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聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 无菌的过滤水乙腈乙酸铵正丁醇不含指示染料的甲酰胺凝胶加样缓冲液甲酰胺指示染料混合液甲醇:水溶液寡核苷酸洗脱缓冲液TE 溶液合成寡核苷酸粗制品仪器、耗材 MillexHV 滤器石蜡封口膜或荧光薄层层析板Sep-Pak 传统层析柱注射器紫外灯水浴加热器实验步骤 材料缓冲液和溶液稀释缓存液至适当浓度。建议使用无菌的过滤水(Milli-Q 或相当级)。乙腈毎个 Sep-PakC18 柱用 10 ml 高效液相(HPLC) 级乙腈。乙酸铵(10mol/L)每个 Sep-PakC18 柱用 2 ml 10 mmol/L 乙酸铵溶液。正丁醇不含指示染料的甲酰胺凝胶加样缓冲液凝胶加样缓冲液含有未烯释的甲酰胺,不含指示染料 [溴酚兰和(或)二甲苯蓝]。凝胶加祥缓冲液中不加指示染料,染料或染料中的污染物可以与寡梭苷酸以相同的速率移动,而干扰通过紫外光吸收对样品的检测 (见步骤 14)。如需要,可在凝胶加样缓冲液中加 0.2% ......阅读全文

聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

试剂、试剂盒无菌的过滤水乙腈乙酸铵正丁醇不含指示染料的甲酰胺凝胶加样缓冲液甲酰胺指示染料混合液甲醇:水溶液寡核苷酸洗脱缓冲液TE 溶液合成寡核苷酸粗制品仪器、耗材MillexHV 滤器石蜡封口膜或荧光薄层层析板Sep-Pak 传统层析柱注射器紫外灯水浴加热器实验步骤材料缓冲液和溶液稀释缓存液至适当浓

EMSA实验问题与解答

以下问题是以Promega公司试剂盒为例。凝胶迁移实验1)什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互

聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 无菌的过滤水 乙腈 乙酸铵 正丁醇 不含指示染料的甲酰胺凝胶加样缓冲液

GeneLink 未修饰的DNA寡核苷酸的价格表

  Gene Link寡核苷酸适用于要求苛刻的应用和一致的结果。我们认为,重视时间并且没有因寡核苷酸质量而导致实验失败的空间的研究人员应考虑使用Gene Link。我们针对每种寡核苷酸的众多质量控制步骤可确保您放心。   Gene Link Oligo合成部门不是“寡头工厂”。在合成过程中以及在通

引物合成相关问题25答

  1. 引物是如何合成的?  目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产,而Bioneer自行研制的专利384并行高通量DNA合成仪,可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不同和

25 个引物相关的问题

1.      引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产,而Bioneer自行研制的专利384并行高通量DNA合成仪,可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合

引物合成详解

  1. 引物是如何合成的?   目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产,而Bioneer自行研制的专利384并行高通量DNA合成仪,可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不

引物合成详解

  1. 引物是如何合成的?   目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产,而Bioneer自行研制的专利384并行高通量DNA合成仪,可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不

25 个引物相关的问题

1.      引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产,而Bioneer自行研制的专利384并行高通量DNA合成仪,可实现99%的高合成率。无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合

oligos纯化方法的比较

为了纯化合成的寡核苷酸,将采取方法有脱盐、BioRP、PAGE、HPLC等进行oligos纯化的工作。各种方法的侧重点不同,需根据具体实验的要求来选择最适合的纯化方法:脱盐 寡核苷酸合成后,为了纯化寡核苷酸成为天然的DNA结构,首先必须去除保护基团。通过浓氨水处理,合成的寡核苷酸从固相载体上分离

纯化方法的常见应用比较

为了纯化合成的寡核苷酸 ,将采取方法有脱盐、BioRP、PAGE、HPLC等进行oligos纯化的工作。各种方法的侧重点不同,需根据具体实验的要求来选择*适合的纯化方法: 脱盐 寡核苷酸 合成后,为了纯化寡核苷酸成为天然的DNA结构,首先必须去除保护基团。通过浓氨水处理,合成的寡核苷酸从固相载体

oligos纯化方法的比较

为了纯化合成的寡核苷酸,将采取方法有脱盐、BioRP、PAGE、HPLC等进行oligos纯化的工作。各种方法的侧重点不同,需根据具体实验的要求来选择最适合的纯化方法:  脱盐    寡核苷酸合成后,为了纯化寡核苷酸成为天然的DNA结构,首先必须去除保护基团。

