就这样做轻松搞定实时PCR探针设计
除了为克隆基因、预测编码蛋白而需要研究基因的构成外，当前在基因组学上的努力也包括对基因组构成的研究，以分析具有结构和调控因子插入的基因。近源物种分析成为比较基因组学的主要内容，被认为是研究进化、基因功能和人类疾病的重要方法。 利用该方法分析微生物，特别是细菌的基因组，早在 1996 年就已开始识别出细菌中的保守基因和与亚种相关的毒性基因（Fredricks and Reiman 1996)。这方面的进展促生了新的、大规模的检测和识别致病菌的方法。近源种 PCR 可以用来研究进化上相关的种，它们在基因组上有一 些共同的特点，这些保守的区域可被用于在基因组水平识别新种。还可以用该技术在尚未测序的物种的基因组中扩增同源基因。 设计策略 根据多元序列比较和引物设计的一般规律来设计近源种 PCR 引物。通过比较少数几个大的相近序列识别出保守区域，这些区域即是近源种引物的可能结合位点。近源种的比较需要对少数大的相近序列......阅读全文
实时定量PCR探针概述
实时定量PCR (qPCR)的优势•实时检测PCR反应过程•精确计算出每个循环的PCR产物量•扩增和检测同时进行•消除后续PCR的干扰在实时定量PCR反应中，杂交探针与插入染料如SYBR Green相比是更好的选择。荧光标记探针可以提高实时定量PCR结果的效率、灵敏度和特异性。而且定量PCR可以在一
PCR扩增标记法探针标记
PCR扩增标记法探针标记 PCR扩增标记法的原理与普通的核酸PCR相同。即Taq DNA多聚酶以DNA为模板，在特异引物引导下，在PCR仪中合成cDNA探针。由于在反应体系中加入一定量的标记dNTP，因此扩增的同时又是一个标记过程。cDNA探针PCR扩增法标记原理
pcr荧光探针法是什么
实时定量聚合酶链反应 (Quantitative Real-time PCR，qPCR) 是一种分子生物学技术，用于放大和同时检测或量化靶向 DNA 分子。程序遵循 PCR 的一般原则。在 PCR 反应过程中，随着循环次数的增加，PCR 产物的积累导致荧光信号的增强。因此，通过监测荧光强度，在"实时
PCR扩增制备带标记探针
实验概要用标记脱氧单核苷酸部分代替PCR反应体系中的脱氧核苷酸（一般是带标记的dUTP代替dTTP），经PCR扩增后标记基团随机搀入扩增产物－DNA探针中。这样使探针浓度高，可检测标记基团量多，灵敏度高，与缺口平移法制备探针相比，具有方便简捷的特点，并且由于具高灵敏度因此在检测低丰度，低拷贝数的目的
PCR技术中探针是什么
26.基因探针可以是DNA双链、DNA单链或RNA单链，但探针的核苷酸序列是已知的（如测某人是否患镰刀型贫血症），则探针是放射性同位素标记或荧光标记的镰刀型贫血症患者的DNA作为探针。
pcr荧光探针法是什么
pcr荧光探针法是是SYBRGreen掺入到双链DNA中的量。SYBRGreen掺入到双链DNA中后会发出荧光。但是只要是双链，它都掺。而探针法是当探针结合到目标序列上以后，聚合酶降解探针后，探针上自带的荧光基团离开淬灭基团，从而发出荧光。
定量PCR－Taqman探针设计要领1
自90年代Taqman探针诞生以来，虽然荧光探针（引物）不断有新的技术出现，但是作为一种经典的定量PCR技术，Taqman探针技术仍然是许多实验研究人员进行定量检测的首选，这主要是因为相对于SYBR荧光染料，Taqman探针具有序列特异性，只结合到互补区，而且荧光信号与扩增的拷贝数具有一一对应的关系
定量PCR－Taqman探针设计要领2
第三步：寻找一家信赖的公司合成引物和探针，一般引物合成大家比较熟悉，而且价格也比较便宜（特别是这两年便宜了许多），而探针则相对来说贵了许多，一般 Taqman探针合成在1000到5000元不等（不同的合成要求价钱不同）——而这只是标记价钱，序列合成基本上和引物合成价钱相似。 第四、五、六步：一般
荧光PCR法与PCR荧光探针法有何不同
荧光定量PCR法检测的是SYBR Green掺入到双链DNA中的量。SYBR Green掺入到双链DNA中后会发出荧光。但是只要是双链，它都掺。而探针法是当探针结合到目标序列上以后，聚合酶降解探针后，探针上自带的荧光基团离开淬灭基团，从而发出荧光。从两者的原理上来看，不难判断，荧光PCR法更加简单方
