带回实验室的做法,使用了微型测序设备对环境中成百上千种不同生物样本进行现场物研究,以便研究人员能够对实验基因数据进行实时分析。   该研究的目标是

全新测序技术利弊比较之单分子测序

  在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过50人的生命(德国范围内),在德国以外的欧洲地区也发现了76名患者。   Harmsen教授在这场疫情

北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术

  来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法,这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异,提高单细胞全转录组分析的准

Nature子刊:癌症单细胞测序新技术

  只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画,你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点,从远处看就形成了一幅图像。与之相似,生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱,然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。   发布在7月22日《自然生物技术》(

同济大学发布单细胞测序新技术

  单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而,在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异,又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。  加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在五月五日的Geno

北大生科院PNAS发布单细胞测序新技术

  来自北京大学生命科学学院等处的研究人员发表了题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,开发出了一种新型微流控单细胞全转录测序新方法,这种方法有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异,提高单细胞全转录组分析的准

DNA测序仪:454测序仪

454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了

谢晓亮院士Science单细胞测序新技术

  人类、草莓、蜜蜂、鸡和大鼠等许多生物体都已经进行过DNA测序。如果说测序个别物种具有挑战性,那么测序单个细胞的DNA无疑更难。   为了获得足够的DNA进行测序,通常需要数以千计或甚至数以百万计的细胞。而找出哪种突变存在于哪种细胞中几乎是不可能的,只存在于少数细胞(如早期癌细胞)中的突变也基本

基因测序新贵在ZL诉讼期间发布新技术

面对启迪公司的诉讼,牛津纳米孔技术公司表示,这种名为CsgG的微小孔隙是其新设备的基础。  首创了一种名为纳米孔测序的新DNA分析技术的英国牛津纳米孔技术公司,对其产品的核心部分一直守口如瓶。不过,紧随一项来自测序行业巨头——启迪公司的专利侵权诉讼,该公司揭示了驱动其最新设备的东

基因测序新贵在ZL诉讼期间发布新技术

  首创了一种名为纳米孔测序的新DNA分析技术的英国牛津纳米孔技术公司,对其产品的核心部分一直守口如瓶。不过,紧随一项来自测序行业巨头——启迪公司的专利侵权诉讼,该公司揭示了驱动其最新设备的东西,即一种看上去巧妙避开了启迪公司挑战的细菌孔。  同此前方法相比,纳米孔测序在分析DNA方面更加便捷和廉价

PNAS:新技术实现纳米孔内快速测序DNA

  据《每日科学》近日报道,由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术,可在纳米孔内对DNA进行快速测序,而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图,提供更加高效的个体医疗。相关论文发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)。  论文主要作者

美用新技术完成炭疽基因组测序

  美国乔治亚理工学院科学家使用一种称为RNA测序的新技术,描绘出了炭疽芽孢杆菌的基因表达。公布在最新一期《细菌学》杂志网络版上的此项研究成果,标志着任何细菌转录(细菌表达不同基因时产生的完整信使RNA集合)自此可被全面定义,并为研究细菌如何调控基因表达提供了更多细节。   乔治亚理工学院光电系统

新技术解读微生物间的“谈话”

美国加州大学圣迭戈分校团队开发了一种新的搜索工具,利用由全球研究人员整理的超过6万种微生物的数据库,可立即将微生物与其产生的代谢物进行匹配,从而帮助人们更好地了解微生物的新陈代谢。相关论文5日发表在《自然·微生物学》上。这项技术使研究人员能够在没有任何先验知识的情况下,将微生物与它们产生的新陈代谢特

新技术解读微生物间的“谈话”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517287.shtm

新技术解读微生物间的“谈话”

  美国加州大学圣迭戈分校团队开发了一种新的搜索工具,利用由全球研究人员整理的超过6万种微生物的数据库,可立即将微生物与其产生的代谢物进行匹配,从而帮助人们更好地了解微生物的新陈代谢。相关论文5日发表在《自然·微生物学》上。  这项技术使研究人员能够在没有任何先验知识的情况下,将微生物与它们产生的新

微生物实验大肠杆菌能水解淀粉吗

不能,淀粉水解实验,大肠杆菌没有圈,枯草芽孢杆菌有透明圈,基本说明大肠杆菌不水解淀粉。

重感冒病人患上帕金森氏症的风险是健康人的两倍

  在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过50人的生命(德国范围内),在德国以外的欧洲地区也发现了76名患者。   Harmsen 教授在这

华大智造DNBSEQE5基因测序仪--4.5小时完成病原微生物测序

  7月15-16日,第二届感染性疾病诊断技术创新论坛(IDD)在武汉召开,华大智造携病原微生物高通量测序平台亮相。在论坛上,华大智造官方首次发布了DNBSEQ-E5基因测序仪在科研和实战场景下的一系列使用数据。据悉,DNBSEQ-E5基因测序仪体积小、重量轻、测序速度快、操作简单,大大降低了基因测

DNA测序仪pcr测序反应

  pcr测序反应  (1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  bigdye mix 1μl 1μl  待测的质粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl  待测dna的正向引物 1μl -  

业界对DNA测序公司新技术褒贬不一

  美国佛罗里达州马可岛被奉为基因测序领域的圣地,每年都有大批研究基因测序的公司及科研人员会聚于此,分享最新科技成果。两年前,英国牛津纳米孔技术公司曾宣布,该公司已成功研发出对特定DNA片段进行测序的新技术,但很多人认为该方法并不现实。与其他技术相比,这一技术可以阅读更长的DNA片段(因此有望用于对

Nature子刊:新技术攻克单分子测序大问题

  来自冷泉港实验室(CSHL)的一位定量生物学家及同事们开发出了一种混合错误校正新方法攻克了单分子测序的重大问题,可将长读(long reads)的准确度提高到99.9%。这一研究成果发布在7月1日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。   领导这一研究的是冷