二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测序技术对铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因进行鉴定和系统分析，新发现了一批的野生大豆miRNA和其作用的靶基因*。该研究成果发表在10月刊的BMC Plant Biology上。 MicroRNA（miRNA）是一类调控真核生物广泛生理过程的内源性非编码小RNA，它的调控作用是通过降解靶mRNA或是阻碍其翻译来实现。植物miRNA通常与其靶基因完全或是近乎完全匹配，引起mRNA的降解。在植物中，miRNA参与调控发育全过程以及对生物或非生物胁迫的应答。要确定miRNA的功能就必须首先鉴定它们的靶基因。降解组测序是近来兴......阅读全文
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代
BMC－Plant－Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，
江苏农科院：miRNA调控茄科抗盐胁迫
茄科包括许多重要的蔬菜作物，它们经常遭受盐胁迫。microRNA（miRNA）已被发现参与调控植物的基因表达来应答盐胁迫。然而，几乎没有关于茄科植物miRNA参与此类应答的报道。由江苏省农业科学院蔬菜研究所庄勇副研究员领衔的课题组采用小RNA测序技术对此展开了深入分析，研究成果发表在近期的Int
四川农大：揭示miRNA调控玉米穗发育机制
microRNA(miRNAs)是一类内源性的非编码小RNA，在植物的多种生理过程中发挥重要调控作用，包括代谢，激素反应，转座子的表观遗传控制，胁迫应答。在模式植物如水稻和拟南芥中已进行了广泛的miRNA研究。在玉米中，胁迫应答相关miRNA和其靶基因的研究也已开展过很多。然而，关于miRNA参
二代测序及其应用
二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。二代测序应用如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454：油包
二代测序及其应用
二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。二代测序应用如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454：油包
miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA）参与
华南农大：miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA
南师大：联合分析鱼类缺氧适应机制
瓦氏黄颡鱼（Pelteobagrus vachelli）是亚洲知名的经济鱼类。然而，突然缺氧会导致其死亡。研究鱼类缺氧适应的分子机制，不仅有助于理解鱼类物种和缺氧信号通路的演变，也将指导缺氧耐受鱼种的培育。尽管如此，对于鱼类miRNA与mRNA的基因调控网络，以及缺氧应答相关的信号通路仍然知之甚
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果，但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子，在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
科学家通过对野生大豆基因研究发现新型耐盐基因
由香港中文大学、华大基因等单位联合完成的野生大豆W05的全基因组测序工作，通过对野生大豆重要农业性状关联基因研究，发现了新的耐盐基因。7月10日，最新研究成果于《自然通讯》杂志在线发表。 大约6000至9000年前，我国就开始进行野生大豆的驯化。驯化过程中，大豆的栽培种丢失了很多与环境适应相关
测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA
什么是基因二代测序
第二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序（Sequencing by Synthesis），即通过捕捉新合成的末端的标
中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼
我国科学家获多年生野生大豆高精度基因组图谱
日前，国际植物学领域著名期刊《自然—植物》在线发表了山东农业大学张大健教授课题组在大豆基因组研究领域取得的新成果。该团队首次获得了多年生野生大豆的高精度基因组图谱，填补了大豆属泛基因组的空白，解析了大豆进化历程，高效准确挖掘了大豆基因组的结构变异，拓宽了大豆分子育种可利用的基因资源，为大
单基因检测和二代测序
在肺癌患者中，有一批携带驱动基因突变的患者，在治疗上可以针对突变的基因采用靶向治疗。在预后上，这部分患者也往往具有较长的生存期。目前，指南推荐了9个靶向治疗的相关基因，他们分别是：EGFR、ALK、ROS1、Her2、KRAS、MET、RET、BRAF和最近一年刚进入指南的NTRK基因。为了识别这一
