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代谢组学新工具:METLIN

METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。 超过上万个代谢物 目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,到目前为止这是世界上最大的数据库。不过Siuzdak研究组的工作并不只这些,“在我们说话的这份上,METLIN也仍在增长,”文章第一作者,资深研究员Ralf Tautenhahn说,“这是一个我们所有项目都用到的关键工具”。一旦代谢物被确定,研究人员就可以开始分析它在身体和疾病中如何发挥作用。 这个数据库的一个关键优势在于,它超越了基本分子重量――不同的化合物可能具有相同的分子量,串联质谱数据能以更高可信度,识别这些生物系统中的分子,这还包含了气体分子轰击的单个化合物,前者能是后者以独特的方式分离。而产生的分子碎片重量则能为......阅读全文

代谢组学新工具:METLIN

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   超过上万个代谢物   目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,

我国首次发布海洋化合物数据库

3日,在青岛举行的“2018年全球海洋院所领导人会议”上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗发布了海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库。这是我国首次正式发布海洋化合物数据库。 管华诗表示,海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结

我国首次发布海洋化合物数据库

昨日,在青岛举行的“2018年全球海洋院所领导人会议”上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗发布了海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库。这是我国首次正式发布海洋化合物数据库。 管华诗表示,海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结

加拿大建成首个人类小分子代谢物数据库

  加拿大阿尔伯塔大学的研究小组日前宣布,他们建成了世界上首个人类小分子代谢物组数据库。专家认为,这将对许多传染病、遗传病或环境引发的疾病的诊断、预防和监测产生重大影响。   人类小分子代谢物组是所有人体内产生的小分子代谢物的总称,是化学意义上的“人类基因组”。科学家认为,如果说人类基因组描绘了生

布鲁克最新发布 | 4D-代谢组学和4D-脂质组学新突破

  新型VIP-HESI离子源将4D-代谢组学、4D-脂质组学和小分子定量筛选工作流程的灵敏度提高了10倍以上;  数据库全新发布包含CCS值的代谢物数据库METLIN-4D;  数据处理软件集成了代谢物CCS值预测功能CCS-Predict Pro;  新款代谢组学软件MetaboScape 20

岛津推出简化GC-MS/ MS方法开发的智能数据库系列

  2015年6月24日-马里兰州哥伦比亚市(华美)。岛津科学仪器公司发布其新的智能GCMS数据库系列。该系列产品是独立的数据库,可用于分析农药、法医毒理学物质、代谢物和环境污染物。每个数据库包括数百个相关化合物,并且具有优化的过渡和碰撞能量、CAS登记号和保留指数(RI)。该软件系列支持GC-MS

沃特世发布用于离子迁移谱代谢物分析的参考数据库

  分析测试百科网讯 2016年6月6日,沃特世在第ASMS2016上推出用于离子迁移质谱研究的代谢物分析参考数据库Metabolic Profiling CCS Library。该Metabolic Profiling CCS Library包括900多个碰撞截面(CCS)值,该数值主要是测量气相

液相色谱仪的行业应用

 液相色谱仪用于生物制药    液相色谱(LC)/质谱(MS)分析仪器、色谱柱化学分析、软件以及至关重要的应用技术,广泛应用于生物制药分析领域。     液相色谱仪用于精细及专用化学品    LC/ MS/GC系统能够提供化合物检定、处理复杂分析的特异性。包括液相色谱、质谱、色谱柱、样品制备化学、信

第56届ASMS安捷伦推出多款质谱新品

安捷伦推出多款质谱新品- 气相/三重串联四极杆质谱;超高灵敏度的液相/三重串联四极杆质谱仪;高灵敏度的四极杆-飞行时间串联质谱仪;全新代谢物物谱库和软件平台 2008年6月2日,在美国丹佛举办的第56届美国质谱协会年会上(ASMS)上,安捷伦科技隆重推出多款质谱产品及软件,包括全新的7000A型

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD