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版纳植物园番木瓜miRNA研究获进展

番木瓜(Carica papaya)又称木瓜,是十字花目番木瓜科水果。番木瓜不仅可以作为水果食用,还有重要的药用价值。作为一种重要的热带植物,番木瓜的产量和质量常常受到病虫害的严重影响。其中为害最普遍及最严重的首推由病毒引起的番木瓜环斑花叶病,除此之外,还有10多种真菌病害,如炭疽病、叶斑病。为了减少损失,目前已经培育了抗特异类型病毒的转基因番木瓜品种。尽管如此,单一的转基因品种仍然无法抵御其他病害的威胁。为了更好从分子水平研究番木瓜,南开大学和美国的研究机构进行的一项大型联合研究,于2008年获得了番木瓜基因组的首个草图。这个草图拼出了90%的番木瓜基因编码序列。 miRNA是一类21个核苷酸左右的小分子,它可以直接负调控其靶基因的表达。研究表明,植物miRNA参与了生长发育,营养代谢,生物和非生物逆境等多方面的功能。结合已有的小RNA深度测序结果于基因组序列,利用生物信息学技术手段,中科院西双版纳热带植物园植物......阅读全文

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术

  microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术   摘要:   已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分

miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困

帕博利珠单抗用于MSI-H/dMMR各类瘤种疗效

  创伤性股骨头坏死(TIONFH)是髋部创伤后引起的严重并发症,股骨颈骨折是最常见的原因,因此股骨颈骨折后早期筛查和诊断TONFH尤为重要。有研究发现,骨细胞、血管内皮祖细胞和血液流变学等异常改变与TIONFH相关,TIONFH患者体内微小核糖核酸(miRNA)表达谱也呈现出显著特异性改变。表明m

科研中的“新星”技术——MicroRNA荧光定量PCR

Micro RNA简介微小RNA(microRNA,简称miRNA)是生物体内源长度约为20-23个核苷酸的非编码单链小分子RNA,通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致mRNA的降解或翻译抑制。是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶

案例分享: Agilent miRNA芯片在各类样本中的应用

  1.新鲜组织样本   新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机

案例分享: Agilent miRNA芯片在各类样本中的应用

  1.新鲜组织样本   新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的,经患者或健康人同意后,从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织,或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机

miRNA海绵—长效抑制miRNA

随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么

miRNA检测的三种方法

MicroRNA  (miRNA)是一种机体内源性表达的单链小分子RNA,位于基因组非编码区,本身不具有开放阅读框(open reading frame,ORF),具有高度保守性,时序性和组织特异性。miRNA广泛存在于各种真核细胞中,不编码任何蛋白质,长度仅为20~24nt。成熟

miRNA的qPCR检测

测序技术的引入促使miRNA研究领域进入快速发展阶段,然而qPCR仍是验证测序数据的重要标准。本文将为您介绍使用qPCR进行miRNA分析的基本要点,希望能帮助新人快速入门。什么是miRNA?miRNA是一类小的非编码RNA,能够与RNA诱导沉默复合物(RISC)结合,通过作用于mRNA,进而介导转

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

研究揭示microRNA抑制mRNA表达新机制

  为了让基因中包含的指令最终在体内发挥某些功能,构成基因DNA序列的核苷酸或者说碱基必须被读取并用于产生信使RNA(mRNA)。所产生的mRNA随后必须翻译成功能性的蛋白。细胞内的许多不同途径会影响这一重要的生物学过程,决定着基因是否、何时以及在多大的程度上表达。一类主要的调节因子是microRN

血清中 miRNA 抽提和实验设计经验谈

人体内的血液循环系统犹如印度的圣河 – 恒河,河水中携带的养分滋养着古老的大地;洗涤带走地上的ㄧ切污秽,人们的一生都在河水中完成。如此的恒河可以想象,河水中充斥着各种物质,有废物有养分,只要你想都可以从河水中捞取。同样的我们的循环系统如同恒河;流动的血液如同恒河水,身体所需的ㄧ切由血液运送,身体

miRNA与癌症:了解它们之间的关联

  在肿瘤发生的经典模型中,癌症通过慢慢积累突变、放任细胞增长而发生。许多这样的突变影响关键的调控蛋白,如原癌基因和抑癌基因。不过,非编码RNA基因的突变也同样有害,尤其是microRNA。  microRNA(miRNA)是一类22个核苷酸的调控转录本。它们与mRNA靶点相结合,或抑制其翻译,或诱

RIP 技术--研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

  microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。   miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA

RIP 技术--研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

  microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。   miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA

RIP技术研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合到核糖核

汪阳明组“miRNA与sgRNA联姻”打造基因编辑体系控制新平台

  miRNA是一类长度约22个碱基的核糖核酸分子,广泛表达于植物,动物以及病毒中。miRNA通过与Argonaute (AGO)等蛋白形成RNA诱导沉默复合物(RNA Induced Silencing Complex,RISC),在转录后水平抑制基因表达【1,2】。其表达谱呈现细胞特异性【3】,

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术(五)

TaqMan miRNA的检测能力不同,是依据采用let-7a, let-7b, let-7c, let-7d 和let-7e 5个合成miRNA来检测低至一个核苷酸(图7)。每个miRNA的检测对应每个miRNA。相对探测效率是通过计完全匹配和不匹配的目标CT之间的差异,假设完美匹配的效率为1

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

  血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。

miRNA和siRNA简介及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术(一)

摘要:已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分相关的甚至低至一个核苷酸的miRNAs。此外,他们不会受到基因组DNA

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

  血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。

外泌体miRNA或将更适合结肠癌早期诊断

  结肠直肠癌(CRC)是全球诊断率排名第三的消化道恶性肿瘤。2018年,约有881,000人死于CRC。据统计,超过70%的CRC位于结肠,也就是结肠癌(CC)。CC在北美、欧洲和澳大利亚等地区的发病率和死亡率非常高。近年来,亚洲国家CC的发病率也逐年递增,CC的诊断和治疗已成为全球关注的热点问题

miRNA的特征、功能及识别方法等详解(二)

miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs——lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA 3’非编码区端,以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制,进而抑制蛋白质合成,阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3’非编码区有部分同源

miRNA影响椎间盘退变的机制研究进展

  在当今社会,腰痛(LBP)患者数量庞大,LBP患者也因此饱受病痛折磨,椎间盘退变(IDD)作为LBP的最主要病因,其发病机制十分复杂,目前已知的就有基因、年龄和包括职业因素、吸烟、酗酒在内的一些不良生活习惯等因素。据统计,作为腰痛的主要病因的IDD疾病一年会给全球的经济造成超过700亿欧元的损失

miRNA的特征、功能及识别方法等详解(三)

2) miRNA的靶基因预测方法 miRNA的研究意义之重大是毋庸置疑的。然而,与新的miRNA的频频发现相比,miRNA的功能研究相对缓慢。到目前为止,在发现的4449多个miRNA中,确定功能的miRNA仅有几十个。导致miRNA功能研究进展缓慢的非常重要的原因是miRNA的作用靶标难

miRNA功能分析的五点建议

  随着microRNA(miRNA)研究的深入,很多人开始从miRNA的发现转入功能分析。miRNA抑制是一种确定miRNA功能的强大技术。如何开展,需要注意些什么?Exiqon公司的专家给出了五点建议。   1. 选择合适的抑制剂   若希望miRNA功能分析成功,首先要选择一个最适合您实验

上海生科院利用STTM技术发现水稻miRNA的新功能

   5月1日,《美国科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Short tandem target mimic rice lines uncover functions of miRNAs in regulating importan

RIP 技术——研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具 一

microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合