第二代基因测序的意义
基因测序只是基因检测的方法之一，其又叫基因谱测序，是国际上公认的一种基因检测标准。 基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要孕妇5毫升血，通过化验血液中甲型胎儿蛋白（AFP）、人类绒毛膜促性腺激素（β-hCG）的浓度，就可以算出胎儿出现唐氏综合征的危险性。最近公众关注的H7
二代测序技术
人们常说“事后诸葛亮”，可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力，天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种，不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面：1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文，但是这些中国话想表达什么听
二代测序原理
第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（Seque
大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，华夏始祖将野生大豆驯化，变成今天的“五谷”之一。而今，一项被称为“大豆回家”的基因组研究计划在其故乡中国取得突破。 11月15日，由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、中国农业科学院等单位合作完成的《31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和
青岛能源所在植物miRNA合成调控领域取得进展
在不同的生长发育阶段和受到外界生物、非生物胁迫时，生物体需要精细地调控基因的表达水平。近年来，microRNA (miRNA)在基因精细调控中的作用越来越被重视。miRNA在真核生物中普遍存在，是21-24个核苷酸的非编码小RNA分子, 通过负调控mRNA靶基因的转录后表达水平影响动植物的生长发
－达安基因：发力第二代基因测序产品
7月2日，国家食品药品监督管理总局首次批准注册的第二代基因测序诊断产品。基因测序随即受到市场热捧，基因测序领域龙头企业的达安基因随后也公告了公司第二代基因测序诊断产品“高通量测序仪及试剂医疗器械”注册申请进展。 公告显示，“半导体测序系统”已完成注册检验及临床试验，并已向广东省食品药品监督管理
SMA1基因调控miRNA合成－－改善产量品质和环境适应性
近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所李胜军研究组与中科院遗传发育所李云海研究组、内布拉斯加大学于彬实验室合作，利用生物化学、分子生物学和遗传学的手段，鉴定了SMA1调控miRNA合成的重要功能。 该研究首次揭示了SMA1基因调控miRNA合成的新功能，也将为利用生物技术的手段改善农
《cell》：miRNA是逆境的捍卫者？
现有许多数据说明microRNAs (miRNAs) 除了在发育方面的重要作用以外，在许多逆境应答（stress responses）中也扮演了重要角色。让人惊讶的是miRNAs这一通常抑制靶基因转录表达的小分子，也许在逆境中成为了表达的激活因子，其中的机制也许就是通过逆境中，miRNA/Argon
二代基因测序试点单位在试什么？
导读：2015年4月，卫计委公布了二代基因测序共20家试点单位，虽然试点单位已经确定，但行业内部依然处于迷茫阶段。究竟什么样的基因测序服务才是临床和患者最需要的？临床医生对于二代测序又持怎样的态度？ 2014年初，国家卫计委和食药监督管理总局共同出台文件叫停二代基因测序服务，并着手推进试点工
IDT收购密歇根二代基因测序前处理大厂
IDT收购Swift Biosciences公司，该公司专注于开发学术、转化和二代临床测序(NGS)的前处理研究。 将IDT的高质量NGS产品与Swift Biosciences公司前处理产品的组合，为科学家提供了更高效研究的方案。 据美国商业新闻社讯，Integrated DNA Te
甘肃农业大学：光刺激下miRNA对土豆次级代谢的影响如何
光是影响土豆代谢途径和刺激其产生次生代谢物的一个重大的环境因素。光诱导马铃薯引发的代谢途径和生理功能的自适应改变，在一定程度上反应了基因表达的变化。土豆转录水平上的次生代谢途径一直得到广泛的研究，但microRNA（miRNA）转录后调控机制研究却少之又少。甘肃农业大学张金文课题组，运用miRNA测
华南植物园：荔枝果实衰老受miRNA调控
荔枝色泽鲜艳，营养丰富，具有较高的商业价值。然而，在采收后1-2天内荔枝就会变质，主要体现为果皮褐色。调控荔枝果实衰老的因素很复杂。MicroRNAs作为负调控因子参与了几乎所有的生理过程。在最新的一项研究中，中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室从miRNA水平探究了荔枝果实衰