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美用新技术完成炭疽基因组测序

美国乔治亚理工学院科学家使用一种称为RNA测序的新技术,描绘出了炭疽芽孢杆菌的基因表达。公布在最新一期《细菌学》杂志网络版上的此项研究成果,标志着任何细菌转录(细菌表达不同基因时产生的完整信使RNA集合)自此可被全面定义,并为研究细菌如何调控基因表达提供了更多细节。 乔治亚理工学院光电系统实验室的研究人员表示,细菌的基因组测序已是相当普通的事情,但要更深层次地定义其转录是一件非常艰巨的任务。使用传统方法,转录的结构和丰度实际上只能一次一个基因地加以确定,即使是最为广泛研究的物种,要对其进行完整意义上的转录也是遥不可及之事。RNA测序方法使科学家们得以克服传统方法的局限,以非常详细的方式观察B型炭疽基因组的5000多个基因中的每一个基因的表达和调控。 RNA测序方法通过使用一种称为高通测序的技术来实施,可同时对数百万个信使RNA进行测序。虽然这种方法在2008年曾被用来定义一些真核有机体的转录,但其难以适用于细菌,......阅读全文

DNA测序技术的现状和发展(四)

1.1.3.2 模板制备程序完全的体外大规模模板制备工作是达成高通量、低价格测序技术的前提。已广泛使用的乳液PCR扩增技术就是一种很好的方法。不过,由于很难在热循环测序反应中保证乳液微滴的稳定性,因此最开始实验的模板扩增方法是恒温扩增法(isothermal)。乳液PCR不需要借助细菌的帮助就能扩增

中国学者Nature子刊:清冽梅花香

  对于梅花(Prunus mume),中国人寄托了太多的情感,这一早在三千多年前就已经被驯化的植物光是诗词绝句,就可以上万来计算,更别说“梅须逊雪三分白,雪却输梅一段香” 这样的名家名句了。12月27日Nature Communications杂志公布了由北京林业大学,深圳华大基因等处

研究发现为何苍蝇不怕脏

  每个人喜爱的动物大多都不同,但是说到我们最讨厌的昆虫,估计十有八九就是蟑螂,老鼠,苍蝇,屎壳郎之类,这是因为这些昆虫的生活环境和习惯给人一种邋遢脏乱的影响,影响我们的健康。  近期来自美国康奈尔大学的研究人员首次完成了家蝇(house fly,就是常见的苍蝇)的基因组测序,从中发现了这种动物强大

美国立研究委员会发布报告聚焦生物安全

  能否从生物体的DNA判断出其是否具有致病性?这是美国国立研究委员会(NRC)的一个13人小组委员会所面对的一个重要问题。近日,该委员会对此展开了调查。  本周,该委员会公布了一份187页的调查报告,该报告由美国国立卫生研究院(NIH)提供。报告认为,通过一小片DNA来预测潜在危险是否存

《细胞》刊登中文文章介绍中国传染病研究

图注:一种叫Miniopterus schreibersii的蝙蝠(普通长翼蝠)。潘烈文、 Malik Peiris和同事们2005年在这种蝙蝠中发现了第一种蝙蝠冠状病毒。图片提供: C. T. Shek、 香港特别行政区政府鱼农自然护理署。   人口稠密的中国农村地区需要随时提高警惕并且利用

遗传分析走向大众生物学家为解释遗传测序数据开发平台

  我们可以在现场获得可操作信息,从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。  对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说,基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。  两三年前,位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所(NAMRU-6)的医生必须将其测序数据送往美国分析,这一过

计算生物学家为分析解释遗传测序数据开发平台

  我们可以在现场获得可操作信息,从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。  对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说,基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。  两三年前,位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所(NAMRU-6)的医生必须将其测序数据送往美国分析,这一过

湖北新冠病毒检测试剂可先用后申报 这81家企业已可提供

  37、广州赛哲生物科技股份有限公司(400-888-4242)  赛哲成立于2010年,专注于病原微生物检测服务,旨在成为专业从事微生物预防、诊断和精准治疗的集团化企业。  2020年1月20日,赛哲生物对外公布成功批量生产新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒,援助各级医疗卫生机构进