利用核苷酸交换和剪切技术进行DNA碎裂和定向

利用核苷酸交换和剪切技术进行DNA碎裂和定向进化             实验材料 T4 DNA 连接

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验             试剂、试剂盒 丙烯酰胺

用大肠杆菌 Klenow 片段标记合成的寡核苷酸实验

            试剂、试剂盒 甲酰胺加样缓冲液 大肠杆菌 DNA 聚合酶 IKlenow 片段 变性聚丙烯酰胺凝胶 寡核苷酸引物

凝胶迁移实验(EMSA)——凝胶迁移

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)可以:(1)研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。实验方法原理一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初

凝胶迁移实验(EMSA)

实验方法原理 凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列

用大肠杆菌 Klenow 片段标记合成的寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 甲酰胺加样缓冲液大肠杆菌 DNA 聚合酶 IKlenow 片段变性聚丙烯酰胺凝胶寡核苷酸引物 寡核苷酸模板[α-32P]dNTP仪器、耗材 磷荧光粘贴标签水浴或模块实验步骤 材料溶液和缓冲液稀样贮存液至适当浓度。甲酰胺加样缓冲液10XKlenow 缓冲液酶与缓冲液大肠杆菌 DNA 聚合

利用核苷酸交换和剪切技术进行DNA碎裂和定向进化实验 2

3.3 酶解反应和化学切割将尿苷酸交换 PCR 纯化后的产物进行 UDG 酶解反应,在交换核苷酸位置切割 DNA。该酶对双链和单链 DNA 均有效,通过对双脱氧尿苷 C1' 位点的亲核攻击引发水解反应,高特异的去除尿嘧啶基团 [12] 。哌啶用于经 UDG 酶切割去除尿嘧啶后的骨架部分

DNA序列测定的技术和策略

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱

分子生物学常用实验技术(page 3)

分子杂交技术    互补的核苷酸序列通过Walson-Crick 碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA 分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DN

简并寡核苷酸诱变实验

本方法的一个重要特点就是将单链的简并寡核苷酸转变成同源双链分子后直接克隆进常规载体。由于不同的寡核苷酸可通过其3’末端的回文结构杂交,因此,寡核苷酸实际上起互为引物的作用,在大肠杆菌DNA聚合酶I klenow片段作用下延伸。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵 NNN'N'-四甲基乙二胺合成的互补寡核苷酸仲丁醇(2-丁醇)二乙醚 NaOAcMgCl2 乙醇TBE 甲酰胺加样缓冲液 TE仪器、耗材 SpeedVac 旋转浓缩仪实验步骤 材料与设备丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵(10%;w/v)N,

简并寡核苷酸诱变实验

实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机分光光度计实验步骤 1.  设计寡核苷酸,其3‘端含有由8个核苷酸组成的回文结构,且包含某一限制性内切酶的识别位点;如果可能的话,5’端也应有一含某个限制性内切酶位点的序列。中间区

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

试剂、试剂盒丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵NNN'N'-四甲基乙二胺合成的互补寡核苷酸仲丁醇(2-丁醇)二乙醚NaOAcMgCl2乙醇TBE甲酰胺加样缓冲液TE仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩仪实验步骤材料与设备丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵(10%;w/v)N,N,N'

简并寡核苷酸诱变实验

小段DNA序列中产生大量突变             实验材料 大肠杆菌

用大肠杆菌 Klenow 片段标记合成的寡核苷酸实验

通常利用 T4 噬菌体多核苷酸激酶催化的磷酸化反应进行寡核苷酸的标记。但有时需要标记比活度更高的放射性标记的探针,最理想的情况下,磷酸化反应中每一个寡核苷酸分子上有一个 32P 原子掺人。而用大肠杆菌 DNA 聚合酶 IKlenow 片段合成与寡核苷酸互补的一条 DNA 链,可获得更高比活

cDNA 5’末端的快速扩增(5’-RACE)

实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。实验材料 

cDNA 5’末端的快速扩增(5’-RACE)

            实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶

RNA-蛋白复合物中寡核苷酸靶向的RNaseH切割保护实验

            实验方法原理 寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物(RNP,核糖核蛋白颗粒)的方法,无论是对于粗提物还是提纯后的样品,对分析 RNP 的结构域的结构都非