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生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用

随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能,阐明不同层次多基因协同作用的机理,进而在人类重大疾病如癌症、心血管疾病的发病机理、诊断治疗、药物开发等方面的研究发挥巨大的作用。它将大大推动人类结构基因组及功能基因组的各项基因组研究计划。生物信息学在基因组学中发挥着重大的作用, 而另一项崭新的技术——基因芯片已经成为大规模探索和提取生物分子信息的强有力手段,将在后基因组研究中发挥突出的作用。基因芯片与生物信息学是相辅相成的,基因芯片技术本身是为了解决如何快速获得庞大遗传信息而发展起来的,可以为生物信息学研究提供必需的数据库,同时基因芯片的数据分析也极大地依赖于生物信息学,因此两者的结......阅读全文

生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用

随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能

生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用

   随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能,

基因芯片技术在疟疾研究中的应用

随着人类基因组( human genome p roject, HGP) 、多种模式生物(model organism)和部分病原体基因组测序的完成,基因序列数据以前所未有的速度不断增长。传统实验方法已无法系统地获得和诠释日益庞大的基因序列信息,研究者们迫切需要一种新的手段,以便大规模、高通

OsAGAP在拟南芥中的功能分析

实验概要本实验对水稻小G蛋白ArfGTPase激活蛋白OsA GAP在拟南芥中的功能进行了分析,首先构建了OsAGAP在拟南芥中的正义表达载体,利用农杆菌介导的真空抽滤法转化拟南芥,筛选拟南芥阳性苗,然后用组织PCR和 Southern杂交做了检测。实验材料1. 所用拟南芥((Arabidopsis

基因芯片技术在疟原虫研究中的应用

  基因芯片技术的出现有力地促进了人们对疟原虫生物学的认识。早在2000年,恶性疟原虫的基因组测序尚未完成, Hayward等根据恶性疟原虫绿豆核酸酶基因文库, 制成“鸟枪”DNA ( shotgunDNA)芯片,分析了疟原虫滋养体和配子体之间的基因表达差异,为疟原虫发育阻断剂和疫苗研究提供了有益线

基因芯片技术在疟疾动物模型研究中的应用

  动物模型在人类疟疾的病理学研究、疫苗开发和治疗试验等方面发挥着不可替代的作用,基因芯片技术与动物模型的结合,更进一步加深了人类在分子水平上对疟疾的认识。2004年Sexton等利用基因芯片分析了鼠疟原虫转录组的变化,结果发现鼠感染原虫后脑部400余基因及脾脏600余基因的转录发生了变化,这些变化

基因芯片技术在肾移植组织配型中的应用

为了比较基因芯片和特异性聚合酶链反应(PCR-SSP)两种HLA-DR分型方法,探讨适用于肾移植供、受者分型的新方法。研究者对60份肾移植供、受者的DNA样本同时采用基因芯片和PCR-SSP进行HLA-DR分型,并进行分析比较。结果60例样本的两种分型方法结果完全一致56份,相同率达93%。结果不相

基因芯片技术在司法领域的应用

基因芯片还可用于司法,现阶段可以通过DNA指纹对比来鉴定罪犯,未来可以建立全国甚至全世界的DNA指纹库,到那时以直接在犯罪现场对可能是疑犯留下来的头发、唾液、血液、精液等进行分析,并立刻与DNA罪犯指纹库系统存储的DNA“指纹”进行比较,以尽快、准确的破案。目前,科学家正着手于将生物芯片技术应用于亲

基因芯片技术在研究领域的应用

包括基因表达检测、寻找新基因、杂交测序、基因突变和多态性分析以及基因文库作图以及等方面。1、基因表达检测。人类基因组编码大约10万个不同的基因,仅掌握基因序列信息资料,要理解其基因功能是远远不够的,因此,具有监测大量mRNA(信使RNA,可简单理解为基因表达的中介物)的实验工具很重要。有关对芯片技术

特征选择在生物信息学中的应用

随着生物信息学的发展,许多模式识别技术无法满足处理大量不相关特征的需求,因此特征选择技术(FS techniques)在生物信息学中的应用就变得越来越重要了。在过去的几年里,应用特征选择技术已经从仅仅作为一个说明性的例子发展到了建立模型所需要的先决条件了。特征选择技术最重要的目的有3点:(1)避免过