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计算生物学所研究人员在理论群体遗传学取得重要成果

如何可靠地检测新近发生的正选择?上海生命科学研究院计算生物学所李海鹏研究员的最新研究成果实现了20年来理论群体遗传学的一个梦想。 正选择是一个重要的进化力量,它使得携带某个突变的个体相对于不携带这个突变的个体来说有生存和繁殖上的优势。正选择作为一种重要的进化力量,不仅在野生群体和现代人类的进化过程中扮演重要的角色,而且在家养动植物的驯化过程中(例如稻米、狗和猪)均起着决定性的作用。虽然我们无法回到过去,但是在最近1至10万年里发生的正选择事件通常都会在生物体的基因组里留下些蛛丝马迹。所以我们可以检测到这些正选择事件并且定位造成这些适应性进化的突变,进而为研究这些突变的功能开启大门。最终,我们希望通过这些研究来探索进化的根本奥秘——适应性进化的生物学机制。 然而,在检测这些正选择事件的时候,人们发现所研究对象的群体数量在过去几万年里很可能在不断发生变化,这种群体数量的变化造成了相关检验方法(neutr......阅读全文

北京基因组所实现对大样本全基因组数据的群体遗传学分析

  计算基因组学旨在发展理论和方法学,对基因组数据进行数据挖掘、提取信息。其中对遗传多态性,如基因频谱、单倍型结构等进行建模,利用群体基因组水平的遗传变异数据来推断群体的历史和变迁是群体遗传学的核心内容。传统的群体遗传学分析方法通常基于小样本数据,所推断的多为相对古老的历史事件,例如,被广泛应用的L

浙大教授Nature子刊:水稻基因组重测序及群体遗传学研究

  浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,中国水稻研究所的研究人员发表了题为“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章,以杂草稻群体为材料,通过基因组

群体基因组分析发表Nature子刊

  脂肪有着顺滑的口感,香甜的味道和充足的饱腹感,很多动物对脂肪都垂涎三尺,人类也不例外。但是,我们知道摄入脂肪太多会影响心血管健康,所以对冰淇淋和油炸食品等富含脂肪的食物需要浅尝而止。可是,总有些人无论吃多少高脂肪的食物,也不会得心血管疾病。为什么呢?  研究人员找到了罗伯塔莫斯(Mylopota

“中国三种野生稻群体遗传学和保护遗传学”项目通过鉴定

  由中国科学院昆明植物研究所高立志研究员主持的“中国三种野生稻的群体遗传学和保护遗传学”研究项目,近日由云南省科技奖励办公室组织同行专家进行了科技成果鉴定。该项研究较全面地考察了我国三种野生稻的濒危状况,揭示了中国三种野生稻群体遗传结构特征,深化了原生境保护和资源收集保存的认识,为我

上海生科院《Genome Res》生物信息学新成果

  十月十三日,国际基因组研究权威刊物《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所(中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所)的一项最新研究,题为“A probabilistic method for testing and estimating sele

遗传学家、生物统计学家李景均先生其人其书及其精神

今年是遗传学家、生物统计学家李景均先生著作的英文版《群体遗传学导论》一书出版70周年。该书是中国现代史上迄今为止极少数在中国出版但在西方某个科技领域产生重大影响的专业书。绝大多数新中国成立后出生的人可能都不知道李景均是谁。在美留学的大陆学生,除非所学专业和人类遗传学有关,恐怕大多数也不知道李景均是谁

我国科学家发明新近发生自然选择检测新方法 解20年难题

  如何可靠地检测新近发生的自然选择?新华社记者8月31日从中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所了解到,李海鹏研究员的最新研究成果,圆了这个理论群体遗传学界20年来的梦想。  研究人员介绍说,在生命的进化过程中,达尔文的自然选择是一种重要的进化力量,它使得携带某个突变的个体相对于不

计算生物学所研究人员在理论群体遗传学取得重要成果

  如何可靠地检测新近发生的正选择?上海生命科学研究院计算生物学所李海鹏研究员的最新研究成果实现了20年来理论群体遗传学的一个梦想。   正选择是一个重要的进化力量,它使得携带某个突变的个体相对于不携带这个突变的个体来说有生存和繁殖上的优势。正选择作为一种重要的进化力量,不仅在野生群

细胞遗传学——比较基因组杂交(CGH)

·         Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are

著名遗传学家:用CRISPR重塑基因组

  美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表的一项研究显示,用CRISPR/Cas9修饰垃圾DNA中的一个碱基,会改变基因组大量片段的折叠方式。这意味着CRISPR/Cas9有望用于治疗以基因组错误折叠为特征的疾病。  “实施靶向性手术可以重塑人类基因组,精确控制其折叠形式,”文章的通讯作者,Baylo