外媒:基因数据是中美较量的新领域

  在美国联邦调查局(FBI),没有很多特工像埃德•尤(Ed You)那样。在这个鼓励工作人员让自己看上去平淡无奇的工作环境中,他那剃得锃亮的光头十分抢眼。尽管他的多数同事都是出了名的口风严密,但尤却是科技会议上健谈的明星,例如西南偏南大会(South-by-Southwest)和拉斯维加斯国际黑客

PLOS ONE报道一种新噬菌体——巨型长尾病毒

  目前,一个国际研究小组,在南部非洲纳米比亚平原的一具斑马尸体中,发现了一种新的巨型长尾病毒(或噬菌体),这种病毒能够感染引起炭疽病的细菌。这种新的噬菌体,最终可能会为检测、治疗或净化炭疽杆菌(anthrax bacillus)及其引起食物中毒的近缘菌种,开辟新的途径。这项研究成果发

巧用CRISPR-CAS9技术发表高分文章

  标题党Dr.S又来啦,不过每次的文章都能收到读者们积极的反馈Dr.S还是很欣慰的,所以再接再厉为大家奉上一个轻松发表高分SCI论文的热门思路。   光使用基因芯片,全基因组关联分析,二代测序等技术进行高通量相关基因筛选就能发表高分文章的时代我们还历历在目,一转眼一场新的革命就要来了。通过前面机

巧用CRISPR-CAS9技术发表高分文章

标题党Dr.S又来啦,不过每次的文章都能收到读者们积极的反馈Dr.S还是很欣慰的,所以再接再厉为大家奉上一个轻松发表高分SCI论文的热门思路。光使用基因芯片,全基因组关联分析,二代测序等技术进行高通量相关基因筛选就能发表高分文章的时代我们还历历在目,一转眼一场新的革命就要来了。通过前面机种方法筛选得

武汉病毒所在芽孢杆菌噬菌体的相关研究中取得系列成果

  芽孢杆菌属(Bacillus)细菌是一类广泛存在的革兰氏阳性菌,其中诸如炭疽芽孢杆菌(B. anthracis)、蜡样芽孢杆菌杆菌(B. cereus)、短小芽孢杆菌(B. pumilus)、苏云金芽孢杆菌(B. thuringiensis, Bt)等为人类、动物、植物或昆虫的病原菌。噬菌体为细

焦磷酸测序(Pyrosequencing)原理

  焦磷酸测序  技术(pyrosequencing)是一种新型的酶联级联测序技术,焦磷酸测序法适于对已知的短序列的测序分析,其可重复性和精确性能与SangerDNA测序法相媲美,而速度却大大的提高。焦磷酸测序技术产品具备同时对大量样品进行测序分析的能力,为大通量、低成本、适

Nature遗传学:化疗推动癌细胞耐药性

  膀胱癌是泌尿系统中最常见的一种恶性肿瘤,构成膀胱的各种组织均可发生癌变。膀胱癌在中国的发病率和死亡率均占泌尿系肿瘤的首位。Nature Genetics杂志发表的一项研究显示,化疗在杀死绝大多数膀胱癌细胞的同时,促使剩余癌细胞发生遗传学演化,由此获得耐药性。  尿路上皮癌是膀胱癌的一种,目前还没

通过模拟细菌DNA实现穿越其限制修饰屏障的新方法

        细菌是存在于自然环境中的一个重要生物类群,参与自然环境碳、氮和硫等元素的循环,另外,细菌在人类的健康与疾病、工业微生物发酵及农业生物病虫害防治等领域也占有重要地位。遗传操作是研究细菌生理功能、致病机理及构建基因工程

版纳植物园番木瓜miRNA研究获进展

  番木瓜(Carica papaya)又称木瓜,是十字花目番木瓜科水果。番木瓜不仅可以作为水果食用,还有重要的药用价值。作为一种重要的热带植物,番木瓜的产量和质量常常受到病虫害的严重影响。其中为害最普遍及最严重的首推由病毒引起的番木瓜环斑花叶病,除此之外,还有10多种真菌病害,如炭疽病、叶斑病

魏文胜:CRISPR功能性筛选新方法

  自2013年Science杂志将CRISPR技术选为年度突破开始,这一新技术就给基因编辑世界带来一场风暴:在过去的这一年半时间里,CRISPR方法已迅速席卷了整个动物王国,成为DNA突变和编辑的一种明星技术。   国内外各大生物实验室的科学家们纷纷尝试利用这种技术进行攻关,近期来自北京大学生命