荧光PCR法与PCR荧光探针法有何不同
荧光定量PCR法检测的是SYBR Green掺入到双链DNA中的量。SYBR Green掺入到双链DNA中后会发出荧光。但是只要是双链，它都掺。而探针法是当探针结合到目标序列上以后，聚合酶降解探针后，探针上自带的荧光基团离开淬灭基团，从而发出荧光。从两者的原理上来看，不难判断，荧光PCR法更加简单方
realtime－PCR－常用仪器和探针
1.SYBR Green I：一种DNA结合染料，能非特异性地与双链DNA结合，结合后发出荧光，价格便宜，但因无特异性，易受到非特异性扩增和引物二聚体地的影响，是定量结果不可靠。可用融解曲线分析区分特异性和非特异性扩增，引物的设计和反应条件的优化对消除非特异性荧光有很大帮助。2.Taqman探针：
realtime－PCR－常用仪器和探针
SYBR Green I：一种DNA结合染料，能非特异性地与双链DNA结合，结合后发出荧光，价格便宜，但因无特异性，易受到非特异性扩增和引物二聚体地的影响，是定量结果不可靠。可用融解曲线分析区分特异性和非特异性扩增，引物的设计和反应条件的优化对消除非特异性荧光有很大帮助。 2.Taqman探针：
荧光pcr探针室温放置会降解吗
实时定量PCR是通过产物发出荧光,根据荧光强度来定量的.激发荧光的方式有荧光染料法和探针法.荧光探针比荧光染料更具特异性,可检测特定序列的扩增产物的量.荧光染料可以检测PCR中获得的全部双链DNA,但不能区分不同的双链DNA.可以说荧光PCR包括探针法和染料法不建议这么做,pcr产物的话大部分的都会
解决荧光定量PCR引物探针问题
荧光实时定量 PCR 技术 (real-time quantitative PCR，qPCR) 几乎是现代分子生物学技术中最重要、应用最广泛的核酸定量检测技术。成功的定量 PCR 实验离不开精准的实验设计和操作流程。 实时荧光定量 PCR 分析的部分实施需要经过优化以确保所有反应参数均设置精确
常用DAN探针制备的方法介绍PCR－标记
PCR 技术是1985年 KarryMullis 等首先创建的可在体外迅速、大量地扩增一定长度的核苷酸序列的技术。PCR问世以来已广泛应用于分子生物学研究和疾病诊断中。此技术还应用于核酸探针的制备。Girgsi 等(1988)应用 PCR 从多序列制备了 DNA 探针。Shcow-aletr 和 S
就这样做－轻松搞定实时－PCR－探针设计
除了为克隆基因、预测编码蛋白而需要研究基因的构成外，当前在基因组学上的努力也包括对基因组构成的研究，以分析具有结构和调控因子插入的基因。近源物种分析成为比较基因组学的主要内容，被认为是研究进化、基因功能和人类疾病的重要方法。 利用该方法分析微生物，特别是细菌的基因组，早在 1996 年就已开始
双重荧光定量PCR探针荧光基团该怎么选择
有干扰的话，在仪器上面就可以看出来，比如说，FAM和VIC，FAM有信号，单独看VIC也肯定有信号，只是低点而已
探针法荧光定量pcr－荧光值要达到多少
定量PCR有绝对定量跟相对定量，绝对定量就是先用已知浓度的质粒浓度梯度(1.00E+07、1.00E+06、1.00E+05、1.00E+04、1.00E+03)制作标准曲线，然后通过做Real-timePCR的CT值计算出其表达量;相对定量是比较管家基因(GAPDH)与目的基因的CT值，得出各标本
荧光定量PCR引物探针的设计总体原则
1. 先选择好探针，然后设计引物使其尽可能的靠近探针。 2. 所选序列应该高度特异，尽量选择具有最小二级结构的扩增片段——这是因为二级结构会影响反应效率，而且还会阻碍酶的扩增。建议先进行二级结构检测，如果不能避免二级结构，那么就要相应提高退火温度。 3. 扩增长度应不超过400bp，理想
详细解析实时荧光定量PCR探针法技术原理
目前主流的实时荧光定量PCR （Quantitative Real-time PCR）方法分为染料法和探针法，染料法以SYBR Green法为代表，SYBR Green染料游离时荧光微弱，但但一旦与双链DNA结合后，荧光大大增强，反应管中的荧光强度与反应管中双链DNA的数量成正比例关系，因此荧光定量
