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生化与细胞所等在生物学通路分析方法研究中取得新成果

许多基因组学的工作常常涉及到这样的问题:哪些通路可能参与了所研究的生物学过程?近年来,围绕这一问题,已经发展出了大量的生物信息学分析方法,尤其是基于基因表达谱数据的生物学通路分析方法。 相关工作常常是利用经典的通路数据库(如KEGG,Biocarta和Gene Ontology 等)对基因表达谱数据进行统计学分析,以得到在特定的生物学过程中发生显著变化的通路。在这些方法中,用于分析的生物学通路往往被简化成一系列基因的简单集合,而忽略了特定通路中不同基因之间潜在的功能联系。这种将复杂的生物学通路简化为简单的基因集合的处理对于生物信息学分析方法的建立是非常有利的,但忽略基因之间的功能联系显然不利于更加准确地评估相关通路的改变。 9月6日,Cell Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所季红斌研究组和复旦大学生命科学学院田卫东研究组合作完成的生物学通路分析方法上的最新研究成果。该工作是博......阅读全文

计算生物学所量化生物学平台正式投入运行

  近日,中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所量化生物学平台(Omics Core)正式投入运行。平台配备有Illumina HiSeq 2000测序系统和相关仪器设备,该测序系统将文库DNA/cDNA片段附着到特殊处理的光学透明玻璃表面(即Flow cell),并采用可逆终止法边

国际植物细胞壁生物学微型研讨会在遗传发育所举行

  为促进学术交流,由植物基因组学国家重点实验室主办的国际植物细胞壁生物学微型研讨会于10月22日在中国科学院遗传与发育生物学研究所举行。会议特邀美国能源部Great Lake生物能源研究中心主任、密歇根州立大学杰出教授Kenneth Keegstra;澳大利亚科学院院士、墨尔本(Me

养细胞的细胞生物学

一、体内、外细胞的差异和分化1、差异:细胞离体后,失去了神经体液的调节和细胞间的相互影响,生活在缺乏动态平衡的相对稳定环境中,日久天长,易发生如下变化:分化现象减弱;形态功能趋于单一化或生存一定时间后衰退死亡;或发生转化获得不死性,变成可无限生长的连续细胞系或恶性细胞系。因此,培养中的细胞可视为一种

细胞生物学词汇--细胞运动

细胞运动:指包括细胞表现出的所有运动,诸如细菌的鞭毛运动;变形虫、白血球等的变形运动;草履虫等的纤毛运动;眼虫和精子等的鞭毛运动;植物细胞的原生质流动和粘菌变形体的原生质流动;平滑肌和横纹肌的收缩;细胞分裂时染色体的移动和细胞质的凹陷等。

培养细胞的细胞生物学

 培养基试剂盒基本概念通常,体外培养的生物成分无外乎两种结构形式:其一是小块组织或称为组织块(tissue block),一般称为外植块;其二是将生物组织分散后制成的单个细胞,一般称为分离的细胞(isolated cell)或者分散的细胞(dissociated cell)。分散的过程通常在培养液或

细胞生物学概念

   细胞生物学是在显微、亚显微和分子水平三个层次上,研究细胞的结构、功能和各生命规律的一门科学。细胞生物学由Cytology发展而来,Cytology是关于细胞结构与功能(尤其是染色体)的研究。现代细胞生物学从显微水平,超微水平和分子水平等不同层次研究细胞的结构、功能及生命活动。在我国基础学科发展

皮肤细胞生物学

研究人员对这种常见的细胞了解的越来越多,比如这个通常被称为人体zui大器官的部位如何形成、如ELISA试剂盒 何修复、如何对疾病作出反应,又是如何进行触觉感知,以及与微生物沟通的。不过还是存在不少问题,如譬如状况,伤口形成,疾病关联等等。   如何随着各种技术的进步得以发现,这些技术包括活细胞成像和

生化与细胞所揭示MHF复合物发挥生物学功能的分子机制

  2月7日,《细胞》子刊《结构》(Structure)报道了中科院上海生科院生化与细胞所丁建平组、周金秋组关于MHF复合物的最新研究成果。   范可尼贫血症(Fanconi anemia,FA)是一种遗传性血液系统疾病,患者除骨髓造血功能障碍导致全血细胞减少外,还伴有多发性先天畸形,并易患多

水生所揭示卵母细胞特异的H2A变体的生物学作用

  卵母细胞特异的组蛋白变体虽已被建议在早期胚胎发育中行使了重要功能,但其确切的证据及其生物学作用目前还不清楚。   最近,中国科学院水生生物研究所桂建芳研究员学科组在2009年从鱼类中鉴定出一个新的卵母细胞特异的H2A组蛋白变体(Biology of Reproduction, 81:

生化与细胞所等在生物学通路分析方法研究中取得新成果

  许多基因组学的工作常常涉及到这样的问题:哪些通路可能参与了所研究的生物学过程?近年来,围绕这一问题,已经发展出了大量的生物信息学分析方法,尤其是基于基因表达谱数据的生物学通路分析方法。   相关工作常常是利用经典的通路数据库(如KEGG,Biocarta和Gene Ontology 等)对