北京大学Nature发布CRISPR研究重要成果

  来自北京大学的研究人员开发出了一个新型的CRISPR/Cas9 sgRNA文库,提出了一种基于sgRNA文库功能筛查和高通量测序分析的基因鉴别新方法。   论文的通讯作者是北京大学生命科学学院的魏文胜(Wensheng Wei)研究员。其主要研究领域包括病原微生物感染分子机理,发展宿主

《自然》盘点2014年科学界大事件

南极BICEP2 射电望远镜发现引力波———或者是尘埃  2014年或许会因为科学的胜利迅速演变成失望甚至是悲剧而被铭记:干细胞研究和宇宙学研究进展很快受到质疑;商业飞船遭遇重大挫折。然而,探测器登陆彗星、追踪人类起源以及协力了解大脑依然是值得庆祝的原因。  太空竞赛 千帆竞发 

2013年世界科技发展回顾 生物医学领域收获颇丰

美国  遗传学研究深入揭示、利用基因机制;细胞研究让多种细胞互换“身份”;再生医学造出多种器官组织。  田学科 (本报驻美国记者)在遗传学研究领域,杜克大学模仿人体细胞内复杂的基因调控过程,模拟出多种蛋白质如何通过复杂相互作用调控一个基因。  斯坦福大学设计出一种由DNA和RNA制成的生物晶体管——

新一代测序将如何改变法医基因组学

  Bruce Budowle博士是北德克萨斯大学健康科学中心(UNTHSC)应用遗传学研究所的执行主任。自2009年成立以来,该研究所集中了一大批致力于完善遗传学方法的知名科学家,以增强几个研究领域,包括法医DNA。在UNTHSC的法医科学项目(全美只有14个)

菌种保藏中的细菌鉴定方法

作为科研生产中最重要的基础性资源—菌毒种,其收集、保藏及相关的研究工作在我国正处于整理、整合以及全方面逐步正规化阶段.2003年7月23日,科技部在北京召开了“国家科技基础条件平台建设”部际联席会和专家顾问组成立大会,正式启动了国家科技基础条件平台建设工作.国家自然科技资源共享平台建设作为其中的一个

菌种保藏中的细菌鉴定方法

作为科研生产中最重要的基础性资源—菌毒种,其收集、保藏及相关的研究工作在我国正处于整理、整合以及全方面逐步正规化阶段.2003年7月23日,科技部在北京召开了“国家科技基础条件平台建设”部际联席会和专家顾问组成立大会,正式启动了国家科技基础条件平台建设工作.国家自然科技资源共享平台建设作为其中的一个

液相芯片技术的原理与应用进展

   液相芯片,也称为微球体悬浮芯片(suspension array,liquid chip),是基于xMAP(flexible Multi Analyte Profiling)技术的新型生物芯片技术平台,它是在不同荧光编码的微球上进行抗原 抗体、酶 底物、配体 受体的结合

液相芯片技术的原理与应用

液相芯片,也称为微球体悬浮芯片(suspension array,liquid chip),是基于xMAP(flexible MultiAnalyte Profiling)技术的新型生物芯片技术平台,它是在不同荧光编码的微球上进行抗原抗体、酶底物、配体

干货:国内外疫苗行业“现状分析“及”发展预测”

  一、 疫苗的概念及分类  疫苗,是指一切通过注射或黏膜途径接种,可以诱导机体产生针对特定致病原的特异性抗体或细胞免疫,从而使机体获得保护或消灭该致病原的生物制品,包括蛋白质、多糖、核酸活载体,感染因子等。在我国,疫苗分为一类疫苗和二类疫苗。  一类疫苗,是指政府免费向公民提供,公民应当依照政府的

RiboPrinter® 在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用(一)

RiboPrinter® 在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用   梭状芽孢杆菌是一个多样化的革兰氏阳性菌属,专性厌氧,在环境中普遍存在。这个属大约包含了100多个种,基因组内总体的G+C含量范围在22-55%,反映出该属内的细菌在系统进化关系上的巨大差异。 该属内最主要的食源性致病