PCR荧光标记选择探针法还是染料法？
特异性荧光标记——探针法： 是目前临床最常用的方法，在加入一对引物的同时再加入一对探针，特异性好，这里列举的是TaqMan水解探针：一段与靶基因特异性结合的序列，分别在5’端加入荧光报告基团，3’端加入荧光淬灭基团。其核心是利用taq酶的5’-3’外切酶活性切断探针，使得使荧光报告基团和荧
NACIA数字PCR引物探针设计——Geneπ课堂
NACIA数字PCR用引物与普通PCR引物设计要求不同：普通PCR的目的是获得目的基因，对非特异性反应和引物二聚体要求不严格；而数字PCR引物跟real-time PCR引物一样对非特异性反应和引物二聚体要求严格。NACIA数字PCR引物及探针设计的总体原则v 先选择好探针，然后设计引物使其尽可能的
实时荧光定量－PCR－所用荧光探针及功能介绍
应用于实时定量 PCR 检测体系中的荧光探针主要有两种:一种是 TaqMan 探针,一种是分子信标探针。Tyagi 和 Krammer(1996)首次建立了分子信标探针,在同一寡核苷酸探针的5'端标记荧光素、3'端标记淬灭剂(DABCYL)分子信标探针能形成发夹结构,探针的噜扑环(L
荧光探针和荧光染料对于PCR技术的区别
1. TaqMan荧光探针：PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针，该探针为一寡核苷酸，两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收；PCR扩增时，Taq酶的5'－3'外切酶活性将探针酶切降解，使报告荧光基团和淬灭
HLA基因分型方法：PCR－SSO（ASO）探针法
PCR－SSO（ASO）探针法1）常规提取DNA参见RFLP法 2）PCR扩增参见PCR-RFLP法 3）斑点杂交1．将5～20μl扩增产物，加变性液100～200μl室温处理5～15min。2．在尼龙滤膜（预先用2×SSC浸湿2min）上真空点样，每孔以10×SSPE 200μl冲洗，抽干，80℃
染料法和探针法PCR检测有什么区别
简单来说，染料法是相对定量，有参比基团；探针法是绝对定量，有标准曲线进行对比。很多在做pcr检测时会选择盒子，比较盒子的好坏，例如BIODAI,ABI，罗氏等，染料法不仅要看CT 值，还要看溶解曲线的。
pcr试剂盒中的引物和探针有毒或者有害么
prR的引物一般是RNA（单链）,而探针是已知碱基序列的dna或rna
新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见（三）
4、二聚体设计时通常将二聚体（自身二聚体或配对二聚体）控制在dG>-5.0kc/m, 最好dG>-3.6 kc/m。从图8显示的三套引物探针的自身二聚体可见，第二套的探针具有一个非常稳定的自身二聚体（dG=-13.1kc/m），第二套的上游引物N2F有一个稳定的自身二聚体（dG=-9.3k
新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见（二）
1、引物探针的位置引物探针的设计原则中，最重要的是要避免假阴性（漏检），同时保证特异性（避免假阳性），所以要选择组内（需要检出的序列）保守（即尽量避开突变或采用简并序列）、组间（对照序列）特异的区域。此外，为了获得最佳的扩增效果，还应尽量满足表1中的基本要求。用SARS和蝙蝠CoV的N基因序列作为对
新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见（一）
新型冠状病毒疫情爆发以后，早期诊断成为控制疫情的关键，而荧光PCR技术成为首选的初筛检测手段。目前核酸检测率只有30-40%，使得检测试剂盒的灵敏度备受关注。本期推荐林镜中博士从引物探针设计的角度对试剂盒灵敏度的分析，以飨读者。一、前言新型冠状病毒疫情爆发以后，早期诊断成为控制疫情的关键，而荧光PC