植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（二）
2. 在平板仪器上进行 IPG-IEF ( Multiphor ll Unit)满足下列条件时，水化后的 IPG 胶条可以直接放在 IEF 仪器的冷却板上：① 如果运行时间不超过 12 h ( 经常发生在宽的或中等 pH 范 围 IPG，如 IPG 3~10 或 4~7 ) 。② 如果 pH 梯度不超 过 pH 10. 0。③ 如果只用杯上样的方法加很小体积的样品 ( 20 μl ) [ 3，22 ]。使用 Immobiline 干胶条试剂盒中的上样杯更方便进行大体积的样品上样( 直至 100 μl )。当用干胶条试剂盒进行 IEF 时，IPG 胶条可以用硅树脂油或干胶条覆盖油覆盖。当样品为极端碱性（pH > 10.0 ) 蛋白质或用窄 pH 梯度（ pH 范围< 1 单位）进行微量制备电泳时必须用覆盖油等覆盖；而当 pH 范围较宽且 pH 梯度不超过 pH 10.0 ( 如 IPG ......阅读全文
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（二）
2. 在平板仪器上进行 IPG-IEF ( Multiphor ll Unit)满足下列条件时，水化后的 IPG 胶条可以直接放在 IEF 仪器的冷却板上：① 如果运行时间不超过 12 h ( 经常发生在宽的或中等 pH 范 围 IPG，如 IPG 3~10 或 4~7 ) 。② 如果 pH 梯
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验
试剂、试剂盒尿素裂解溶液 IPG 干胶条水化液
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验
试剂、试剂盒尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材等电聚焦仪IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤3.1 第一向：在 IPG 胶条中进行等电聚焦（ IPG-IEF)采用 IPG ( IPG
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（四）
3.3 第二向：多重垂直 SDS-PAGESDS-PAGE 可以在水平或垂直系统上进行 [29] 。水平设备适用于预制胶（ExcelGel SDS；Amersham Biosciences/ GE Healthcare) 。而垂直系统则应用于多块胶平行进行的电泳中，尤其是大规模的蛋白质组分析
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（三）
使用 IPGphor 进行 IEF 的典型工作条件见表13-2和 表 13-3 。正如前文指出的那样 ，为了使高分子质量的蛋白质更好地进入聚丙烯酰胺胶内，水化时应在胶条两端加低电压（30~50 V ) ，否则将给水化上样造成困难[ 15，28] 。然后电压逐步升高至 8000 V。如果 IP
植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验（一）
试剂、试剂盒 尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材 等电聚焦仪 IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤 3.1 第一向：在 IPG 胶条中进行等电聚焦（ IPG-IEF)采用 IPG (
蛋白质组的双向凝胶电泳技术介绍
双向凝胶电泳技术与质谱技术是目前应用最为广泛的研究蛋白质组学的方法。双向凝胶电泳技术利用蛋白质的等电点和分子量差别将各种蛋白质区分开来。虽然二维凝胶电泳难以辨别低丰度蛋白，对操作要求也较高，但其通量高、分辨率和重复性好以及可与质谱联用的特点，使其成为目前最流行、可靠的蛋白质组研究手段。双向凝胶电
植物蛋白质组学和糖基化实验（二）
刀豆球蛋白 A (ConA)- 过氧化物酶方法（根据参考文献 20 修改的方法)。( 1 ) 通过 1D 或 2D 电泳分离，并转移到硝酸纤维素膜上。( 2 ) 用 TTBS 缓冲液浸泡印迹膜 1 h。( 3 ) 将印迹膜在含有 ConA ( 25 μg/ml）的 TTBS 缓冲液中，室温下温育 2
双向凝胶电泳技术的分离蛋白质组所有蛋白测定
分离蛋白质组所有蛋白的两个关键参数是其分辨率和可重复性。在目前情况下，双向凝胶电泳的一块胶板（16cm×20cm）可分出3～4千个，甚至1万个可检测的蛋白斑点，这与10万个基因可表达的蛋白数目相比还是太少了。80年代开始采用固定化pH梯度胶，克服了载体两性电解质阴极漂移等许多缺点而得以建立非常稳定的
蛋白质组学研究中的核心技术—双向凝胶电泳
人类基因组计划与美国塞莱拉遗传信息公司于 2001 年在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布，他们绘制出了准确、清晰、完整的人类基因组图谱，至此，人类基因组计划已基本完成，随着后基因组时代的到来，蛋白质组学得到了空前的发展，蛋白质组研究旨在揭示基因表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和
蛋白质组学研究中的核心技术—双向凝胶电泳
许华林 张曼人类基因组计划与美国塞莱拉遗传信息公司于 2001 年在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布，他们绘制出了准确、清晰、完整的人类基因组图谱，至此，人类基因组计划已基本完成，随着后基因组时代的到来，蛋白质组学得到了空前的发展，蛋白质组研究旨在揭示基因表达的真正执行生命活动的全部蛋白质
蛋白质组学研究中的核心技术——双向凝胶电泳
人类基因组计划与美国塞莱拉遗传信息公司于 2001 年在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布，他们绘制出了准确、清晰、完整的人类基因组图谱，至此，人类基因组计划已基本完成，随着后基因组时代的到来，蛋白质组学得到了空前的发展，蛋白质组研究旨在揭示基因表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规
蛋白质组学研究中的核心技术—双向凝胶电泳
