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天津工生所谷氨酸棒杆菌CRISPR/Cas9基因组编辑获进展

谷氨酸棒杆菌是一个重要的氨基酸生产菌株,其氨基酸产量每年超过400万吨,近年来被广泛用于生产各种天然和非天然产物,预计到2020年其发酵产品市值可达204亿美元。传统的工业菌株主要依赖长期的理化诱变及筛选获得,基因组水平实现快速、高效的理性编辑依然是谷氨酸棒杆菌代谢工程改造的难点。 近日,中国科学院天津工业生物技术研究所系统与合成生物技术研究团队开发了谷氨酸棒杆菌的CRISPR/Cas9基因组编辑工具。该研究通过重构Cas9和gRNA的表达盒,解决了Cas9毒性和gRNA自身转录终止子无法终止的问题,在谷氨酸棒杆菌中实现了基于CRISPR/Cas9的高效反向筛选;采用共转化Cas9和gRNA表达质粒避免了cas9基因的高频突变,成功实现质粒提供模板的高效基因编辑,敲除和插入效率分别高达60%和62.5%,可简化操作并节省时间。此外,该研究团队开发了CRISPR/Cas9和RecT介导的ssDNA重组技术,可以在基因组上精确......阅读全文

天津工生所谷氨酸棒杆菌CRISPR/Cas9基因组编辑获进展

  谷氨酸棒杆菌是一个重要的氨基酸生产菌株,其氨基酸产量每年超过400万吨,近年来被广泛用于生产各种天然和非天然产物,预计到2020年其发酵产品市值可达204亿美元。传统的工业菌株主要依赖长期的理化诱变及筛选获得,基因组水平实现快速、高效的理性编辑依然是谷氨酸棒杆菌代谢工程改造的难点。 质粒

天津工生所谷氨酸棒杆菌CRISPR/Cas9基因组编辑获进展

  谷氨酸棒杆菌是一个重要的氨基酸生产菌株,其氨基酸产量每年超过400万吨,近年来被广泛用于生产各种天然和非天然产物,预计到2020年其发酵产品市值可达204亿美元。传统的工业菌株主要依赖长期的理化诱变及筛选获得,基因组水平实现快速、高效的理性编辑依然是谷氨酸棒杆菌代谢工程改造的难点。   近

天津工生所谷氨酸棒杆菌碱基编辑工具扩展方面取得进展

  基于CRISPR/Cas系统和碱基脱氨酶的碱基编辑技术是近年来发展起来的新型基因组编辑技术,可实现在特定位点的碱基替换,具有不产生双链DNA断裂,无需外源模板且不依赖同源重组修复的优势,极大地丰富了原核生物的基因组编辑方法。   中国科学院天津工业生物技术研究所研究员王猛带领的高通量新分子生

天津工生所谷氨酸棒杆菌利用甘油合成稀少糖研究获进展

  稀少糖是在自然界中存在但含量极少的一类单糖及其衍生物,作为食品添加剂和医药中间体,在诸多领域发挥着重要作用。甘油是生物柴油的主要副产物,可以转化生产为高附加值产品,在微生物合成稀少糖中具有应用价值。  中国科学院天津工业生物技术研究所研究员孙媛霞带领的功能糖与天然活性物质研究团队以谷氨酸棒杆菌为

天津工生所:谷氨酸棒杆菌发酵生产紫色杆菌素

  紫色杆菌素(violacein)是微生物产生的一种代谢产物,属于吲哚衍生物,是非水溶性的蓝黑色色素,由两个色氨酸分子氧化缩合而成,早在19 世纪就已被发现。近年来,随着研究的深入,紫色杆菌素表现出非常重要的生物活性,可以作为潜在的抗肿瘤和抗病毒药物、生物染料和杀虫剂,具有广阔的应用前景。目前常见

工生所谷氨酸棒杆菌发酵生产紫色杆菌素研究获进展

  紫色杆菌素(violacein)是微生物产生的一种代谢产物,属于吲哚衍生物,是非水溶性的蓝黑色色素,由两个色氨酸分子氧化缩合而成,早在19 世纪就已被发现。近年来,随着研究的深入,紫色杆菌素表现出非常重要的生物活性,可以作为潜在的抗肿瘤和抗病毒药物、生物染料和杀虫剂,具有广阔的应用前景。目前常

天津工生所在谷氨酸棒杆菌代谢组研究方面取得进展

  代谢组学可利用胞内代谢物的系统分析,揭示出细胞代谢水平与调控机制,是发现代谢途径代谢瓶颈的有效工具。代谢组的样品制备方法会直接影响提取的胞内代谢物种类与定量信息的可靠性。目前,获得完整准确的胞内代谢组数据仍具有很大的挑战性。   近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员郑平带领的系统与合

天津工生所多元自动化基因组编辑技术研究取得进展

  CRISPR/Cas9系统极大丰富了原核生物的基因组编辑方法。但由于CRISPR/Cas9系统高效的致死筛选能力和原核生物普遍的低同源重组效率,多靶点和自动化的基因组编辑仍难以实现,严重限制了菌株的遗传改造效率。   近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员郑平带领的系统与合成生物技术团

天津工生所在Cas9基因组编辑技术研究中取得进展

  CRISPR/Cas系统是细菌针对噬菌体和质粒DNA入侵进化形成的一种获得性免疫系统,广泛存在于众多原核生物基因中。CRISPR/Cas主要分为TypeI、TypeII和TypeIII三种类型。经过改造的Ⅱ型CRISPR/Cas9系统能够利用RNA介导的DNA靶向功能对多种生物基因组的任意区域

生科院建立高效谷氨酸棒杆菌CRISPR-Cpf1基因组编辑系统

  5月4日,《自然-通讯》(Nature Communications)发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所合成生物学重点实验室杨晟研究组题为CRISPR-Cpf1 assisted genome editing of Corynebacterium glutamicum 的研究