人类基因组计划与美国塞莱拉遗传信息公司于 2001 年在美国《科学》杂志和英国《自然》杂志联合宣布，他们绘制出了准确、清晰、完整的人类基因组图谱，至此，人类基因组计划已基本完成，随着后基因组时代的到来，蛋白质组学得到了空前的发展，蛋白质组研究旨在揭示基因表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的
植物蛋白质组学和糖基化（二）
4. 注释( 1 ) 每个实验均使用新鲜的 3 mol/L 甲醇- HCl 和硅烷化试剂。( 2 ) 要仔细识别蛋白质印迹，因为 WGA 既能识别 N-糖苷的 GlcNAc，也能识别 O-GlcNAc。( 3 ) 用于在硝酸纤维素印迹膜上封闭结合位点的溶液应避免糖蛋白污染。所以我们建议在这一步骤中使
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究实验
顽拗性植物组织的蛋白质组学研究（苯酚法提取蛋白质）实验材料植物组织 试剂、试剂盒苯酚
蛋白质组学在植物科学研究中的应用
1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记，如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen
植物蛋白质组学和糖基化实验
实验材料链霉亲和素-过氧化物酶 牛胰核糖核酸酶 B
质谱在蛋白质组学中的应用实验
实验材料 冷冻干燥样品试剂、试剂盒 校准标准品基质溶液甲醇仪器、耗材 MALDI 质谱仪MALDI 板实验步骤 1.吸取 0.5ul 的基质溶液，加到 MALDI-MS 分析所用的金属样品板上的样品孔中（为了准确起见，请使用2ul 的移液器）。2.在基质干燥之前，迅速加入 0.5ul 的标准品或样品
质谱在蛋白质组学中的应用实验
方案1 蛋白质和多肽 MALDI-MS 分析的一般方法 方案2 反相微型层析柱的制备实验 方案3 固定化酶微型层析柱的制备 方案4 用于蛋白质组分析的微毛细管 HPLC 色谱及 ESI —体化装置的制备和使用 方案5 利用 Nano-LC
实质等同性（蛋白质组学）实验（二）
3.2 等电聚焦（IEF)各种长度（如 7 cm、13 cm、18 cm、24 cm ) 和不同 pH 范围的固定化 pH 梯度 ( IPG ) 胶条可供使用。IPG 胶条常在 20℃ 下（温度低于 20℃ 可导致尿素结晶）于适量水化液中水化过夜（16 h ) 。这可在溶胀托盘 （ re-s
植物蛋白质组学和糖基化实验（四）
3.3 我的糖基化蛋白在哪实验人员可通过这个方法获得关于糖苷在蛋白骨架上的分布及糖苷本身的结构信息。这类实验可在纯化的糖蛋白或者从 1D 或 2D 电泳胶上分离出来的蛋白上进行，首先，用蛋白内切酶消化蛋白质，通过高效液相色谱（HPLC) 分离消化后的肽和糖肽混合物。对含有糖苷的收集组分进行糖
植物蛋白质组学和糖基化实验1
实验材料链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白的总糖
植物蛋白质组学和糖基化实验（五）
1. 含高甘露糖型 N-糖苷糖蛋白的鉴定本方法是我们实验室以油菜籽为实验材料建立的，本方法也适用于其他植物材料。( 1 ) 将 6 g 植物材料放入 4°C 预冷的研钵中，加入 50 ml 预冷的 TBS 缓冲液，研磨萃取蛋白质（见注释 13)，接着 10000 g 离心萃取物 30 min，去
植物蛋白质组学和糖基化实验（一）
实验材料 链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒 DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤 3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白
植物蛋白质组学和糖基化实验2
3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷（见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析，将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较，电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据（见注释 11)。( 1 ) 将 1
植物蛋白质组学和糖基化实验（三）
3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷（见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析，将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较，电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据（见注释 11)。( 1 ) 将 1
植物学实验——茎（二）
【目的】掌握双子叶植物 茎的次生结构，了解周皮的发生和组成，掌握单了叶植物茎的结构。 【实验内容】（一）双子叶植物茎的次生构造：椴树茎1，2，3年木槿茎徒手切片（二）周皮的发生和组成天竺葵茎接骨木的皮孔（三）单子叶植物茎的结构小麦玉米茎的次生结构维管形成层的产生：束中形成层：原形成层转变而成 束
双向凝胶电泳法在分离蛋白质组所有蛋白实验中的应用
分离蛋白质组所有蛋白的两个关键参数是其分辨率和可重复性。在目前情况下，双向凝胶电泳的一块胶板（16cm×20cm）可分出3～4千个，甚至1万个可检测的蛋白斑点，这与10万个基因可表达的蛋白数目相比还是太少了。80年代开始采用固定化pH梯度胶，克服了载体两性电解质阴极漂移等许多缺点而得以建立非常稳定的
iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程（二）
“那iTRAQ的原理是什么，有哪些优势？”“iTRAQ（Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation）技术由美国AB SCIEX公司研发，最早于2004年美国质谱年会上被提出，是一种基于体外等重同位素标记的相对定量技术。该技术利用同
简述双向凝胶电泳技术的第二向分离
SDS．聚丙烯酰胺凝胶电泳 双向电泳的第二向是将IPG胶条中经过第一向分离的蛋白转移到第二向SDS．PAGE凝胶上，根据蛋白相对分子质量或分子量(MW)大小与第一相垂直的分离。 蛋白质与十二烷基硫酸钠(SDS)结合形成带负电荷的蛋白质．SDS复合物，由于SDS是一种强阴离子去垢剂．所带的负电